| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 92,854 | (GCG)4→3 | coding (1442‑1444/1767 nt) | ftsI → | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 92844 | 92846 | 3 | 26 [0] | [0] 27 | ftsI | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 92847 = | 0 (0.000) | 24 (1.010) | 23/78 | 0.0 | 100% | coding (1435/1767 nt) | ftsI | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| ? | NC_000913 | = 92843 | 0 (0.000) | coding (1431/1767 nt) | ftsI | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI | |||||
CGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/92904‑92847‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgccgccTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATG < NC_000913/92843‑92798 CGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACG < 1:1065419/50‑1 GTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCC < 1:949316/50‑1 GTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCC < 1:112787/50‑1 TTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCT < 1:621840/50‑1 TTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGG > 1:94321/1‑50 TTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTG < 1:1873678/49‑1 AATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGT < 1:2065756/49‑1 AATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGG > 1:1566523/1‑48 ATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAG > 1:523673/1‑50 GGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCG > 1:2136632/1‑50 GCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGC > 1:353181/1‑50 CGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCT > 1:1459949/1‑50 CGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGC < 1:362642/49‑1 ATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTT < 1:1735112/50‑1 GCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCA > 1:1063927/1‑50 CTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCAT > 1:643415/1‑49 TTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCA > 1:986665/1‑50 TTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCA > 1:1243900/1‑49 AATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATAT > 1:1873132/1‑50 AATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATAT > 1:611741/1‑50 AATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATA < 1:276402/49‑1 ATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATG < 1:187021/50‑1 ATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATAT < 1:478064/49‑1 GCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCA < 1:1041724/49‑1 CCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCAC > 1:1470850/1‑49 CACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGC > 1:1655115/1‑50 CACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTG < 1:1927075/49‑1 GCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAA > 1:154152/1‑50 GCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATG > 1:1320319/1‑49 CGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/92904‑92847‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgccgccTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATG < NC_000913/92843‑92798 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |