| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 92,854 | (GCG)4→3 | coding (1442‑1444/1767 nt) | ftsI → | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 92844 | 92846 | 3 | 23 [0] | [0] 23 | ftsI | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 92847 = | 0 (0.000) | 18 (0.830) | 18/78 | 0.1 | 100% | coding (1435/1767 nt) | ftsI | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| ? | NC_000913 | = 92843 | 0 (0.000) | coding (1431/1767 nt) | ftsI | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI | |||||
GCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/92905‑92847‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgccgccTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGAT < NC_000913/92843‑92795 GCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCAC > 1:457997/1‑50GCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCAC < 1:1527276/50‑1 GTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCC < 1:1981187/50‑1 GTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCC < 1:1871827/50‑1 TACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCG < 1:437386/50‑1 CCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCC > 1:1977107/1‑50 CCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGC < 1:1269127/49‑1 TTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCT < 1:1733127/50‑1 TTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTG > 1:1681788/1‑50 TTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTG < 1:829473/49‑1 TAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGG < 1:43959/49‑1 ATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAG < 1:1009946/50‑1 ATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTA < 1:2031079/49‑1 CGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGC > 1:1971813/1‑49 ATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCAC < 1:746076/50‑1 TACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACG > 1:827711/1‑50 ATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTT > 1:2076337/1‑50 TAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTC > 1:1734540/1‑50 TAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTC < 1:1868390/50‑1 GCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCC < 1:1309943/49‑1 TTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCA > 1:2340849/1‑50 TAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCA < 1:2277147/48‑1 ATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATG > 1:949566/1‑50 CCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACA < 1:1007278/50‑1 TCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTG > 1:1322646/1‑50 CGCCGCCGCCTGGTAGCGCCATGCTTTCCATCATATGCACCACAGCGCG > 1:1466164/1‑49 GCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGA > 1:1014093/1‑50 GCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAA > 1:318965/1‑50 GCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAA < 1:801058/50‑1 CTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGAT < 1:1475437/50‑1 GCGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/92905‑92847‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgccgccTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGACAATGGAT < NC_000913/92843‑92795 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |