| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1994264 = | 34 (0.920) | 61 (2.350) +ATTTCTAATGTCGT |
4/68 | 1.9 | 70.1% | coding (443/1833 nt) | uvrC | excision nuclease subunit C |
| ? | NC_000913 | 3208976 = | 40 (1.080) | coding (953/1464 nt) | ttdT | L‑tartrate:succinate antiporter | |||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
GGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAA > NC_000913/3208930‑3209024 | ggcggTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCAc < 1:1389704/49‑1 (MQ=255) gTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAt < 1:1680219/49‑1 (MQ=255) gTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAt > 1:123303/1‑49 (MQ=255) tGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAtg < 1:2025435/49‑1 (MQ=255) aTTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAtgct < 1:2853000/49‑1 (MQ=255) aTTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGAtgct < 1:2833196/49‑1 (MQ=255) tatCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATgctgct < 1:291764/48‑1 (MQ=255) attggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCtt > 1:107451‑M2/36‑49 (MQ=255) attggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCtt > 1:401520‑M2/36‑49 (MQ=255) attggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCtt > 1:2862191‑M2/36‑49 (MQ=255) attggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCtt > 1:2460130‑M2/36‑49 (MQ=255) attggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCtt > 1:63905‑M2/36‑49 (MQ=255) ttggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGGTGCTGCTTc < 1:1508120‑M2/15‑1 (MQ=255) ttggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCtt < 1:2279492‑M2/14‑1 (MQ=255) ttggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCtt < 1:1873154‑M2/14‑1 (MQ=255) ttggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTc < 1:1656517‑M2/15‑1 (MQ=255) ttggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTc < 1:1624381‑M2/15‑1 (MQ=255) ttggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTc < 1:1755402‑M2/15‑1 (MQ=255) ttggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTc < 1:1365401‑M2/15‑1 (MQ=255) ttggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTc < 1:2635649‑M2/15‑1 (MQ=255) ttggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTc < 1:1379525‑M2/15‑1 (MQ=255) ttggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTc < 1:118344‑M2/15‑1 (MQ=255) ttggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTc < 1:2271994‑M2/15‑1 (MQ=255) tggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt > 1:1689812‑M2/34‑49 (MQ=255) tggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt > 1:2600796‑M2/34‑49 (MQ=255) tggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt > 1:570215‑M2/34‑49 (MQ=255) tggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt > 1:2335596‑M2/34‑49 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt < 1:2505294‑M2/16‑1 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt < 1:231667‑M2/16‑1 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt < 1:2151028‑M2/16‑1 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt < 1:2829513‑M2/16‑1 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt < 1:2734160‑M2/16‑1 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt < 1:2608690‑M2/16‑1 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt < 1:1385526‑M2/16‑1 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCt < 1:1238472‑M2/16‑1 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg > 1:1737379‑M2/33‑49 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg > 1:918870‑M2/33‑49 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg > 1:8356‑M2/33‑49 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg > 1:2063760‑M2/33‑49 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg > 1:1223841‑M2/33‑49 (MQ=255) ggcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg > 1:590669‑M2/33‑49 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCtgg > 1:2729720‑M2/32‑48 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCtgg > 1:1394366‑M2/32‑48 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCtgg < 1:1756029‑M2/18‑2 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCtgg > 1:1514396‑M2/32‑48 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg < 1:1924371‑M2/17‑1 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg < 1:202124‑M2/17‑1 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg < 1:2051081‑M2/17‑1 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg < 1:390140‑M2/17‑1 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg < 1:1090524‑M2/17‑1 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg < 1:2335916‑M2/17‑1 (MQ=255) gcgctactgcaaaggatattgctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTCTg < 1:1752754‑M2/17‑1 (MQ=255) gATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTgc < 1:1210786/49‑1 (MQ=255) gATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTgc < 1:1068325/49‑1 (MQ=255) gATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTg < 1:926606/48‑1 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt > 1:2806816‑M2/31‑47 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt < 1:2050834‑M2/19‑3 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt < 1:2768098‑M2/19‑3 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt < 1:817492‑M2/19‑3 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt < 1:2423041‑M2/19‑3 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt > 1:2433072‑M2/31‑47 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt < 1:438119‑M2/19‑3 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt > 1:467636‑M2/31‑47 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt < 1:2559768‑M2/19‑3 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt < 1:2573104‑M2/19‑3 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt < 1:2841103‑M2/19‑3 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt < 1:526412‑M2/19‑3 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt < 1:1653794‑M2/19‑3 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt < 1:1584510‑M2/19‑3 (MQ=255) cgctactgcaaaggatatttctaatgtcgtCACTGATGCTGCTTctggt < 1:1196881‑M2/19‑3 (MQ=255) cgcgATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCAt > 1:2190677/1‑48 (MQ=255) cgcgATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCAt > 1:2362972/1‑48 (MQ=255) gATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTAt > 1:62333/1‑48 (MQ=255) gATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTAt > 1:2017017/1‑48 (MQ=255) gATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTAt > 1:2308963/1‑48 (MQ=255) gATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATc < 1:1043251/49‑1 (MQ=255) aTGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCa < 1:1882919/49‑1 (MQ=255) ggTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGt > 1:258717/1‑49 (MQ=255) gTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGtt > 1:1176972/1‑49 (MQ=255) gTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGt < 1:694251/48‑1 (MQ=255) gTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGt < 1:1314700/48‑1 (MQ=255) tCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTg < 1:2108776/49‑1 (MQ=255) ggTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTggg < 1:942646/49‑1 (MQ=255) ggTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTgg > 1:2077266/1‑48 (MQ=255) ggTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTgg > 1:1661140/1‑48 (MQ=255) ttACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGgac > 1:2117981/1‑49 (MQ=255) tACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGgac > 1:112350/1‑48 (MQ=255) tACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGgac > 1:2011508/1‑48 (MQ=255) gCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACAt < 1:990998/49‑1 (MQ=255) gCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACAt < 1:1036596/49‑1 (MQ=255) gCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACAt < 1:2368760/49‑1 (MQ=255) gtggtgGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTg > 1:2577683/1‑49 (MQ=255) ggtggCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGt > 1:1929512/1‑48 (MQ=255) gtggCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTc < 1:1388814/48‑1 (MQ=255) tggCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAg > 1:454257/1‑49 (MQ=255) tggCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAg > 1:1056507/1‑49 (MQ=255) tggCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAg < 1:2841741/49‑1 (MQ=255) gCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGt < 1:638679/48‑1 (MQ=255) gCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGt > 1:1392442/1‑48 (MQ=255) cACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGtaa < 1:2361281/49‑1 (MQ=255) | GGCGGTGATTATATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAA > NC_000913/3208930‑3209024 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |