| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 92,854 | (GCG)4→3 | coding (1442‑1444/1767 nt) | ftsI → | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 92844 | 92846 | 3 | 25 [0] | [0] 25 | ftsI | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 92847 = | 0 (0.000) | 23 (1.080) | 18/76 | 0.1 | 100% | coding (1435/1767 nt) | ftsI | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| ? | NC_000913 | = 92843 | 0 (0.000) | coding (1431/1767 nt) | ftsI | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI | |||||
CGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/92904‑92847‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgccgccTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGAC < NC_000913/92843‑92802 CGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCAC < 1:725293/49‑1 GGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACG > 1:1779339/1‑49 GTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGC < 1:1040735/49‑1 GTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGC < 1:712833/49‑1 TACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCC < 1:171283/49‑1 CCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGC > 1:1364576/1‑49 CGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCC < 1:1260845/49‑1 GGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCG > 1:1420152/1‑49 GTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGC > 1:1686036/1‑49 TTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCC < 1:1106525/49‑1 TTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCT > 1:1724717/1‑49 TAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGG > 1:1902072/1‑49 ATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGT < 1:1440173/48‑1 GCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGC < 1:814020/48‑1 CGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGC > 1:891259/1‑49 CGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGC > 1:1921122/1‑49 ATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCA < 1:1447003/49‑1 TACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCAC < 1:684887/49‑1 TACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCAC < 1:1741776/49‑1 TACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCAC < 1:1068097/49‑1 TACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCAC < 1:1114124/49‑1 TAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTT > 1:1135301/1‑49 CTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCAT > 1:1591160/1‑49 TTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCAT > 1:1338820/1‑48 TTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCA > 1:1177836/1‑49 AATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATA > 1:1267974/1‑49 ATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATAT > 1:1412313/1‑49 TCGCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATG < 1:835851/49‑1 GCCGCCTTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGC < 1:455091/48‑1 TTCACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAG > 1:16194/1‑49 CACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTG > 1:1566601/1‑49 CACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTG > 1:506200/1‑49 CACGCCGCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGT < 1:1823989/48‑1 GCCGCCTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGAC > 1:1134229/1‑48 CGGTACCGGTTTTAATGGCGATACGATAGCCTTTAATCGCCGCCTTCACGCCGCCGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/92904‑92847‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgccgccTGGTAGCGCCACGCTTTCCATCATATGCACCACAGTGCGGAC < NC_000913/92843‑92802 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |