Missing coverage evidence...
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CTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACAC  >  NC_000913/3423641‑3423709                                                  |                    cTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGTCAGTTCCCTACtctc                     <  1:3735692/50‑1 (MQ=255) cTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACtctc                     >  1:3909517/1‑50 (MQ=255) cTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACtctc                     <  1:2048816/50‑1 (MQ=255) cTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACtctc                     >  1:6245856/1‑50 (MQ=255) cTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACtctc                     <  1:2699385/50‑1 (MQ=255)  tGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCg                    >  1:1741849/1‑50 (MQ=255)   gAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCg                    >  1:129760/1‑49 (MQ=255)    aGCCATATCAGCTCGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCa                  <  1:1359091/50‑1 (MQ=255)    aGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCg                    <  1:2820171/48‑1 (MQ=255)    aGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGc                   <  1:5785233/49‑1 (MQ=255)    aGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGc                   <  1:5692189/49‑1 (MQ=255)    aGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGc                   <  1:1816782/49‑1 (MQ=255)    aGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCa                  <  1:227934/50‑1 (MQ=255)     gCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCAt                 <  1:2142693/50‑1 (MQ=255)     gCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCAt                 <  1:3883080/50‑1 (MQ=255)     gCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCAt                 <  1:5455670/50‑1 (MQ=255)      ccATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATg                >  1:547466/1‑50 (MQ=255)      ccATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATg                <  1:1410188/50‑1 (MQ=255)       cATATCAGCACGGTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATgg               <  1:2930396/50‑1 (MQ=255)        atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCCTggg              >  1:3943620/1‑50 (MQ=255)        atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:316499/1‑50 (MQ=255)        atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:3400638/1‑50 (MQ=255)        atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:4038183/1‑50 (MQ=255)        atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              <  1:5109920/50‑1 (MQ=255)         tatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATgggg             <  1:667977/50‑1 (MQ=255)         tatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:2513944/1‑49 (MQ=255)           tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:4961322/1‑47 (MQ=255)           tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:4717195/1‑47 (MQ=255)           tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGga            <  1:4418307/49‑1 (MQ=255)            cAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgaga          >  1:2852029/1‑50 (MQ=255)            cAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgaga          >  1:6193773/1‑50 (MQ=255)            cAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgaga          >  1:1664329/1‑50 (MQ=255)              gCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAcc        <  1:300300/50‑1 (MQ=255)                   cTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcaca   >  1:3666901/1‑50 (MQ=38)                     aaaTTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCacac  >  1:4749421/1‑49 (MQ=32)                                                  |                    CTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACAC  >  NC_000913/3423641‑3423709

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑