Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NC_000913	3423691–3424234	3428516–3424653	420–4826	35 [30]	[27] 31	[rrfD]–[rrsD]	[rrfD],rrlD,alaU,ileU,[rrsD]

ACCAACAAGCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTCCCCCTCT  >  NC_000913/3428507‑3428566           |                                                  accaACAAGCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAgg            >  1:1689884/1‑50 (MQ=35) accaACAAGCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAgg            <  1:1958738/50‑1 (MQ=35) accaACAAGCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAgg            >  1:2050143/1‑50 (MQ=35)  ccaACAAGCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAggg           <  1:886421/50‑1 (MQ=38)  ccaACAAGCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAggg           <  1:4903347/50‑1 (MQ=38)  ccaACAAGCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAggg           >  1:3550965/1‑50 (MQ=38)  ccaACAAGCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAggg           >  1:2023011/1‑50 (MQ=38)  ccaACAAGCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCAGAggg           >  1:5668226/1‑50 (MQ=255)   caacaaGCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGt          >  1:3235511/1‑50 (MQ=38)    aacaaGCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTc         <  1:4370567/50‑1 (MQ=38)    aacaaGCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTc         <  1:6105104/50‑1 (MQ=38)    aacaaGCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTc         >  1:4448342/1‑50 (MQ=38)    aacaaGCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTc         <  1:4061603/50‑1 (MQ=38)    aacaaGCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTc         >  1:3032697/1‑50 (MQ=38)     acaaGCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTcc        >  1:5459275/1‑50 (MQ=38)     acaaGCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTcc        <  1:5681103/50‑1 (MQ=38)      caaGCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTccc       >  1:707895/1‑50 (MQ=38)      caaGCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTccc       >  1:3237634/1‑50 (MQ=38)      caaGCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTccc       <  1:2331040/50‑1 (MQ=38)      caaGCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTccc       <  1:2176661/50‑1 (MQ=38)       aaGCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTcccc      >  1:701724/1‑50 (MQ=38)       aaGCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTcccc      <  1:6684551/50‑1 (MQ=38)       aaGCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTcccc      <  1:5296642/50‑1 (MQ=38)         gCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTCCCCct    <  1:2004312/50‑1 (MQ=38)         gCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTCCCCct    >  1:5513686/1‑50 (MQ=38)          cTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTCCCCctc   >  1:1116118/1‑50 (MQ=38)          cTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTCCCCctc   >  1:4807285/1‑50 (MQ=38)           tAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTCCCCctct  >  1:6551710/1‑50 (MQ=38)           tAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTCCCCctct  >  1:1843357/1‑50 (MQ=38)           tAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTCCCCctct  >  1:3669135/1‑50 (MQ=38)           tAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTCCCCctct  >  1:2560328/1‑50 (MQ=38)           |                                                  ACCAACAAGCTAATCCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTCCCCCTCT  >  NC_000913/3428507‑3428566

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑