| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 603,467 | Δ5,885 bp | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG], nfsB, ybdF, ybdJ, ybdK, sokE, hokE, insL‑2 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 603467 | 609351 | 5885 | 108 [0] | [0] 112 | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG],nfsB,ybdF,ybdJ,ybdK,sokE,hokE,insL‑2 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 603466 | 0 (0.000) | 102 (0.980) | 64/94 | 0.0 | 100% | coding (1198/1248 nt) | ybdG | miniconductance mechanosensitive channel YbdG |
| ? | NC_000913 | 609352 = | 0 (0.000) | intergenic (+175/+107) | insL‑2/entD | IS186/IS421 transposase/phosphopantetheinyl transferase EntD | |||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
TTACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/603416‑603466‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCT > NC_000913/609352‑609400 TTACTGCTTAAATGCCCCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCG < 1:1937746/50‑1 ACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAG > 1:5061101/1‑50 ACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGA < 1:4998687/49‑1 CTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGT < 1:1913743/50‑1 CTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAG < 1:3003188/49‑1 GCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAA > 1:1424662/1‑50 GCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAA > 1:1442125/1‑50 GCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAA > 1:4706951/1‑50 GCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAA > 1:4254122/1‑50 CTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAAT > 1:7731702/1‑50 CTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAA < 1:7600091/49‑1 CTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAA < 1:3058049/49‑1 CTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTA < 1:1015145/48‑1 TTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATC > 1:1432040/1‑50 TTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATC > 1:4463777/1‑50 TAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCC > 1:5598405/1‑50 AAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCC > 1:6355710/1‑50 AAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCC > 1:215441/1‑50 AAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCC < 1:8149063/49‑1 AAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATC < 1:6034869/48‑1 AAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATC < 1:6896753/48‑1 AATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCC < 1:3562994/50‑1 AATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCC < 1:4525699/49‑1 ATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCG < 1:3524218/50‑1 ATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCG < 1:6909173/50‑1 TGCCCCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGC < 1:3204367/50‑1 CACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCA > 1:7138025/1‑49 ACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATA > 1:5738890/1‑50 CCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATAT < 1:7535182/50‑1 CCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATC < 1:3836219/50‑1 CCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATC > 1:2722282/1‑50 CGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCC > 1:4550061/1‑50 CGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCC > 1:211171/1‑50 GCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCG < 1:5052701/50‑1 GCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCG < 1:6346799/50‑1 CAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGT > 1:1224610/1‑50 AGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTT < 1:5570555/50‑1 AGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGT > 1:4787075/1‑50 AGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGT < 1:2706081/50‑1 GAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTC < 1:1541876/50‑1 GAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTC < 1:5988948/50‑1 GAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTC < 1:7339975/50‑1 GAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGT > 1:2142149/1‑49 GAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGT > 1:2068500/1‑49 GAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGT > 1:4259674/1‑49 AGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCA < 1:28782/50‑1 AGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGT > 1:5588297/1‑48 AGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGT > 1:1695878/1‑48 GCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAG < 1:6278458/50‑1 GCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAG < 1:8098463/50‑1 GCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAG < 1:4373302/50‑1 CGAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGG > 1:3508311/1‑50 GAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGT > 1:7335216/1‑50 GAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGT < 1:2905133/50‑1 GAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGT > 1:2754816/1‑50 GAATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGT > 1:196738/1‑50 AATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTC < 1:2350321/50‑1 AATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGT > 1:3431960/1‑49 AATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGT > 1:235182/1‑49 ATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCA < 1:6369491/50‑1 ATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCA < 1:1108883/50‑1 ATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGT > 1:5146463/1‑48 ATATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGT > 1:7305176/1‑48 TATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAG > 1:6934780/1‑50 TATCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAG < 1:8286293/50‑1 TCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGA < 1:3495303/50‑1 TCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGA < 1:3716072/50‑1 TCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGG < 1:777542/49‑1 TCATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGG < 1:1630106/49‑1 CATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAT > 1:7042654/1‑50 ATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATG < 1:7676891/50‑1 ATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATG < 1:3947778/50‑1 ATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATG > 1:3795337/1‑50 ATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATG < 1:5427901/50‑1 ATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATG > 1:6704663/1‑50 ATTGCCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATG > 1:1261010/1‑50 CCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAA < 1:4189075/50‑1 CCGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTA < 1:3512201/49‑1 CGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAG > 1:853728/1‑50 CGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAG > 1:5375299/1‑50 CGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAG > 1:2103091/1‑50 CGGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAG < 1:5220399/50‑1 GGTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGG < 1:6496923/50‑1 GTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGC < 1:4018037/50‑1 GTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGG > 1:321736/1‑49 GTTGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGGAAGG > 1:829216/1‑49 TGGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAC > 1:1122337/1‑50 GGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACC > 1:1427466/1‑50 GGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAC < 1:2953501/49‑1 GGCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAC < 1:6877369/49‑1 GCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCT > 1:2099041/1‑50 GCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACC < 1:3408052/49‑1 GCGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACC < 1:491526/49‑1 CGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTG < 1:954970/50‑1 CGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTG > 1:4226750/1‑50 GAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGC > 1:2917888/1‑50 GAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGC < 1:3513247/50‑1 GAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGC < 1:4852349/50‑1 AGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCT < 1:7182194/50‑1 AGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCT < 1:4427491/50‑1 TTACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/603416‑603466‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCT > NC_000913/609352‑609400 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |