| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 603,467 | Δ5,885 bp | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG], nfsB, ybdF, ybdJ, ybdK, sokE, hokE, insL‑2 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 603467 | 609351 | 5885 | 108 [0] | [0] 112 | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG],nfsB,ybdF,ybdJ,ybdK,sokE,hokE,insL‑2 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 603466 | 0 (0.000) | 102 (0.980) | 64/94 | 0.0 | 100% | coding (1198/1248 nt) | ybdG | miniconductance mechanosensitive channel YbdG |
| ? | NC_000913 | 609352 = | 0 (0.000) | intergenic (+175/+107) | insL‑2/entD | IS186/IS421 transposase/phosphopantetheinyl transferase EntD | |||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
ACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGACTGATGAAGTCGCAGACCAAACTCTTCGACAATCGCAAATATGTGATCG > NC_000913/603418‑603515 | aCTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAg > 1:5061101‑M1/1‑49 (MQ=255)aCTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGA < 1:4998687‑M1/49‑1 (MQ=255) cTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAg < 1:3003188‑M1/49‑2 (MQ=255) gCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaa > 1:1424662‑M1/1‑46 (MQ=255) gCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaa > 1:1442125‑M1/1‑46 (MQ=255) gCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaa > 1:4706951‑M1/1‑46 (MQ=255) gCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaa > 1:4254122‑M1/1‑46 (MQ=255) cTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaat > 1:7731702‑M1/1‑45 (MQ=255) cTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaat < 1:3892814‑M1/50‑6 (MQ=255) cTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaa < 1:3058049‑M1/49‑5 (MQ=255) cTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaa < 1:7600091‑M1/49‑5 (MQ=255) cTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgta < 1:1015145‑M1/48‑4 (MQ=255) ttAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatc > 1:4463777‑M1/1‑44 (MQ=255) ttAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatc > 1:1432040‑M1/1‑44 (MQ=255) tAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatcc > 1:5598405‑M1/1‑43 (MQ=255) aaaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccc > 1:4626429‑M1/1‑42 (MQ=255) aaaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccc > 1:215441‑M1/1‑42 (MQ=255) aaaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatcc < 1:8149063‑M1/49‑8 (MQ=255) aaaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatc < 1:6034869‑M1/48‑7 (MQ=255) aaaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatc < 1:6896753‑M1/48‑7 (MQ=255) aaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatcccc < 1:3562994‑M1/50‑10 (MQ=255) aaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccc < 1:4525699‑M1/49‑9 (MQ=255) aaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccc < 1:7526398‑M1/49‑9 (MQ=255) aTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccg < 1:3524218‑M1/50‑11 (MQ=255) aTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccg < 1:6909173‑M1/50‑11 (MQ=255) tGCCCCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgc < 1:3204367‑M1/50‑12 (MQ=255) cACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgca > 1:7138025‑M1/1‑37 (MQ=255) aCCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcata > 1:553050‑M1/1‑36 (MQ=255) aCCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcata > 1:5738890‑M1/1‑36 (MQ=255) cccGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatat < 1:7535182‑M1/50‑16 (MQ=255) ccGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatc > 1:2722282‑M1/1‑34 (MQ=255) ccGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatc < 1:3836219‑M1/50‑17 (MQ=255) cGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatcc > 1:4550061‑M1/1‑33 (MQ=255) cGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatcc > 1:211171‑M1/1‑33 (MQ=255) gCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccg < 1:5052701‑M1/50‑19 (MQ=255) gCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccg < 1:6346799‑M1/50‑19 (MQ=255) ccAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccgg < 1:190356‑M1/50‑20 (MQ=255) cAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggt > 1:1224610‑M1/1‑30 (MQ=255) agagagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggtt < 1:5570555‑M1/50‑22 (MQ=255) agagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgt > 1:4787075‑M1/1‑27 (MQ=255) agagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgt < 1:2706081‑M1/50‑24 (MQ=255) gagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtc < 1:1541876‑M1/50‑25 (MQ=255) gagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtc < 1:5988948‑M1/50‑25 (MQ=255) gagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgt > 1:2142149‑M1/1‑26 (MQ=255) gagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgt > 1:2068500‑M1/1‑26 (MQ=255) agCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtca < 1:28782‑M1/50‑26 (MQ=255) agCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgt > 1:1695878‑M1/1‑25 (MQ=255) agCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgt > 1:5588297‑M1/1‑25 (MQ=255) gCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcag < 1:8098463‑M1/50‑27 (MQ=255) gCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcag < 1:6278458‑M1/50‑27 (MQ=255) gCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcag < 1:4373302‑M1/50‑27 (MQ=255) cGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcagg > 1:3508311‑M1/1‑23 (MQ=255) cGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcagg < 1:2461645‑M1/50‑28 (MQ=255) gAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 1:196738‑M1/1‑22 (MQ=255) gAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 1:6574229‑M1/1‑22 (MQ=255) gAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 1:7335216‑M1/1‑22 (MQ=255) gAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt < 1:2905133‑M1/50‑29 (MQ=255) aaTATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtc < 1:2350321‑M1/50‑30 (MQ=255) aaTATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 1:235182‑M1/1‑21 (MQ=255) aaTATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 1:3431960‑M1/1‑21 (MQ=255) atatCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtca < 1:1108883‑M1/50‑31 (MQ=255) atatCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtca < 1:6369491‑M1/50‑31 (MQ=255) atatCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 1:7305176‑M1/1‑20 (MQ=255) tatCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcag > 1:6934780‑M1/1‑19 (MQ=255) tatCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcag < 1:8286293‑M1/50‑32 (MQ=255) tCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcagga < 1:3716072‑M1/50‑34 (MQ=255) tCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcagga < 1:3495303‑M1/50‑34 (MQ=255) tCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcagg < 1:777542‑M1/49‑33 (MQ=255) tCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcagg < 1:1630106‑M1/49‑33 (MQ=255) tCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcagg < 1:3361723‑M1/49‑33 (MQ=255) cATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggat > 1:7042654‑M1/1‑16 (MQ=255) aTTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatg > 1:1261010‑M1/1‑15 (MQ=255) aTTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatg < 1:3947778‑M1/50‑36 (MQ=255) aTTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatg > 1:3795337‑M1/1‑15 (MQ=255) aTTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatg < 1:5427901‑M1/50‑36 (MQ=255) aTTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatg < 1:7676891‑M1/50‑36 (MQ=255) aTTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatg > 1:6704663‑M1/1‑15 (MQ=255) ccGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaa < 1:4189075‑M1/50‑40 (MQ=255) cGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaag < 1:5220399‑M1/50‑41 (MQ=255) cGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaag > 1:853728‑M1/1‑10 (MQ=255) cGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaag > 1:5375299‑M1/1‑10 (MQ=255) cGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaag > 1:2103091‑M1/1‑10 (MQ=255) ggTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaagg < 1:6496923‑M1/50‑42 (MQ=255) gTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggc < 1:4018037‑M1/50‑43 (MQ=255) gTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaagg > 1:321736‑M1/1‑8 (MQ=255) gTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatgggaagg > 1:829216‑M1/1‑8 (MQ=255) tGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcac > 1:1122337‑M1/1‑6 (MQ=255) ggCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacc > 1:1427466‑M1/1‑5 (MQ=255) ggCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcac < 1:2953501‑M1/49‑45 (MQ=255) ggCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcac < 1:6877369‑M1/49‑45 (MQ=255) gCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacct > 1:2099041‑M1/1‑4 (MQ=255) gCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacc < 1:491526‑M1/49‑46 (MQ=255) gCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacc < 1:3408052‑M1/49‑46 (MQ=255) cGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacctg > 1:4226750‑M1/1‑3 (MQ=255) cGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacctg < 1:954970‑M1/50‑48 (MQ=255) gAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacctgc > 1:2917888‑M1/1‑2 (MQ=255) gAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacctgc < 1:3513247‑M1/50‑49 (MQ=255) gAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacctgc < 1:4852349‑M1/50‑49 (MQ=255) agtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacctgct < 1:7182194‑M1/50‑50 (MQ=255) agtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacctgct < 1:4427491‑M1/50‑50 (MQ=255) | ACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGACTGATGAAGTCGCAGACCAAACTCTTCGACAATCGCAAATATGTGATCG > NC_000913/603418‑603515 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |