Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 1,299,499 | Δ1,199 bp | insH21 | insH21 |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 1299499 | 1300697 | 1199 | 135 [0] | [0] 134 | insH21 | insH21 |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1299498 | 0 (0.000) | 115 (1.150) | 65/90 | 0.0 | 100% | intergenic (+253/‑33) | ychE/insH21 | putative inner membrane protein/IS5 transposase and trans‑activator |
? | NC_000913 | 1300698 = | 0 (0.000) | intergenic (+151/‑484) | insH21/oppA | IS5 transposase and trans‑activator/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
ATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAG > NC_000913/1299449‑1299547 | atTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAA < 1:3951650‑M1/50‑1 (MQ=255) atTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAA < 1:1647253‑M1/50‑1 (MQ=255) ttGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAa < 1:2385973‑M1/50‑2 (MQ=255) tGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAa > 1:1095549‑M1/1‑48 (MQ=255) gAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAat < 1:7589041‑M1/49‑3 (MQ=255) gAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAat < 1:5190836‑M1/49‑3 (MQ=255) gAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAat < 1:2910851‑M1/49‑3 (MQ=255) gAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAat < 1:2541920‑M1/49‑3 (MQ=255) gAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAat > 1:1815786‑M1/1‑47 (MQ=255) gAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAat < 1:7330190‑M1/49‑3 (MQ=255) aaaTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataa > 1:5778160‑M1/1‑46 (MQ=255) aaaTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAata < 1:7102057‑M1/49‑4 (MQ=255) aaaTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAata < 1:4777122‑M1/49‑4 (MQ=255) aaTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataat < 1:7961831‑M1/50‑6 (MQ=255) tGATATTATTAATTCCACTGCTTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataa < 1:5534819‑M1/50‑8 (MQ=255) gATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataat > 1:2413817‑M1/1‑42 (MQ=255) atatTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatc < 1:4266848‑M1/50‑10 (MQ=255) atatTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataat > 1:1975340‑M1/1‑41 (MQ=255) tattatTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatca < 1:4190363‑M1/50‑11 (MQ=255) tattatTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatca < 1:3863953‑M1/50‑11 (MQ=255) tattatTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatc > 1:5669848‑M1/1‑40 (MQ=255) ttattaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaat > 1:2463711‑M1/1‑38 (MQ=255) ttattaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaat < 1:621458‑M1/50‑13 (MQ=255) ttattaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaat > 1:3452779‑M1/1‑38 (MQ=255) attaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattg > 1:6538342‑M1/1‑36 (MQ=255) taATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgt > 1:2690225‑M1/1‑34 (MQ=255) taATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgt > 1:4938699‑M1/1‑34 (MQ=255) taATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgt > 1:1753946‑M1/1‑34 (MQ=255) aaTTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgtt > 1:1543346‑M1/1‑33 (MQ=255) aaTTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgtt > 1:323238‑M1/1‑33 (MQ=255) aaTTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgtt < 1:6211934‑M1/49‑17 (MQ=255) aTTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaa < 1:523610‑M1/50‑19 (MQ=255) ttCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaa > 1:615526‑M1/1‑31 (MQ=255) ttCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaa > 1:2651981‑M1/1‑31 (MQ=255) ttCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaa < 1:4576289‑M1/50‑20 (MQ=255) ttCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaa < 1:4403563‑M1/50‑20 (MQ=255) ttCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaa > 1:1689366‑M1/1‑31 (MQ=255) ttCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaa < 1:1414784‑M1/50‑20 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaat < 1:5677833‑M1/49‑21 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaat > 1:5056279‑M1/1‑29 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaat > 1:5013538‑M1/1‑29 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaat > 1:855119‑M1/1‑29 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaat < 1:1328831‑M1/49‑21 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaat < 1:3663288‑M1/49‑21 (MQ=255) cACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaatta > 1:3706671‑M1/1‑28 (MQ=255) cACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaatt < 1:801383‑M1/49‑22 (MQ=255) cACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaatt < 1:2235358‑M1/49‑22 (MQ=255) aCTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattat < 1:3304366‑M1/50‑24 (MQ=255) cTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattatt < 1:4111270‑M1/50‑25 (MQ=255) cTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattatt > 1:6413385‑M1/1‑26 (MQ=255) cTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattatt > 1:3913070‑M1/1‑26 (MQ=255) cTGCCTTTGGTAAAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattatt > 1:5898415‑M1/1‑26 (MQ=255) gCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgt > 1:4825219‑M1/1‑24 (MQ=255) ccTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtg < 1:3055405‑M1/50‑28 (MQ=255) ccTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgt < 1:2912009‑M1/49‑27 (MQ=255) ccTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgt < 1:6717599‑M1/49‑27 (MQ=255) cTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgc < 1:3854417‑M1/50‑29 (MQ=255) cTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtg > 1:6430849‑M1/1‑22 (MQ=255) tttGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgca > 1:761275‑M1/1‑21 (MQ=255) ttGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcat > 1:833263‑M1/1‑20 (MQ=255) tGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatt > 1:636005‑M1/1‑19 (MQ=255) tGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatt > 1:4203475‑M1/1‑19 (MQ=255) tGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcat < 1:1530518‑M1/49‑31 (MQ=255) ggTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcattt > 1:1656020‑M1/1‑18 (MQ=255) ggTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcattt > 1:4912235‑M1/1‑18 (MQ=255) gTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcattt > 1:538656‑M1/1‑17 (MQ=255) gTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcattt < 1:7734748‑M1/49‑33 (MQ=255) gagGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcact < 1:5939171‑M1/50‑37 (MQ=255) gagGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcact < 1:3705807‑M1/50‑37 (MQ=255) gagGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcac < 1:7088889‑M1/49‑36 (MQ=255) agGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcacta < 1:3559186‑M1/50‑38 (MQ=255) gAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactact < 1:7315239‑M1/50‑40 (MQ=255) gAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactact < 1:5528599‑M1/50‑40 (MQ=255) gAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactact > 1:2714804‑M1/1‑11 (MQ=255) gAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactact < 1:5041996‑M1/50‑40 (MQ=255) gAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactact < 1:4291300‑M1/50‑40 (MQ=255) aaaGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactg < 1:6440165‑M1/50‑41 (MQ=255) aaaGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactg > 1:7273735‑M1/1‑10 (MQ=255) aaGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactgg < 1:1846691‑M1/50‑42 (MQ=255) aGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactgg > 1:2528310‑M1/1‑8 (MQ=255) gTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaa > 1:8177617‑M1/1‑7 (MQ=255) gTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaa < 1:5490186‑M1/50‑44 (MQ=255) tGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaac > 1:2803734‑M1/1‑6 (MQ=255) tGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaac < 1:5154340‑M1/50‑45 (MQ=255) gCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaact > 1:4766013‑M1/1‑5 (MQ=255) gCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaact > 1:5645357‑M1/1‑5 (MQ=255) gCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaact > 1:6551394‑M1/1‑5 (MQ=255) cTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactg > 1:356867‑M1/1‑4 (MQ=255) cTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactg > 1:3834239‑M1/1‑4 (MQ=255) cTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactg < 1:4800932‑M1/50‑47 (MQ=255) cTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactg > 1:3646583‑M1/1‑4 (MQ=255) cTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactg > 1:3303194‑M1/1‑4 (MQ=255) tAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactg > 1:2174701‑M1/1‑3 (MQ=255) tAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactg > 1:3197389‑M1/1‑3 (MQ=255) aaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgt > 1:4321151‑M1/1‑2 (MQ=255) aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaa > 1:7064243‑M1/1‑1 (MQ=255) aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaa < 1:5411193‑M1/50‑50 (MQ=255) aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgta < 1:1235182‑M1/49‑49 (MQ=255) aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgta < 1:6255055‑M1/49‑49 (MQ=255) aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgt < 1:5332474‑M1/48‑48 (MQ=255) | ATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAG > NC_000913/1299449‑1299547 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |