| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,388,889 | Δ9,734 bp | ycjG–[uspE] | ycjG, mpaA, ymjC, ymjD, ycjY, pgrR, mppA, ynaI, insH‑4, ynaJ, [uspE] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1388889 | 1398622 | 9734 | 89 [0] | [0] 90 | ycjG–[uspE] | ycjG,mpaA,ymjC,ymjD,ycjY,pgrR,mppA,ynaI,insH‑4,ynaJ,[uspE] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1388888 | 0 (0.000) | 88 (0.830) | 59/96 | 0.0 | 100% | intergenic (‑77/‑42) | tpx/ycjG | lipid hydroperoxide peroxidase/L‑Ala‑D/L‑Glu epimerase |
| ? | NC_000913 | 1398623 = | 0 (0.000) | intergenic (‑1/+151) | uspE/fnr | universal stress protein with a role cellular motility/DNA‑binding transcriptional dual regulator FNR | |||||
GTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCTTAATCCGCAGACCACCGCGACAACAAGGAGTAAAGATGAGAA > NC_000913/1388842‑1388936 | gTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTaca < 1:7238088‑M1/50‑4 (MQ=255) tCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacag < 1:5229863‑M1/50‑5 (MQ=255) tCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacag > 1:5547864‑M1/1‑46 (MQ=255) tCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacag > 1:407868‑M1/1‑46 (MQ=255) tCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacag > 1:3459559‑M1/1‑46 (MQ=255) tCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacag > 1:635846‑M1/1‑46 (MQ=255) tCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAACAAACGCTATTacag > 1:3006651‑M1/1‑46 (MQ=255) cacaCCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagg > 1:4566804‑M1/1‑45 (MQ=255) acacCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagg < 1:6041413‑M1/49‑6 (MQ=255) cacCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggt < 1:1898238‑M1/50‑8 (MQ=255) cacCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggt > 1:7360174‑M1/1‑43 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cacaGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtt > 1:3373941‑M1/1‑16 (MQ=255) cacaGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtt > 1:1186339‑M1/1‑16 (MQ=255) acaGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagttt < 1:5221861‑M1/50‑36 (MQ=255) acaGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagttt > 1:6596387‑M1/1‑15 (MQ=255) acaGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagttt < 1:5312586‑M1/50‑36 (MQ=255) caGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttg < 1:1277836‑M1/50‑37 (MQ=255) caGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttg < 1:4327596‑M1/50‑37 (MQ=255) caGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttg > 1:5746893‑M1/1‑14 (MQ=255) caGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgaagtttg < 1:5642305‑M1/50‑37 (MQ=255) aGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgt < 1:672417‑M1/50‑38 (MQ=255) aGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttg > 1:7552552‑M1/1‑13 (MQ=255) gCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgta < 1:5737898‑M1/50‑39 (MQ=255) 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gCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaa > 1:7557237‑M1/1‑6 (MQ=255) ttacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaaaagat < 1:1613339‑M1/50‑49 (MQ=255) ttacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaaaagat < 1:798987‑M1/50‑49 (MQ=255) ttacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaaaaga < 1:6738689‑M1/49‑48 (MQ=255) ttacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaaaag < 1:6306915‑M1/48‑47 (MQ=255) tacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaaaagat > 1:1324997‑M1/1‑1 (MQ=255) | GTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCTTAATCCGCAGACCACCGCGACAACAAGGAGTAAAGATGAGAA > NC_000913/1388842‑1388936 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |