| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,509,562 | Δ46,201 bp | [hicB]–maeA | 43 genes [hicB], ydcR, ydcS, ydcT, ydcU, ydcV, patD, yncL, ortT, ydcY, ydcZ, mnaT, curA, mcbR, yncD, yncE, ansP, yncG, yncH, rhsE, ydcD, yncO, yncI, ydcC, pptA, yddH, nhoA, yddE, narV, narW, narY, narZ, narU, yddJ, yddK, yddL, yddG, fdnG, fdnH, fdnI, yddM, adhP, maeA |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1509562 | 1555762 | 46201 | 130 [0] | [0] 131 | [hicB]–maeA | [hicB],ydcR,ydcS,ydcT,ydcU,ydcV,patD,yncL,ortT,ydcY,ydcZ,mnaT,curA,mcbR,yncD,yncE,ansP,yncG,yncH,rhsE,ydcD,yncO,yncI,ydcC,pptA,yddH,nhoA,yddE,narV,narW,narY,narZ,narU,yddJ,yddK,yddL,yddG,fdnG,fdnH,fdnI,yddM,adhP,maeA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1509561 | 0 (0.000) | 128 (1.180) | 69/98 | 0.0 | 100% | coding (54/417 nt) | hicB | antitoxin of the HicA‑HicB toxin‑antitoxin system |
| ? | NC_000913 | 1555763 = | 0 (0.000) | intergenic (‑94/+63) | maeA/sra | malate dehydrogenase, NAD‑requiring/30S ribosomal subunit protein S22 | |||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
TTATCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTTTTGTGGATATCCCTGAAGCGTTGACCCAGGGCGAAACTGTCGCTGAAG > NC_000913/1509513‑1509610 | ttATCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCt > 1:7823134/1‑49 (MQ=255)ttATCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCt > 1:6602375/1‑49 (MQ=255) aTCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaa > 1:4521932‑M1/1‑47 (MQ=255) tCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaa > 1:8302931‑M1/1‑46 (MQ=255) tCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaa < 1:425874‑M1/49‑4 (MQ=255) tCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaa < 1:6935837‑M1/49‑4 (MQ=255) cccGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaac > 1:4998817‑M1/1‑45 (MQ=255) ccGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaaca < 1:6633706‑M1/49‑6 (MQ=255) ccGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaaca > 1:3656156‑M1/1‑44 (MQ=255) ccGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaaca < 1:450490‑M1/49‑6 (MQ=255) ccGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaaca > 1:4775817‑M1/1‑44 (MQ=255) 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ctctTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacac < 1:7912631‑M1/50‑13 (MQ=255) ctctTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacac < 1:8090976‑M1/50‑13 (MQ=255) tctTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacac > 1:1898069‑M1/1‑37 (MQ=255) tctTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacac > 1:4128661‑M1/1‑37 (MQ=255) tctTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacac > 1:8151978‑M1/1‑37 (MQ=255) ctTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacacca > 1:6861215‑M1/1‑36 (MQ=255) ctTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacacca > 1:2613204‑M1/1‑36 (MQ=255) ttACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacacc < 1:237295‑M1/48‑14 (MQ=255) acacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattg > 1:913686‑M1/1‑33 (MQ=255) acacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccatt < 1:7169349‑M1/49‑17 (MQ=255) acacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccatt < 1:4014279‑M1/49‑17 (MQ=255) acacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccatt < 1:2565838‑M1/49‑17 (MQ=255) acacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccatt < 1:2687630‑M1/49‑17 (MQ=255) acacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacacca < 1:7670436‑M1/47‑15 (MQ=255) cacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgc < 1:1819348‑M1/50‑19 (MQ=255) cacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgc < 1:523167‑M1/50‑19 (MQ=255) cacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgc < 1:3018722‑M1/50‑19 (MQ=255) cacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgc > 1:5460068‑M1/1‑32 (MQ=255) cacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgc < 1:1905070‑M1/50‑19 (MQ=255) cacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattg < 1:4203384‑M1/49‑18 (MQ=255) acCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcg < 1:6750311‑M1/50‑20 (MQ=255) acCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcg < 1:5477921‑M1/50‑20 (MQ=255) acCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcg > 1:3653418‑M1/1‑31 (MQ=255) cccGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgc < 1:441777‑M1/50‑21 (MQ=255) cccGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcg > 1:2140970‑M1/1‑30 (MQ=255) ccGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcg > 1:7547040‑M1/1‑29 (MQ=255) cgcgCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcag > 1:1927292‑M1/1‑28 (MQ=255) cgcgCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcag < 1:6094002‑M1/50‑23 (MQ=255) gcgcCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcagg < 1:4144385‑M1/50‑24 (MQ=255) gcgcCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcagg < 1:2369759‑M1/50‑24 (MQ=255) gcCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggc > 1:4037538‑M1/1‑25 (MQ=255) gcCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggc > 1:7130623‑M1/1‑25 (MQ=255) ccGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaa > 1:2948096‑M1/1‑24 (MQ=255) cGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaat > 1:1467649‑M1/1‑23 (MQ=255) cGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaat > 1:5862344‑M1/1‑23 (MQ=255) ggAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatg < 1:5584426‑M1/50‑29 (MQ=255) 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ggTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgttt > 1:7487428‑M1/1‑15 (MQ=255) ggTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgttt > 1:5741262‑M1/1‑15 (MQ=255) ttATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaat > 1:6525626‑M1/1‑13 (MQ=255) ttATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaat < 1:879154‑M1/50‑38 (MQ=255) ttATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaat < 1:808874‑M1/50‑38 (MQ=255) tataTGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatc > 1:7037424‑M1/1‑12 (MQ=255) tataTGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatc > 1:3580690‑M1/1‑12 (MQ=255) tatGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgt < 1:1288234‑M1/50‑41 (MQ=255) tatGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgt > 1:3937362‑M1/1‑10 (MQ=255) tatGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcg < 1:2461367‑M1/49‑40 (MQ=255) atGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgt > 1:597198‑M1/1‑9 (MQ=255) tGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtca < 1:8313497‑M1/50‑43 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |