| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 389,898 | Δ9,908 bp | yaiT–[yaiZ] | yaiT, insF‑2, insE‑2, yaiT, iprA, ampH, sbmA, yaiW, yaiY, [yaiZ] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 389898 | 399805 | 9908 | 155 [0] | [0] 165 | yaiT–[yaiZ] | yaiT,insF‑2,insE‑2,yaiT,iprA,ampH,sbmA,yaiW,yaiY,[yaiZ] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 389897 | 0 (0.000) | 153 (1.410) | 74/98 | 0.0 | 100% | intergenic (‑170/‑354) | hemB/yaiT | porphobilinogen synthase/putative autotransporter YaiT |
| ? | NC_000913 | 399806 = | 0 (0.000) | intergenic (+1/+23) | yaiZ/ddlA | DUF2754 domain‑containing protein YaiZ/D‑alanine‑‑D‑alanine ligase A | |||||
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
GGGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTATC > NC_000913/399758‑399855 | aatagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttg > 1:6892461‑M2/49‑49 (MQ=255)aatagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttg < 1:7748203‑M2/1‑1 (MQ=255)aatagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttg < 1:4018082‑M2/1‑1 (MQ=255)aatagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttg > 1:2050739‑M2/49‑49 (MQ=255) atagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGa < 1:3157588‑M2/2‑1 (MQ=255) atagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGa < 1:284009‑M2/2‑1 (MQ=255) tagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAat < 1:3878209‑M2/4‑1 (MQ=255) tagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAat < 1:4373688‑M2/4‑1 (MQ=255) agaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAata > 1:6236535‑M2/46‑50 (MQ=255) gaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAatat > 1:2997129‑M2/45‑50 (MQ=255) gaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAata < 1:5626008‑M2/5‑1 (MQ=255) aacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAAtatta < 1:417552‑M2/8‑1 (MQ=255) aacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAAtatta < 1:1587988‑M2/8‑1 (MQ=255) acagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAAtattat < 1:7357287‑M2/9‑1 (MQ=255) acagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAAtattat > 1:2643998‑M2/42‑50 (MQ=255) cagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATc < 1:4489506‑M2/10‑1 (MQ=255) cagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATc < 1:3579579‑M2/10‑1 (MQ=255) cagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATc < 1:4959667‑M2/10‑1 (MQ=255) cagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATc < 1:1863427‑M2/10‑1 (MQ=255) cagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATc < 1:5112736‑M2/10‑1 (MQ=255) agcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCg > 1:6258774‑M2/40‑50 (MQ=255) agcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCg > 1:7820383‑M2/40‑50 (MQ=255) gcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCgg > 1:646683‑M2/39‑50 (MQ=255) 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tttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCa < 1:7063785‑M2/40‑1 (MQ=255) ttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCaa < 1:1961036‑M2/41‑1 (MQ=255) ttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCaa < 1:3212944‑M2/41‑1 (MQ=255) ttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCaa < 1:2530684‑M2/41‑1 (MQ=255) taatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAAt < 1:6962403‑M2/42‑1 (MQ=255) taatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAAt < 1:5956538‑M2/42‑1 (MQ=255) taatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAAt < 1:6999102‑M2/42‑1 (MQ=255) taatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAAt < 1:5615761‑M2/42‑1 (MQ=255) taatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAAt < 1:5243600‑M2/42‑1 (MQ=255) taatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATg > 1:895299‑M2/8‑50 (MQ=255) taatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATg > 1:5338600‑M2/8‑50 (MQ=255) aatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATg < 1:1984158‑M2/43‑1 (MQ=255) aatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATg < 1:4792037‑M2/43‑1 (MQ=255) aatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATg < 1:6378116‑M2/43‑1 (MQ=255) aatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATg < 1:5707318‑M2/43‑1 (MQ=255) atcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCg > 1:4882299‑M2/6‑50 (MQ=255) tcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGt > 1:1757468‑M2/5‑50 (MQ=255) cttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGt > 1:6682818‑M2/4‑49 (MQ=255) tGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTAt > 1:7437249‑M2/2‑50 (MQ=255) tGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTAt > 1:4578890‑M2/2‑50 (MQ=255) gAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGtt < 1:5425689/47‑1 (MQ=255) gAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGtt < 1:5817855/47‑1 (MQ=255) gAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGtt < 1:6620162/47‑1 (MQ=255) gAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGt < 1:5442510/46‑1 (MQ=255) gAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGt < 1:2736787/46‑1 (MQ=255) gAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGt < 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |