| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 380111 | 0 (0.000) | 71 (0.850) +CGAGATGGACG |
41/76 | 0.1 | 59.2% | coding (732/774 nt) | yaiO | outer membrane protein YaiO |
| ? | NC_000913 | 624576 = | 127 (1.170) | intergenic (‑66/‑309) | fepB/entC | ferric enterobactin ABC transporter periplasmic binding protein/isochorismate synthase EntC | |||||
AGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/380064‑380111‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGG > NC_000913/624576‑624614 ||||||||||| AGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACG < 1:1659989/50‑1 GGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:6998133/1‑48 GAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:7283295/1‑47 AATCAGAAGTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGA < 1:7797134/50‑1 ATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGAT > 1:1001488/1‑50 ATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGAT < 1:2024207/50‑1 ATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGAT < 1:1102676/50‑1 ATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGAT < 1:3881999/50‑1 ATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGAT > 1:1360283/1‑50 ATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGAT > 1:3698702/1‑50 TCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATG < 1:4878915/50‑1 AGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGA < 1:6198719/50‑1 AGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGG < 1:6408608/49‑1 AATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACG < 1:4158654/50‑1 AATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACG > 1:1196690/1‑50 AATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACG < 1:3548645/50‑1 AATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACG < 1:3011236/50‑1 ATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGG < 1:212991/50‑1 TTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGT < 1:2223601/50‑1 TTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGT < 1:1019911/50‑1 TTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGT < 1:4167422/50‑1 TTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGT < 1:5922348/50‑1 TCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCC > 1:8291145/1‑50 TCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTC < 1:284905/49‑1 CCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCC > 1:6665558/1‑50 CCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCC > 1:857594/1‑50 CCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCC < 1:555537/49‑1 CAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCC > 1:3124392/1‑50 CAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCC < 1:8193399/50‑1 CAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCC > 1:6855390/1‑50 AGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCT > 1:6798571/1‑50 AGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCT < 1:3317163/50‑1 AGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCT < 1:1839647/50‑1 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTC < 1:823441/50‑1 GTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCG < 1:677969/50‑1 GTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCG > 1:3880720/1‑50 TCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGC > 1:6992315/1‑50 CAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCC > 1:2217315/1‑50 AGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCC > 1:7964027/1‑50 AGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCC > 1:8078423/1‑50 AGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCC > 1:1077568/1‑50 GACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCC > 1:5970052/1‑50 CGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCct < 1:7287537/50‑3 CGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCct < 1:522706/50‑3 CGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCct > 1:4702472/1‑48 CGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCct < 1:109154/50‑3 GGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTT < 1:2215322/50‑1 GGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTT < 1:5672720/50‑1 GGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTT < 1:8087519/50‑1 GGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTT < 1:159984/50‑1 GGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTT < 1:1399021/50‑1 GCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGG < 1:687007/50‑1 CTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:311726/1‑50 CTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:343748/1‑50 CTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG < 1:6498913/50‑1 CTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:6485561/1‑50 CTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:3908228/1‑50 TGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:8099508/1‑49 AAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGA < 1:7547644/50‑1 AAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGA > 1:1639130/1‑48 AAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGA > 1:6669744/1‑48 AGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG > 1:3582385/1‑50 AGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG > 1:5923188/1‑50 TTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGG > 1:5535656/1‑50 CAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTA < 1:8111526/50‑1 CAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTA < 1:4032536/50‑1 CAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTT < 1:2655685/49‑1 CAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGT > 1:282076/1‑48 CAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGT > 1:3680066/1‑48 AGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAG < 1:8111533/50‑1 GACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGG > 1:6785472/1‑50 GACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGG > 1:610415/1‑50 GACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGG < 1:472713/50‑1 CCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGT < 1:7327259/50‑1 CGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTG < 1:2425232/50‑1 CGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTG < 1:2372784/50‑1 CGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGT > 1:1510362/1‑49 CGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGT > 1:6461713/1‑49 GTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGA < 1:2631953/50‑1 GTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGT > 1:7424805/1‑48 TTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAG < 1:1066362/50‑1 TTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAG < 1:3173861/50‑1 TTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAG > 1:8173864/1‑50 TTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAG < 1:5987492/50‑1 TACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGG > 1:4600200/1‑50 ACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGG > 1:130414/1‑50 ACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGG > 1:7155960/1‑50 ACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGG < 1:6692613/49‑1 CGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGG > 1:2272710/1‑50 CGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGG < 1:2543237/50‑1 CGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGG < 1:2087750/49‑1 CGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGG < 1:747707/49‑1 ||||||||||| AGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/380064‑380111‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGG > NC_000913/624576‑624614 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |