| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,299,499 | Δ1,199 bp | insH21 | insH21 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1299499 | 1300697 | 1199 | 198 [0] | [0] 201 | insH21 | insH21 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1299498 | 0 (0.000) | 178 (1.800) | 74/90 | 0.0 | 100% | intergenic (+253/‑33) | ychE/insH21 | putative inner membrane protein/IS5 transposase and trans‑activator |
| ? | NC_000913 | 1300698 = | 0 (0.000) | intergenic (+151/‑484) | insH21/oppA | IS5 transposase and trans‑activator/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
ATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAG > NC_000913/1299449‑1299547 | atTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAA < 1:8177207‑M1/50‑1 (MQ=255)atTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAA < 1:5489761‑M1/50‑1 (MQ=255) ttGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAa > 1:588976‑M1/1‑49 (MQ=255) ttGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAa < 1:2644793‑M1/50‑2 (MQ=255) gAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAat < 1:1507131‑M1/49‑3 (MQ=255) aaaTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataa < 1:950947‑M1/50‑5 (MQ=255) aaaTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAata < 1:7213599‑M1/49‑4 (MQ=255) aaTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataat < 1:4058727‑M1/50‑6 (MQ=255) aaTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataa > 1:21566‑M1/1‑45 (MQ=255) aTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataata < 1:557149‑M1/50‑7 (MQ=255) aTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataata < 1:1736474‑M1/50‑7 (MQ=255) aTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataata < 1:2238639‑M1/50‑7 (MQ=255) aTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataata < 1:876605‑M1/50‑7 (MQ=255) tGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataa > 1:4441886‑M1/1‑43 (MQ=255) tGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataa < 1:1188667‑M1/50‑8 (MQ=255) tGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataa < 1:5961905‑M1/50‑8 (MQ=255) tGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataa < 1:8235290‑M1/50‑8 (MQ=255) gATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataat > 1:4146587‑M1/1‑42 (MQ=255) atatTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataat < 1:6526005‑M1/49‑9 (MQ=255) atatTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataat > 1:3247330‑M1/1‑41 (MQ=255) atatTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataat > 1:2714000‑M1/1‑41 (MQ=255) atatTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataat < 1:7082367‑M1/49‑9 (MQ=255) tattatTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatca < 1:4997944‑M1/50‑11 (MQ=255) tattatTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatc > 1:5686174‑M1/1‑40 (MQ=255) tattatTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatc > 1:4546640‑M1/1‑40 (MQ=255) tattatTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatc > 1:7817450‑M1/1‑40 (MQ=255) tattatTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatc > 1:6687565‑M1/1‑40 (MQ=255) ttattaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaat > 1:2082491‑M1/1‑38 (MQ=255) ttattaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaat > 1:4294713‑M1/1‑38 (MQ=255) tattaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaatt > 1:2477901‑M1/1‑37 (MQ=255) attaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattg > 1:5995810‑M1/1‑36 (MQ=255) attaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattg > 1:3913753‑M1/1‑36 (MQ=255) attaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaatt < 1:184295‑M1/49‑14 (MQ=255) ttaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgt > 1:4767874‑M1/1‑35 (MQ=255) taATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgt > 1:1626922‑M1/1‑34 (MQ=255) taATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgt > 1:1304015‑M1/1‑34 (MQ=255) aaTTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgtt < 1:4364697‑M1/49‑17 (MQ=255) aaTTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgtt > 1:1016209‑M1/1‑33 (MQ=255) aTTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaa < 1:2525878‑M1/50‑19 (MQ=255) aTTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgtta > 1:7414794‑M1/1‑32 (MQ=255) ttCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaa < 1:6481513‑M1/50‑20 (MQ=255) ttCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaa < 1:2980752‑M1/50‑20 (MQ=255) tCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaat > 1:7375518‑M1/1‑30 (MQ=255) tCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaat > 1:2565146‑M1/1‑30 (MQ=255) tCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaat > 1:5139166‑M1/1‑30 (MQ=255) cACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaatta < 1:559739‑M1/50‑23 (MQ=255) aCTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattat > 1:4162342‑M1/1‑27 (MQ=255) aCTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattat < 1:3450265‑M1/50‑24 (MQ=255) aCTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattat > 1:1460556‑M1/1‑27 (MQ=255) aCTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattat > 1:4982005‑M1/1‑27 (MQ=255) aCTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaatcat < 1:3269801‑M1/50‑24 (MQ=255) cTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattatt > 1:7999540‑M1/1‑26 (MQ=255) cTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattatt > 1:3099436‑M1/1‑26 (MQ=255) cTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattatt > 1:3501609‑M1/1‑26 (MQ=255) tGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattg > 1:520575‑M1/1‑25 (MQ=255) ccTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtg > 1:4838772‑M1/1‑23 (MQ=255) ccTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtg < 1:3392222‑M1/50‑28 (MQ=255) ccTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtg < 1:93155‑M1/50‑28 (MQ=255) cTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgc < 1:5689007‑M1/50‑29 (MQ=255) cTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtg > 1:6155679‑M1/1‑22 (MQ=255) cTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtg > 1:5910410‑M1/1‑22 (MQ=255) cTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtg > 1:584173‑M1/1‑22 (MQ=255) ttGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcat > 1:6373191‑M1/1‑20 (MQ=255) ttGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcat > 1:380719‑M1/1‑20 (MQ=255) tGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatt > 1:3631390‑M1/1‑19 (MQ=255) tGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatt > 1:8198067‑M1/1‑19 (MQ=255) tGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgca < 1:7665426‑M1/48‑30 (MQ=255) ggTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatt < 1:6453579‑M1/49‑32 (MQ=255) gTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttc < 1:1040687‑M1/50‑34 (MQ=255) gTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcattt < 1:8210702‑M1/49‑33 (MQ=255) gTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcattt < 1:7991988‑M1/49‑33 (MQ=255) tAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttca < 1:8050891‑M1/50‑35 (MQ=255) agagGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcac > 1:1788351‑M1/1‑15 (MQ=255) agagGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcac > 1:6655704‑M1/1‑15 (MQ=255) agagGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcac > 1:7271118‑M1/1‑15 (MQ=255) gagGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcac > 1:754139‑M1/1‑14 (MQ=255) agGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcacta < 1:1056272‑M1/50‑38 (MQ=255) agGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcacta > 1:6839687‑M1/1‑13 (MQ=255) ggAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactac < 1:5930781‑M1/50‑39 (MQ=255) ggAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactac > 1:3129461‑M1/1‑12 (MQ=255) gAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactact > 1:3870432‑M1/1‑11 (MQ=255) aaaGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactg < 1:7591857‑M1/50‑41 (MQ=255) aaaGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactg < 1:5329929‑M1/50‑41 (MQ=255) aaaGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactg < 1:1365292‑M1/50‑41 (MQ=255) aaaGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactg > 1:5312672‑M1/1‑10 (MQ=255) aaaGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactg > 1:675336‑M1/1‑10 (MQ=255) gTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaa < 1:663546‑M1/50‑44 (MQ=255) gTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaa > 1:2430380‑M1/1‑7 (MQ=255) tGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaac > 1:4179465‑M1/1‑6 (MQ=255) tGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaac < 1:5132153‑M1/50‑45 (MQ=255) gCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaact > 1:1963725‑M1/1‑5 (MQ=255) tAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactg > 1:699916‑M1/1‑3 (MQ=255) tAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactg > 1:1269173‑M1/1‑3 (MQ=255) tAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactg > 1:6267690‑M1/1‑3 (MQ=255) tAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactg > 1:4681829‑M1/1‑3 (MQ=255) aaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgt > 1:7852698‑M1/1‑2 (MQ=255) aaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgt > 1:332899‑M1/1‑2 (MQ=255) aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaa < 1:8113327‑M1/50‑50 (MQ=255) aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgta < 1:5779017‑M1/49‑49 (MQ=255) aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgta < 1:275243‑M1/49‑49 (MQ=255) | ATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAG > NC_000913/1299449‑1299547 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |