| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,299,499 | Δ1,199 bp | insH21 | insH21 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1299499 | 1300697 | 1199 | 198 [0] | [0] 201 | insH21 | insH21 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1299498 | 0 (0.000) | 178 (1.800) | 74/90 | 0.0 | 100% | intergenic (+253/‑33) | ychE/insH21 | putative inner membrane protein/IS5 transposase and trans‑activator |
| ? | NC_000913 | 1300698 = | 0 (0.000) | intergenic (+151/‑484) | insH21/oppA | IS5 transposase and trans‑activator/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
Only 100 of 201 total aligned reads displayed.
CTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAT > NC_000913/1300651‑1300747 | gaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaat < 1:5629720‑M2/2‑1 (MQ=255)gaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaat > 1:665922‑M2/48‑49 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa < 1:247145‑M2/4‑1 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa < 1:5798535‑M2/4‑1 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaata < 1:94519‑M2/3‑1 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaata < 1:3374102‑M2/3‑1 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaata < 1:7213599‑M2/3‑1 (MQ=255) atgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataata < 1:3535619‑M2/6‑1 (MQ=255) atgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataata < 1:6186409‑M2/6‑1 (MQ=255) tgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataa > 1:3207180‑M2/44‑50 (MQ=255) tgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataa < 1:8245078‑M2/7‑1 (MQ=255) atattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataat < 1:1753424‑M2/8‑1 (MQ=255) atattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataat < 1:5951094‑M2/8‑1 (MQ=255) atattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataat < 1:7082367‑M2/8‑1 (MQ=255) atattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataat < 1:5688534‑M2/8‑1 (MQ=255) tattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATc > 1:1682769‑M2/41‑49 (MQ=255) tattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATc > 1:7817450‑M2/41‑49 (MQ=255) tattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCa < 1:7639289‑M2/10‑1 (MQ=255) ttattaattccactgcgtttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAAt < 1:8185544‑M2/12‑1 (MQ=255) ttattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCaa < 1:2717544‑M2/11‑1 (MQ=255) ttattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCaa < 1:2764841‑M2/11‑1 (MQ=255) attaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAAtt < 1:647078‑M2/13‑1 (MQ=255) attaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTg > 1:65786‑M2/37‑50 (MQ=255) attaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTg > 1:4163491‑M2/37‑50 (MQ=255) attaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTg > 1:1046640‑M2/37‑50 (MQ=255) aattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGtt > 1:1016209‑M2/34‑49 (MQ=255) aattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGtt < 1:6302356‑M2/16‑1 (MQ=255) attccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaa < 1:3882472‑M2/18‑1 (MQ=255) attccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaa < 1:3798202‑M2/18‑1 (MQ=255) attccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaa < 1:2576448‑M2/18‑1 (MQ=255) attccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTa > 1:5903039‑M2/33‑49 (MQ=255) attccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTa > 1:7414794‑M2/33‑49 (MQ=255) attccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTa > 1:2179792‑M2/33‑49 (MQ=255) attccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTa > 1:4947839‑M2/33‑49 (MQ=255) ttccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaaa < 1:2980752‑M2/19‑1 (MQ=255) ttccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaaa > 1:1484616‑M2/32‑50 (MQ=255) ttccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaaa > 1:3323217‑M2/32‑50 (MQ=255) ttccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaaa > 1:2511296‑M2/32‑50 (MQ=255) tccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAat > 1:7375518‑M2/31‑50 (MQ=255) tccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAat > 1:5139166‑M2/31‑50 (MQ=255) ccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAat > 1:6638080‑M2/30‑49 (MQ=255) ccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAat < 1:6417001‑M2/20‑1 (MQ=255) ccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAat < 1:5966263‑M2/20‑1 (MQ=255) cactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAatta < 1:1348643‑M2/22‑1 (MQ=255) cactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAatta > 1:1286668‑M2/29‑50 (MQ=255) cactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAatta > 1:1512974‑M2/29‑50 (MQ=255) cactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAatta > 1:5871496‑M2/29‑50 (MQ=255) cactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAatta > 1:4700414‑M2/29‑50 (MQ=255) cactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAatta < 1:4586823‑M2/22‑1 (MQ=255) cactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAatt < 1:1249474‑M2/21‑1 (MQ=255) ctgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattatt > 1:7999540‑M2/27‑50 (MQ=255) tgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtg > 1:7565378‑M2/26‑50 (MQ=255) tgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtg > 1:520575‑M2/26‑50 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg < 1:3115325‑M2/27‑1 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgt < 1:4534888‑M2/26‑1 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgt < 1:1819788‑M2/26‑1 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgt < 1:1928484‑M2/26‑1 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtg < 1:5588100‑M2/25‑1 (MQ=255) ctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg > 1:8233226‑M2/23‑49 (MQ=255) ctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGc < 1:6711265‑M2/28‑1 (MQ=255) ctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGc < 1:2148969‑M2/28‑1 (MQ=255) tttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCa > 1:6510941‑M2/22‑50 (MQ=255) tggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAtt > 1:432618‑M2/20‑50 (MQ=255) tggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAt < 1:2563300‑M2/30‑1 (MQ=255) ggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAtt < 1:887527‑M2/31‑1 (MQ=255) gtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAttt < 1:1143121‑M2/32‑1 (MQ=255) gtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAttt < 1:7991988‑M2/32‑1 (MQ=255) gtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAttt < 1:2403267‑M2/32‑1 (MQ=255) tagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa < 1:4428089‑M2/34‑1 (MQ=255) tagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa < 1:8050891‑M2/34‑1 (MQ=255) tagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa > 1:7536857‑M2/17‑50 (MQ=255) agaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac > 1:7271118‑M2/16‑50 (MQ=255) agaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac > 1:6802173‑M2/16‑50 (MQ=255) agaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac > 1:2651262‑M2/16‑50 (MQ=255) gaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac > 1:4157330‑M2/15‑49 (MQ=255) gaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac > 1:5733678‑M2/15‑49 (MQ=255) gaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac < 1:4787124‑M2/35‑1 (MQ=255) aggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCacta > 1:6135449‑M2/14‑50 (MQ=255) aggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCacta < 1:1453724‑M2/37‑1 (MQ=255) gaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactact < 1:8202286‑M2/39‑1 (MQ=255) aaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTg > 1:3984449‑M2/11‑50 (MQ=255) aaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTg < 1:5570751‑M2/40‑1 (MQ=255) aaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTg < 1:5329929‑M2/40‑1 (MQ=255) aaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTg > 1:5312672‑M2/11‑50 (MQ=255) aagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTg > 1:4137017‑M2/10‑49 (MQ=255) gtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGaa < 1:5114961‑M2/43‑1 (MQ=255) tgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAAc > 1:20607‑M2/7‑50 (MQ=255) ctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACt < 1:425069‑M2/45‑1 (MQ=255) ctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTg > 1:346527‑M2/5‑50 (MQ=255) ctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTg > 1:5910953‑M2/5‑50 (MQ=255) taaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTg > 1:699916‑M2/4‑49 (MQ=255) taaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTg > 1:3395539‑M2/4‑49 (MQ=255) aaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGt > 1:7852698‑M2/3‑49 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGt < 1:4989717‑M2/47‑1 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTaa > 1:3254996‑M2/2‑50 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTaa < 1:8113327‑M2/49‑1 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTa < 1:3834966‑M2/48‑1 (MQ=255) ataataatCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAt < 1:7676457/50‑1 (MQ=255) ataataatCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAt > 1:6937752/1‑50 (MQ=255) ataataatCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAt < 1:3063584/50‑1 (MQ=255) | CTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAT > NC_000913/1300651‑1300747 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |