| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,388,889 | Δ9,734 bp | ycjG–[uspE] | ycjG, mpaA, ymjC, ymjD, ycjY, pgrR, mppA, ynaI, insH‑4, ynaJ, [uspE] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1388889 | 1398622 | 9734 | 139 [0] | [0] 145 | ycjG–[uspE] | ycjG,mpaA,ymjC,ymjD,ycjY,pgrR,mppA,ynaI,insH‑4,ynaJ,[uspE] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1388888 | 0 (0.000) | 137 (1.290) | 68/96 | 0.0 | 100% | intergenic (‑77/‑42) | tpx/ycjG | lipid hydroperoxide peroxidase/L‑Ala‑D/L‑Glu epimerase |
| ? | NC_000913 | 1398623 = | 0 (0.000) | intergenic (‑1/+151) | uspE/fnr | universal stress protein with a role cellular motility/DNA‑binding transcriptional dual regulator FNR | |||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCTTAATCCGCAGACCACCGCGACAACAAGGAGTAAAGATGAGAA > NC_000913/1388840‑1388936 | aCGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTa > 1:6102318‑M1/1‑49 (MQ=255) cGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTac < 1:7746565‑M1/50‑3 (MQ=255) cGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTac < 1:1277751‑M1/50‑3 (MQ=255) cGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTa > 1:6187375‑M1/1‑48 (MQ=255) cGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTa > 1:76174‑M1/1‑48 (MQ=255) cGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTa > 1:720651‑M1/1‑48 (MQ=255) gTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTa > 1:7560645‑M1/1‑47 (MQ=255) gTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTa > 1:4687520‑M1/1‑47 (MQ=255) tCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacag < 1:4123332‑M1/50‑5 (MQ=255) tCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacag > 1:6312487‑M1/1‑46 (MQ=255) tCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacag > 1:6774054‑M1/1‑46 (MQ=255) tCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacag > 1:5120834‑M1/1‑46 (MQ=255) cacaCCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagg > 1:7470548‑M1/1‑45 (MQ=255) acacCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacaggg > 1:3516521‑M1/1‑44 (MQ=255) acacCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacaggg < 1:1504953‑M1/50‑7 (MQ=255) cacCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggt > 1:5819645‑M1/1‑43 (MQ=255) acCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtc > 1:419710‑M1/1‑42 (MQ=255) acCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtc < 1:858191‑M1/50‑9 (MQ=255) ccTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtct > 1:8001458‑M1/1‑41 (MQ=255) ccTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtct < 1:8073334‑M1/50‑10 (MQ=255) ccTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtct < 1:6444882‑M1/50‑10 (MQ=255) ccTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtct < 1:4574881‑M1/50‑10 (MQ=255) cTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctc > 1:2982963‑M1/1‑40 (MQ=255) 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cTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgt < 1:6587956‑M1/50‑25 (MQ=255) cTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgt < 1:5658934‑M1/50‑25 (MQ=255) tGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgt > 1:4289174‑M1/1‑25 (MQ=255) tGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgt > 1:7495251‑M1/1‑25 (MQ=255) tCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaa > 1:3098687‑M1/1‑23 (MQ=255) tCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaa > 1:6011516‑M1/1‑23 (MQ=255) tCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaa > 1:5530846‑M1/1‑23 (MQ=255) tCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtca < 1:7118648‑M1/49‑27 (MQ=255) cAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaac > 1:7492218‑M1/1‑22 (MQ=255) cAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaac > 1:5390752‑M1/1‑22 (MQ=255) aaTAACACAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaac < 1:608098‑M1/49‑29 (MQ=255) aaTAACACAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaac < 1:6985620‑M1/49‑29 (MQ=255) tAACACAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacg > 1:7172848‑M1/1‑19 (MQ=255) acacAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagt < 1:5788999‑M1/50‑34 (MQ=255) acacAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagt < 1:1930222‑M1/50‑34 (MQ=255) acacAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcag < 1:2071329‑M1/49‑33 (MQ=255) acaGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagttt < 1:6335001‑M1/50‑36 (MQ=255) acaGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagttt > 1:8098970‑M1/1‑15 (MQ=255) acaGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagttt > 1:1222426‑M1/1‑15 (MQ=255) caGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttg < 1:8307368‑M1/50‑37 (MQ=255) caGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttg < 1:5013254‑M1/50‑37 (MQ=255) caGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttg < 1:3266769‑M1/50‑37 (MQ=255) aGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttg > 1:3229459‑M1/1‑13 (MQ=255) aGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttg > 1:5564952‑M1/1‑13 (MQ=255) gCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgta < 1:3835222‑M1/50‑39 (MQ=255) gCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgt > 1:6691951‑M1/1‑12 (MQ=255) cAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaa > 1:6964943‑M1/1‑11 (MQ=255) cAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaa > 1:7238473‑M1/1‑11 (MQ=255) cAAACGCTATTacagggtctacttacaacaactgtcaacgcagtttgtaa < 1:7992255‑M1/50‑40 (MQ=255) aaaCGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaat > 1:633965‑M1/1‑10 (MQ=255) aaCGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaatt < 1:336206‑M1/50‑42 (MQ=255) aaCGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaatt < 1:6635872‑M1/50‑42 (MQ=255) aaCGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaatt < 1:7003476‑M1/50‑42 (MQ=255) aaCGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaatt < 1:5060591‑M1/50‑42 (MQ=255) aaCGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaat > 1:3858762‑M1/1‑9 (MQ=255) aCGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaatt > 1:5171673‑M1/1‑8 (MQ=255) aCGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaatt > 1:5644207‑M1/1‑8 (MQ=255) cGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaatta > 1:2077174‑M1/1‑7 (MQ=255) cGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaatta > 1:4006096‑M1/1‑7 (MQ=255) gCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaaa < 1:1867578‑M1/50‑45 (MQ=255) gCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaa > 1:7343775‑M1/1‑6 (MQ=255) gCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaa > 1:7982131‑M1/1‑6 (MQ=255) gCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaa > 1:3154474‑M1/1‑6 (MQ=255) gCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaa > 1:2782337‑M1/1‑6 (MQ=255) ttacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaaaagat > 1:3811989‑M1/1‑2 (MQ=255) ttacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaaaagat < 1:5712372‑M1/50‑49 (MQ=255) ttacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaaaagat < 1:6609352‑M1/50‑49 (MQ=255) ttacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaaaaga < 1:4258930‑M1/49‑48 (MQ=255) ttacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaaaag < 1:390103‑M1/48‑47 (MQ=255) ttacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaaaag < 1:5584442‑M1/48‑47 (MQ=255) ttacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaaaag < 1:2183796‑M1/48‑47 (MQ=255) ttacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaaaag < 1:6454662‑M1/48‑47 (MQ=255) tacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaaaagat > 1:5641358‑M1/1‑1 (MQ=255) | ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCTTAATCCGCAGACCACCGCGACAACAAGGAGTAAAGATGAGAA > NC_000913/1388840‑1388936 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |