| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,994,992 | Δ3,877 bp | [ygeL]–ygeQ | [ygeL], ygeN, ygeO, insD‑4, insC‑4, ygeP, ygeQ | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2994992 | 2998868 | 3877 | 176 [0] | [0] 180 | [ygeL]–ygeQ | [ygeL],ygeN,ygeO,insD‑4,insC‑4,ygeP,ygeQ |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2994991 | 0 (0.000) | 165 (1.590) | 77/94 | 0.0 | 100% | pseudogene (102/156 nt) | ygeL | protein YgeL |
| ? | NC_000913 | 2998869 = | 0 (0.000) | intergenic (‑41/+115) | ygeQ/glyU | protein YgeQ/tRNA‑Gly | |||||
Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
CCCTTTCATAAAATATTCCATCAATCGTTTGTTAAAAGCGTAGATAACCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTACAAAA > NC_000913/2998820‑2998918 | tgtagatttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagccca > 1:6730689‑M2/50‑50 (MQ=255) tagatttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagccca < 1:4841512‑M2/1‑1 (MQ=255) tagatttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccAc < 1:3897213‑M2/2‑1 (MQ=255) tagatttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACt > 1:6516448‑M2/48‑50 (MQ=255) tagatttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACt > 1:1888863‑M2/48‑50 (MQ=255) tagatttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACt < 1:2268912‑M2/3‑1 (MQ=255) gatttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACtt < 1:6699830‑M2/4‑1 (MQ=255) gatttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTa < 1:6896493‑M2/5‑1 (MQ=255) atttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTAt > 1:5329890‑M2/45‑50 (MQ=255) atttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTAt < 1:6363178‑M2/6‑1 (MQ=255) atttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTAt > 1:8288143‑M2/45‑50 (MQ=255) tttgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTAtt < 1:8014759‑M2/7‑1 (MQ=255) tgttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTAttt > 1:5927245‑M2/42‑49 (MQ=255) gttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTaa > 1:7918856‑M2/41‑50 (MQ=255) gttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTaa > 1:2106182‑M2/41‑50 (MQ=255) gttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTa < 1:5292404‑M2/9‑1 (MQ=255) gttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTa < 1:6656242‑M2/9‑1 (MQ=255) ttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTaa < 1:7335949‑M2/10‑1 (MQ=255) ttacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTaa < 1:7365736‑M2/10‑1 (MQ=255) tacactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTaac > 1:1222023‑M2/39‑49 (MQ=255) acactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTaaca < 1:117394‑M2/12‑1 (MQ=255) cactccgctatagctttcttcagatctttatagcccCCTTATTTaacaac > 1:2228077‑M2/37‑50 (MQ=255) cactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTaacaac < 1:3585928‑M2/14‑1 (MQ=255) cactccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTaacaac > 1:3786941‑M2/37‑50 (MQ=255) actccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACt < 1:7047755‑M2/15‑1 (MQ=255) actccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACt > 1:674401‑M2/36‑50 (MQ=255) actccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACt < 1:4237748‑M2/15‑1 (MQ=255) ctccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACtt < 1:324329‑M2/16‑1 (MQ=255) ctccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACtt < 1:5555066‑M2/16‑1 (MQ=255) ccgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTg > 1:5665995‑M2/33‑49 (MQ=255) cgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTg < 1:7606499‑M2/17‑1 (MQ=255) cgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGaa < 1:2754744‑M2/19‑1 (MQ=255) cgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGaa < 1:4746730‑M2/19‑1 (MQ=255) cgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGa > 1:4622442‑M2/32‑49 (MQ=255) cgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGa < 1:4658485‑M2/18‑1 (MQ=255) cgctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGa < 1:3316794‑M2/18‑1 (MQ=255) gctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGaaa < 1:3968565‑M2/20‑1 (MQ=255) ctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGaaaa > 1:4990407‑M2/30‑50 (MQ=255) ctatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGaaaa < 1:1740651‑M2/21‑1 (MQ=255) tatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGaaaa > 1:2603525‑M2/29‑49 (MQ=255) tatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGaaaa > 1:5685102‑M2/29‑49 (MQ=255) tatagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGaaaa > 1:4871815‑M2/29‑49 (MQ=255) tagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAAt > 1:2598337‑M2/27‑48 (MQ=255) tagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAAt < 1:5506757‑M2/22‑1 (MQ=255) tagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATaa < 1:2174038‑M2/24‑1 (MQ=255) tagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATa < 1:146958‑M2/23‑1 (MQ=255) tagctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATa < 1:7851788‑M2/23‑1 (MQ=255) agctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAg > 1:920420‑M2/26‑50 (MQ=255) gctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAgg < 1:1182951‑M2/26‑1 (MQ=255) gctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAgg > 1:848298‑M2/25‑50 (MQ=255) gctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAg < 1:4561698‑M2/25‑1 (MQ=255) ctttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGgt < 1:4295009‑M2/27‑1 (MQ=255) tttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGgtg > 1:5895390‑M2/23‑50 (MQ=255) ttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGgtgt > 1:3858569‑M2/22‑50 (MQ=255) ttcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGgtgt > 1:1759667‑M2/22‑50 (MQ=255) tcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGgtgt < 1:758522‑M2/29‑1 (MQ=255) tcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGgtg < 1:6612844‑M2/28‑1 (MQ=255) tcttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGgtg < 1:3931516‑M2/28‑1 (MQ=255) cttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGttt > 1:1545832‑M2/20‑50 (MQ=255) cttcagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGtt < 1:1204242‑M2/30‑1 (MQ=255) cagatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTAc > 1:5865331‑M2/17‑50 (MQ=255) agatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTAcc > 1:5300943‑M2/16‑50 (MQ=255) agatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTAcc < 1:7881152‑M2/35‑1 (MQ=255) agatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTAcc < 1:2958080‑M2/35‑1 (MQ=255) agatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTAc < 1:4296343‑M2/34‑1 (MQ=255) agatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTAc < 1:7377197‑M2/34‑1 (MQ=255) gatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCt < 1:1012434‑M2/36‑1 (MQ=255) gatctttatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCt < 1:3172963‑M2/36‑1 (MQ=255) tatagcccTCTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGtttt < 1:380634‑M2/32‑1 (MQ=255) tatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGtttt < 1:4969600‑M2/32‑1 (MQ=255) tatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGtttt < 1:887479‑M2/32‑1 (MQ=255) tatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGtttt < 1:4166253‑M2/32‑1 (MQ=255) tatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGttt < 1:6190754‑M2/31‑1 (MQ=255) tatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGttt < 1:6105076‑M2/31‑1 (MQ=255) tatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGttt < 1:3447143‑M2/31‑1 (MQ=255) tatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTgg < 1:1128384‑M2/38‑1 (MQ=255) tatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTgg < 1:6962511‑M2/38‑1 (MQ=255) tatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTg < 1:314211‑M2/37‑1 (MQ=255) tatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGgtt < 1:2565501‑M2/41‑1 (MQ=255) tatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGgtt < 1:2795979‑M2/41‑1 (MQ=255) tatagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGgtt < 1:7148208‑M2/41‑1 (MQ=255) atagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGgttgt > 1:2696632‑M2/8‑50 (MQ=255) atagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGgttg < 1:8266146‑M2/42‑1 (MQ=255) tagcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGgttgt < 1:2524223‑M2/43‑1 (MQ=255) gcccACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTa < 1:1659649‑M2/45‑1 (MQ=255) 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1:4169522/1‑48 (MQ=255) aCTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTACaa > 1:4655419/1‑48 (MQ=255) aCTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTACaa > 1:6228728/1‑48 (MQ=255) | CCCTTTCATAAAATATTCCATCAATCGTTTGTTAAAAGCGTAGATAACCACTTATTTAACAACTTGAAAATAAGGTGTTTTACCTGGGTTGTTACAAAA > NC_000913/2998820‑2998918 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |