Missing coverage evidence...
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*	*	÷	NC_000913	3423698–3424234	3426804–3424653	420–3107	23 [18]	[17] 23	[rrfD]–rrlD	[rrfD],rrlD

ATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACAC  >  NC_000913/3423648‑3423709                                                  |             atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              <  1:7534162/50‑1 (MQ=255) atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:4499769/1‑50 (MQ=255)  tatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:7473148/1‑49 (MQ=255)  tatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:4070638/1‑49 (MQ=255)    tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg              >  1:6200366/1‑47 (MQ=255)    tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgag           <  1:5842464/50‑1 (MQ=255)    tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGga            <  1:2890739/49‑1 (MQ=255)    tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGga            <  1:6048788/49‑1 (MQ=255)     cAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgaga          >  1:3311868/1‑50 (MQ=255)     cAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgaga          >  1:2305088/1‑50 (MQ=255)      aGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAc         <  1:3467034/50‑1 (MQ=255)       gCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAcc        <  1:2576866/50‑1 (MQ=255)       gCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAcc        <  1:429491/50‑1 (MQ=255)         aCGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAcccc      <  1:4973317/50‑1 (MQ=255)          cGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCca     >  1:4250297/1‑50 (MQ=40)          cGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCca     <  1:6215365/50‑1 (MQ=40)           gCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCca     >  1:565252/1‑49 (MQ=38)           gCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCca     >  1:5352559/1‑49 (MQ=38)            cTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcaca   >  1:351834/1‑50 (MQ=38)            cTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcaca   >  1:7967900/1‑50 (MQ=38)             tAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCacac  >  1:738512/1‑50 (MQ=35)             tAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCacac  >  1:740044/1‑50 (MQ=35)             tAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCacac  >  1:2812218/1‑50 (MQ=35)                                                  |             ATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACAC  >  NC_000913/3423648‑3423709

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑