| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 389,898 | Δ9,908 bp | yaiT–[yaiZ] | yaiT, insF‑2, insE‑2, yaiT, iprA, ampH, sbmA, yaiW, yaiY, [yaiZ] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 389898 | 399805 | 9908 | 118 [0] | [0] 120 | yaiT–[yaiZ] | yaiT,insF‑2,insE‑2,yaiT,iprA,ampH,sbmA,yaiW,yaiY,[yaiZ] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 389897 | 0 (0.000) | 115 (1.300) | 69/98 | 0.0 | 100% | intergenic (‑170/‑354) | hemB/yaiT | porphobilinogen synthase/putative autotransporter YaiT |
| ? | NC_000913 | 399806 = | 0 (0.000) | intergenic (+1/+23) | yaiZ/ddlA | DUF2754 domain‑containing protein YaiZ/D‑alanine‑‑D‑alanine ligase A | |||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
AATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/389850‑389897‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTAT > NC_000913/399806‑399854 AATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTG < 1:4288381/49‑1AATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTG > 1:914411/1‑49 ATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTGAA > 1:3550249/1‑50 ATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTGAA > 1:2723711/1‑50 ATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTGAA > 1:1313706/1‑50 ATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTGA < 1:1379072/49‑1 GAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTGAATA < 1:1842876/49‑1 GAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTGAATA < 1:6170515/49‑1 GAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTGAATA < 1:6219683/49‑1 AAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTGAATATT < 1:962628/50‑1 AAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTGAATATT < 1:5598061/50‑1 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1:1823624/1‑50 ATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCG > 1:409036/1‑50 TAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGT < 1:2592144/50‑1 TAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGT > 1:5810176/1‑50 TAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGT > 1:661321/1‑50 AATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGT > 1:6281527/1‑49 ATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTA < 1:2674083/50‑1 TTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTA > 1:4818521/1‑49 TTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTA > 1:4230996/1‑49 TTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAA > 1:4022793/1‑49 TTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAA > 1:4500156/1‑50 TTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAA < 1:5723916/49‑1 TTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAA < 1:6212217/49‑1 TATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAA > 1:466001/1‑49 TATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAA > 1:1032351/1‑49 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1:5025787/1‑50 TGAAAATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTG > 1:1966143/1‑50 GAAAATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGT > 1:809658/1‑50 GAAAATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGT > 1:6495331/1‑50 AAAATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTG > 1:4583657/1‑50 AAAATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTG < 1:2613533/50‑1 AAAATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTG > 1:4904738/1‑50 AAAATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGT < 1:6596702/49‑1 AAATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGG > 1:4748749/1‑50 AAATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGG < 1:4133234/50‑1 AAATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGG > 1:3247842/1‑50 AATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGT > 1:1706421/1‑50 AATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGT > 1:6443776/1‑50 AATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGT < 1:5029847/50‑1 AATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGT < 1:1971147/50‑1 ATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTT > 1:5268874/1‑50 ATATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTT > 1:3393971/1‑50 TATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTT < 1:1450572/50‑1 ATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTT > 1:1065490/1‑50 ATTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTT > 1:1683728/1‑50 TTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTC < 1:4106262/50‑1 TTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTC < 1:5772738/50‑1 TTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTT > 1:1276261/1‑49 TTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTT < 1:1813772/49‑1 TTTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTT > 1:835208/1‑49 TTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTC > 1:5850701/1‑49 TTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTC > 1:6218115/1‑49 TTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTC > 1:2494204/1‑49 TTTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTC > 1:3897059/1‑49 TTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAA > 1:5114940/1‑50 TTTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCA < 1:6631568/49‑1 TTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAAT > 1:1906497/1‑50 TTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAAT > 1:4402292/1‑50 TTAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAAT > 1:5714412/1‑50 TAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATG > 1:1443421/1‑50 TAATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAAT < 1:86576/49‑1 AATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGC > 1:2437686/1‑50 AATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATG < 1:6296563/49‑1 ATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCG > 1:3720320/1‑50 ATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCG > 1:5467807/1‑50 ATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCG < 1:2524294/50‑1 ATCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGC < 1:3850155/49‑1 TCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGT > 1:3753062/1‑50 TCTTGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGT > 1:101502/1‑50 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |