| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 389,898 | Δ9,908 bp | yaiT–[yaiZ] | yaiT, insF‑2, insE‑2, yaiT, iprA, ampH, sbmA, yaiW, yaiY, [yaiZ] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 389898 | 399805 | 9908 | 118 [0] | [0] 120 | yaiT–[yaiZ] | yaiT,insF‑2,insE‑2,yaiT,iprA,ampH,sbmA,yaiW,yaiY,[yaiZ] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 389897 | 0 (0.000) | 115 (1.300) | 69/98 | 0.0 | 100% | intergenic (‑170/‑354) | hemB/yaiT | porphobilinogen synthase/putative autotransporter YaiT |
| ? | NC_000913 | 399806 = | 0 (0.000) | intergenic (+1/+23) | yaiZ/ddlA | DUF2754 domain‑containing protein YaiZ/D‑alanine‑‑D‑alanine ligase A | |||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
TTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATTTTTTGGAGTTTGGTTGCGCTGC > NC_000913/389848‑389943 | ttAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCtt > 1:4465988/1‑50 (MQ=255) tAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCtt < 1:5167059/49‑1 (MQ=255) tAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCtt > 1:6441595/1‑49 (MQ=255) aaTAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTg < 1:4288381‑M1/49‑2 (MQ=255) aaTAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTg > 1:914411‑M1/1‑48 (MQ=255) aTAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaa > 1:3550249‑M1/1‑47 (MQ=255) aTAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTga < 1:1379072‑M1/49‑3 (MQ=255) gAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatat < 1:1675527‑M1/50‑7 (MQ=255) gAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaata < 1:1842876‑M1/49‑6 (MQ=255) gAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaata < 1:6170515‑M1/49‑6 (MQ=255) aaaCAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatatt < 1:962628‑M1/50‑8 (MQ=255) aaaCAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatatt < 1:5598061‑M1/50‑8 (MQ=255) aaaCAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatat > 1:1144457‑M1/1‑43 (MQ=255) aaaCAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatat > 1:1720515‑M1/1‑43 (MQ=255) aaCAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatatta > 1:1912572‑M1/1‑42 (MQ=255) aaCAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatatta > 1:5696952‑M1/1‑42 (MQ=255) aaCAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatatta < 1:151248‑M1/50‑9 (MQ=255) aCAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattat < 1:759445‑M1/50‑10 (MQ=255) aCAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattat > 1:4840567‑M1/1‑41 (MQ=255) cAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatc < 1:616693‑M1/50‑11 (MQ=255) cAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatc < 1:4083708‑M1/50‑11 (MQ=255) aGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcg < 1:1832590‑M1/50‑12 (MQ=255) aGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcg > 1:934684‑M1/1‑39 (MQ=255) aGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcg < 1:2657086‑M1/50‑12 (MQ=255) cAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcggg < 1:6056889‑M1/50‑14 (MQ=255) cAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcggg < 1:3695185‑M1/50‑14 (MQ=255) aataatTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggc > 1:1823624‑M1/1‑36 (MQ=255) aataatTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggc < 1:2690308‑M1/50‑15 (MQ=255) aataatTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggc > 1:4922431‑M1/1‑36 (MQ=255) ataatTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcg > 1:409036‑M1/1‑35 (MQ=255) taatTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgt < 1:2592144‑M1/50‑17 (MQ=255) taatTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgt > 1:661321‑M1/1‑34 (MQ=255) taatTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgt > 1:5810176‑M1/1‑34 (MQ=255) aatTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgt > 1:6281527‑M1/1‑33 (MQ=255) atTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgtta < 1:2674083‑M1/50‑19 (MQ=255) ttttATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgtta > 1:4818521‑M1/1‑31 (MQ=255) ttttATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgtta > 1:4401565‑M1/1‑31 (MQ=255) ttATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaa > 1:4814136‑M1/1‑29 (MQ=255) ttATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaa > 1:4500156‑M1/1‑29 (MQ=255) ttATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaa < 1:5723916‑M1/49‑21 (MQ=255) ttATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaa < 1:6212217‑M1/49‑21 (MQ=255) tataTTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaa > 1:466001‑M1/1‑28 (MQ=255) tataTTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaa > 1:6638239‑M1/1‑28 (MQ=255) tataTTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaa > 1:1032351‑M1/1‑28 (MQ=255) tataTTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaa > 1:1185779‑M1/1‑28 (MQ=255) tatTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaata < 1:3417456‑M1/49‑24 (MQ=255) atTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatat > 1:1646419‑M1/1‑25 (MQ=255) atTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatat > 1:5654766‑M1/1‑25 (MQ=255) ttCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatatta > 1:1470665‑M1/1‑24 (MQ=255) tCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatatta > 1:2039084‑M1/1‑23 (MQ=255) cACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattaca > 1:2147375‑M1/1‑22 (MQ=255) cACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattac < 1:5385252‑M1/49‑28 (MQ=255) aCTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacat > 1:2746745‑M1/1‑21 (MQ=255) aCTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacat > 1:2989512‑M1/1‑21 (MQ=255) aCTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattaca < 1:4057492‑M1/49‑29 (MQ=255) aCTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattaca < 1:754290‑M1/49‑29 (MQ=255) cTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacatt < 1:5404937‑M1/50‑31 (MQ=255) cTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacatt > 1:5025787‑M1/1‑20 (MQ=255) aaaaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtg > 1:4583657‑M1/1‑17 (MQ=255) aaaaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtg < 1:1837057‑M1/50‑34 (MQ=255) aaaaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtg < 1:2613533‑M1/50‑34 (MQ=255) aaaaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgt < 1:6596702‑M1/49‑33 (MQ=255) aaaaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattg < 1:2307866‑M1/48‑32 (MQ=255) aaaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtgg > 1:3247842‑M1/1‑16 (MQ=255) aaaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtgg < 1:4133234‑M1/50‑35 (MQ=255) aaaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtgg > 1:4748749‑M1/1‑16 (MQ=255) aaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggt < 1:5029847‑M1/50‑36 (MQ=255) aaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggt > 1:6443776‑M1/1‑15 (MQ=255) aaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggt > 1:1706421‑M1/1‑15 (MQ=255) aaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggt < 1:1971147‑M1/50‑36 (MQ=255) atatTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggtt > 1:5268874‑M1/1‑14 (MQ=255) atatTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggtt > 1:3393971‑M1/1‑14 (MQ=255) tatTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttt < 1:1450572‑M1/50‑38 (MQ=255) tatTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttt < 1:633966‑M1/50‑38 (MQ=255) atTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggtttt > 1:1065490‑M1/1‑12 (MQ=255) atTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggtttt > 1:1683728‑M1/1‑12 (MQ=255) tttttAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttc < 1:4106262‑M1/50‑40 (MQ=255) tttttAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttc < 1:5772738‑M1/50‑40 (MQ=255) tttttAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggtttt > 1:1276261‑M1/1‑11 (MQ=255) tttttAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggtttt > 1:835208‑M1/1‑11 (MQ=255) ttttAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttc > 1:6218115‑M1/1‑10 (MQ=255) ttttAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttc > 1:3897059‑M1/1‑10 (MQ=255) tttAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaa > 1:5114940‑M1/1‑9 (MQ=255) tttAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttca < 1:6631568‑M1/49‑41 (MQ=255) ttAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaat > 1:5714412‑M1/1‑8 (MQ=255) ttAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaat > 1:4402292‑M1/1‑8 (MQ=255) ttAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaat > 1:1906497‑M1/1‑8 (MQ=255) ttAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaa < 1:133624‑M1/49‑42 (MQ=255) tAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaatg > 1:1443421‑M1/1‑7 (MQ=255) tAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaat < 1:86576‑M1/49‑43 (MQ=255) aaTCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaatgc > 1:2437686‑M1/1‑6 (MQ=255) aaTCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaatg < 1:6296563‑M1/49‑44 (MQ=255) aaTCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaatg < 1:6156604‑M1/49‑44 (MQ=255) aTCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaatgcg > 1:5467807‑M1/1‑5 (MQ=255) aTCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaatgcg > 1:3720320‑M1/1‑5 (MQ=255) aTCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaatgcg < 1:2524294‑M1/50‑46 (MQ=255) aTCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaatgc < 1:3850155‑M1/49‑45 (MQ=255) tCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaatgcgt > 1:3753062‑M1/1‑4 (MQ=255) tCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaatgcgt > 1:101502‑M1/1‑4 (MQ=255) cTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaatgcgt > 1:4284284‑M1/1‑3 (MQ=255) | TTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATTTTTTGGAGTTTGGTTGCGCTGC > NC_000913/389848‑389943 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |