| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,388,889 | Δ9,734 bp | ycjG–[uspE] | ycjG, mpaA, ymjC, ymjD, ycjY, pgrR, mppA, ynaI, insH‑4, ynaJ, [uspE] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1388889 | 1398622 | 9734 | 83 [0] | [0] 85 | ycjG–[uspE] | ycjG,mpaA,ymjC,ymjD,ycjY,pgrR,mppA,ynaI,insH‑4,ynaJ,[uspE] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1388888 | 0 (0.000) | 83 (0.960) | 54/96 | 0.0 | 100% | intergenic (‑77/‑42) | tpx/ycjG | lipid hydroperoxide peroxidase/L‑Ala‑D/L‑Glu epimerase |
| ? | NC_000913 | 1398623 = | 0 (0.000) | intergenic (‑1/+151) | uspE/fnr | universal stress protein with a role cellular motility/DNA‑binding transcriptional dual regulator FNR | |||||
ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1388840‑1388888‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT > NC_000913/1398623‑1398670 ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA > 1:5941511/1‑50 CGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA > 1:2401904/1‑49 CGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA > 1:324931/1‑49 CGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA > 1:2528283/1‑49 CGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA > 1:6183895/1‑49 GTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA > 1:4721531/1‑48 TCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAG > 1:851219/1‑50 CACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGG > 1:5926207/1‑50 ACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGG < 1:4834229/50‑1 ACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGG < 1:5398530/50‑1 ACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGG > 1:2703950/1‑50 ACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTC < 1:3498243/50‑1 ACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTC > 1:612504/1‑50 CTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTC < 1:1984293/50‑1 TAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCC > 1:4376788/1‑50 TAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCC > 1:2359921/1‑50 AGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCT > 1:4559274/1‑50 AGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCT > 1:2842796/1‑50 GTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTT < 1:4786579/50‑1 GTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCT > 1:20058/1‑49 GTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCT > 1:4965045/1‑49 GTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCC < 1:5949204/48‑1 GTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCC < 1:6339488/48‑1 GTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCC < 1:2912583/48‑1 TATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTAC > 1:421785/1‑49 TATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTAC < 1:3992191/49‑1 ATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAA > 1:2343468/1‑50 ATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACA < 1:5917959/49‑1 ATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACA < 1:5753790/49‑1 TGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAA < 1:1581092/49‑1 TGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAA > 1:4726273/1‑49 GCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAAC > 1:239825/1‑49 CTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAA > 1:6258105/1‑50 AACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACT > 1:6423044/1‑50 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTG < 1:5270605/50‑1 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTG < 1:2111753/50‑1 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACT < 1:4316238/49‑1 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACT < 1:1399732/49‑1 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTAAAACAACT < 1:1006462/49‑1 TGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGT > 1:1883081/1‑49 TCAATAACACAGCAAACGCTCTTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAA > 1:4923801/1‑50 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCA < 1:1295576/49‑1 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCA < 1:5406183/49‑1 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCA < 1:1936860/49‑1 CAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAC > 1:385361/1‑50 CAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAC > 1:3365768/1‑50 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG < 1:1971124/50‑1 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAC < 1:4581256/49‑1 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAC < 1:4466204/49‑1 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAC < 1:352117/49‑1 ATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGC < 1:4016794/50‑1 ATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGC < 1:1504413/50‑1 ATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGC < 1:1621116/50‑1 ATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGC < 1:701561/50‑1 TAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCA < 1:1228365/50‑1 TAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCA < 1:6282321/50‑1 TAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGCCAACGCA < 1:5146267/50‑1 AACACAGCAAACGCTATTCCAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAG > 1:522102/1‑50 ACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGT > 1:1607064/1‑50 ACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAG < 1:1578865/49‑1 CACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTT > 1:2768882/1‑50 CACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTT < 1:5013234/50‑1 ACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTT < 1:3203862/50‑1 ACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTT < 1:5380594/50‑1 ACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTT < 1:1992675/50‑1 CAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTG < 1:3691427/50‑1 AGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTG > 1:5307466/1‑49 GCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGT > 1:60068/1‑49 CAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAA > 1:4533282/1‑50 AAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAT < 1:5740243/50‑1 AACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATT < 1:4388026/50‑1 AACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAT > 1:5823463/1‑49 AACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAT > 1:1291620/1‑49 ACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATT > 1:5513811/1‑49 ACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATT > 1:5419713/1‑49 GCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAA < 1:5729849/50‑1 GCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:6545704/1‑49 CTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:5026030/1‑48 ATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:3459381/1‑46 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT < 1:4539653/50‑1 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAG < 1:196679/48‑1 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAG < 1:1961482/48‑1 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAG < 1:98511/48‑1 ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1388840‑1388888‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT > NC_000913/1398623‑1398670 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |