| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 389,898 | Δ9,908 bp | yaiT–[yaiZ] | yaiT, insF‑2, insE‑2, yaiT, iprA, ampH, sbmA, yaiW, yaiY, [yaiZ] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 389898 | 399805 | 9908 | 105 [0] | [0] 107 | yaiT–[yaiZ] | yaiT,insF‑2,insE‑2,yaiT,iprA,ampH,sbmA,yaiW,yaiY,[yaiZ] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 389897 | 0 (0.000) | 102 (1.040) | 62/98 | 0.0 | 100% | intergenic (‑170/‑354) | hemB/yaiT | porphobilinogen synthase/putative autotransporter YaiT |
| ? | NC_000913 | 399806 = | 0 (0.000) | intergenic (+1/+23) | yaiZ/ddlA | DUF2754 domain‑containing protein YaiZ/D‑alanine‑‑D‑alanine ligase A | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
GGGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTAT > NC_000913/399758‑399854 | aatagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttg > 1:7407399‑M2/49‑49 (MQ=255)aatagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttg < 1:5179811‑M2/1‑1 (MQ=255) atagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGaa > 1:2010551‑M2/48‑50 (MQ=255) atagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGaa < 1:2327400‑M2/3‑1 (MQ=255) atagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGaa > 1:3388877‑M2/48‑50 (MQ=255) atagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGa < 1:144375‑M2/2‑1 (MQ=255) tagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGaa > 1:2604933‑M2/47‑49 (MQ=255) tagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGaa > 1:5596711‑M2/47‑49 (MQ=255) tagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAat < 1:2008286‑M2/4‑1 (MQ=255) tagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAat < 1:3391648‑M2/4‑1 (MQ=255) tagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAat < 1:4524985‑M2/4‑1 (MQ=255) tagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAat < 1:5932023‑M2/4‑1 (MQ=255) gaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAatat < 1:276877‑M2/6‑1 (MQ=255) gaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAatat > 1:5719025‑M2/45‑50 (MQ=255) gaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAata < 1:4610977‑M2/5‑1 (MQ=255) gaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAata < 1:7310049‑M2/5‑1 (MQ=255) aaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAatat > 1:922913‑M2/44‑49 (MQ=255) aacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAAtatta > 1:3588191‑M2/43‑50 (MQ=255) aacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAAtatta < 1:3321330‑M2/8‑1 (MQ=255) aacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAAtatta > 1:643993‑M2/43‑50 (MQ=255) acagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAAtattat > 1:6251097‑M2/42‑50 (MQ=255) cagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATc > 1:4609032‑M2/41‑50 (MQ=255) cagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATc < 1:1691937‑M2/10‑1 (MQ=255) 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attttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGtt > 1:5571110‑M2/33‑49 (MQ=255) attttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTa < 1:5556602‑M2/18‑1 (MQ=255) ttttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTa > 1:1420566‑M2/32‑49 (MQ=255) ttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTaaaa > 1:6880368‑M2/30‑50 (MQ=255) ttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTaaa < 1:441334‑M2/20‑1 (MQ=255) atattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAat < 1:2346760‑M2/22‑1 (MQ=255) tattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAatat < 1:7314306‑M2/24‑1 (MQ=255) tattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAatat > 1:121083‑M2/27‑50 (MQ=255) tattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAatat > 1:106366‑M2/27‑50 (MQ=255) tattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAatat > 1:1463739‑M2/27‑50 (MQ=255) attcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAatat > 1:424486‑M2/26‑49 (MQ=255) ttcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATAtt < 1:2024914‑M2/25‑1 (MQ=255) ttcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATAtt < 1:2152323‑M2/25‑1 (MQ=255) ttcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTa > 1:326334‑M2/25‑50 (MQ=255) ttcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTa < 1:5697684‑M2/26‑1 (MQ=255) ttcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTa > 1:902347‑M2/25‑50 (MQ=255) tcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTa > 1:3769776‑M2/24‑49 (MQ=255) actgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACAt > 1:4758867‑M2/22‑50 (MQ=255) actgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACAt > 1:3112342‑M2/22‑50 (MQ=255) ctgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACAtt < 1:832768‑M2/30‑1 (MQ=255) ctgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACAtt < 1:2417775‑M2/30‑1 (MQ=255) ctgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACAtt > 1:3719974‑M2/21‑50 (MQ=255) tgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtg > 1:6021112‑M2/20‑50 (MQ=255) tgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtg > 1:5720855‑M2/20‑50 (MQ=255) tgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtg > 1:1960129‑M2/20‑50 (MQ=255) gaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtgt > 1:652241‑M2/19‑50 (MQ=255) aaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtgtg > 1:7370857‑M2/18‑50 (MQ=255) aaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtgtg < 1:6181450‑M2/33‑1 (MQ=255) aaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtgtg < 1:2781333‑M2/33‑1 (MQ=255) aaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtgtg > 1:1884442‑M2/18‑50 (MQ=255) aaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtg < 1:1679568‑M2/31‑1 (MQ=255) aaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtg < 1:1719747‑M2/31‑1 (MQ=255) aaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTgg > 1:6070990‑M2/17‑50 (MQ=255) aaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTgg > 1:6473052‑M2/17‑50 (MQ=255) aaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTgg < 1:7116263‑M2/34‑1 (MQ=255) aaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTgg > 1:1322585‑M2/17‑50 (MQ=255) aaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTgg < 1:5308990‑M2/34‑1 (MQ=255) aaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATA‑TACATTGTGGt > 1:4478808‑M2/17‑50 (MQ=255) aatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGt < 1:3196137‑M2/35‑1 (MQ=255) aatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGt > 1:7421571‑M2/16‑50 (MQ=255) aatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGt < 1:193462‑M2/35‑1 (MQ=255) atatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGtt > 1:1352921‑M2/15‑50 (MQ=255) tatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGttt < 1:7419500‑M2/37‑1 (MQ=255) tatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGttt > 1:276260‑M2/14‑50 (MQ=255) tttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGtttt > 1:2258137‑M2/12‑49 (MQ=255) tttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTc < 1:5039796‑M2/39‑1 (MQ=255) tttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTc < 1:5787595‑M2/39‑1 (MQ=255) tttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCa < 1:4467746‑M2/40‑1 (MQ=255) ttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCaa < 1:7214856‑M2/41‑1 (MQ=255) ttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCaa < 1:5112206‑M2/41‑1 (MQ=255) taatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAAt < 1:1581402‑M2/42‑1 (MQ=255) aatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCACTg < 1:501235‑M2/43‑1 (MQ=255) aatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATg < 1:5753733‑M2/43‑1 (MQ=255) aatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATg < 1:5953251‑M2/43‑1 (MQ=255) aatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATg < 1:4431348‑M2/43‑1 (MQ=255) aatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGc > 1:4047738‑M2/7‑50 (MQ=255) atcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGc < 1:2961823‑M2/44‑1 (MQ=255) atcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCg > 1:4796813‑M2/6‑50 (MQ=255) atcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCg > 1:4665669‑M2/6‑50 (MQ=255) atcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCg > 1:4633596‑M2/6‑50 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |