| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,299,499 | Δ1,199 bp | insH21 | insH21 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1299499 | 1300697 | 1199 | 110 [0] | [0] 116 | insH21 | insH21 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1299498 | 0 (0.000) | 100 (1.120) | 59/90 | 0.0 | 100% | intergenic (+253/‑33) | ychE/insH21 | putative inner membrane protein/IS5 transposase and trans‑activator |
| ? | NC_000913 | 1300698 = | 0 (0.000) | intergenic (+151/‑484) | insH21/oppA | IS5 transposase and trans‑activator/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
ACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAT > NC_000913/1300650‑1300747 | tgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgttaaa > 1:879600‑M2/49‑49 (MQ=255)tgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa > 1:2555483‑M2/49‑49 (MQ=255)tgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa > 1:868114‑M2/49‑49 (MQ=255)tgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa > 1:6069039‑M2/49‑49 (MQ=255) gaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaat < 1:5933950‑M2/2‑1 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa > 1:5064930‑M2/47‑50 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa > 1:579503‑M2/47‑50 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa < 1:1682062‑M2/4‑1 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa < 1:3194308‑M2/4‑1 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaata < 1:627885‑M2/3‑1 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaata < 1:4073528‑M2/3‑1 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaata < 1:1722107‑M2/3‑1 (MQ=255) aatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa > 1:7395645‑M2/46‑49 (MQ=255) aatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa > 1:2974242‑M2/46‑49 (MQ=255) tgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataa > 1:2431764‑M2/44‑50 (MQ=255) tgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataa < 1:3710168‑M2/7‑1 (MQ=255) atattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataat < 1:2247364‑M2/8‑1 (MQ=255) tattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATc > 1:838933‑M2/41‑49 (MQ=255) tattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATc > 1:5191333‑M2/41‑49 (MQ=255) tattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCa < 1:2301403‑M2/10‑1 (MQ=255) attattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCaa > 1:1924943‑M2/40‑50 (MQ=255) attattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCaa > 1:6891383‑M2/40‑50 (MQ=255) ttattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCaa < 1:2800012‑M2/11‑1 (MQ=255) ttattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAAt > 1:6658588‑M2/39‑50 (MQ=255) ttattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAAt > 1:539221‑M2/39‑50 (MQ=255) attaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAAtt < 1:4089206‑M2/13‑1 (MQ=255) attaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAAtt < 1:2906‑M2/13‑1 (MQ=255) attaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTg > 1:1601646‑M2/37‑50 (MQ=255) ttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTg < 1:2283287‑M2/14‑1 (MQ=255) ttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTg < 1:5067125‑M2/14‑1 (MQ=255) ttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGt > 1:4397001‑M2/36‑50 (MQ=255) ttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGt < 1:4915895‑M2/15‑1 (MQ=255) taattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGt > 1:2401395‑M2/35‑49 (MQ=255) taattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGt > 1:626840‑M2/35‑49 (MQ=255) taattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGt > 1:3682996‑M2/35‑49 (MQ=255) taattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGt > 1:1935022‑M2/35‑49 (MQ=255) aattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGtt > 1:4083994‑M2/34‑49 (MQ=255) aattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGtt > 1:4181408‑M2/34‑49 (MQ=255) attccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTa < 1:1970936‑M2/17‑1 (MQ=255) attccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTa > 1:1405970‑M2/33‑49 (MQ=255) ttccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaaa < 1:4277911‑M2/19‑1 (MQ=255) ttccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaaa > 1:6691484‑M2/32‑50 (MQ=255) ttccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaaa > 1:2432728‑M2/32‑50 (MQ=255) tccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAat > 1:1061792‑M2/31‑50 (MQ=255) tccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAat > 1:4125511‑M2/31‑50 (MQ=255) ccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAat < 1:2434001‑M2/20‑1 (MQ=255) actgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattat < 1:1187205‑M2/23‑1 (MQ=255) actgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattat < 1:1567909‑M2/23‑1 (MQ=255) ctgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattatt > 1:2312105‑M2/27‑50 (MQ=255) gcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgt > 1:1253192‑M2/25‑50 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg < 1:4361699‑M2/27‑1 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg > 1:3270058‑M2/24‑50 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg > 1:5763120‑M2/24‑50 (MQ=255) ctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg > 1:226391‑M2/23‑49 (MQ=255) ctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg > 1:5639785‑M2/23‑49 (MQ=255) ctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGc < 1:4776105‑M2/28‑1 (MQ=255) tggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAt < 1:3234354‑M2/30‑1 (MQ=255) ggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAttt > 1:1855754‑M2/19‑50 (MQ=255) gtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAttt > 1:7462169‑M2/18‑49 (MQ=255) gtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAttt > 1:5570841‑M2/18‑49 (MQ=255) gtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc < 1:1327934‑M2/33‑1 (MQ=255) gtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc < 1:711447‑M2/33‑1 (MQ=255) gtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc < 1:3078663‑M2/33‑1 (MQ=255) tagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa < 1:3761201‑M2/34‑1 (MQ=255) tagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa > 1:743999‑M2/17‑50 (MQ=255) tagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa > 1:1589447‑M2/17‑50 (MQ=255) agaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac > 1:890648‑M2/16‑50 (MQ=255) agaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac > 1:3891639‑M2/16‑50 (MQ=255) agaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac > 1:1406771‑M2/16‑50 (MQ=255) gaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCact < 1:4446846‑M2/36‑1 (MQ=255) gaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac < 1:1745895‑M2/35‑1 (MQ=255) gaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac < 1:5272523‑M2/35‑1 (MQ=255) gaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac < 1:6485472‑M2/35‑1 (MQ=255) gaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac > 1:2840586‑M2/15‑49 (MQ=255) aggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCacta > 1:480775‑M2/14‑50 (MQ=255) ggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactac > 1:7160582‑M2/13‑50 (MQ=255) gaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactact < 1:5812179‑M2/39‑1 (MQ=255) gaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactact < 1:1121858‑M2/39‑1 (MQ=255) aaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTg < 1:4392701‑M2/40‑1 (MQ=255) aagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTgg < 1:6314614‑M2/41‑1 (MQ=255) agtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTgg > 1:4902729‑M2/9‑49 (MQ=255) agtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGa < 1:3944989‑M2/42‑1 (MQ=255) gtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGaa < 1:6137073‑M2/43‑1 (MQ=255) gtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGaa > 1:4935264‑M2/8‑50 (MQ=255) tgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAAc > 1:6793703‑M2/7‑50 (MQ=255) gctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACt > 1:5474589‑M2/6‑50 (MQ=255) ctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTg > 1:4278540‑M2/5‑50 (MQ=255) ctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTg < 1:805038‑M2/46‑1 (MQ=255) taaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTg > 1:5997637‑M2/4‑49 (MQ=255) aaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGt > 1:4790526‑M2/3‑49 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTaa > 1:5678116‑M2/2‑50 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTa < 1:1075534‑M2/48‑1 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTa < 1:4242334‑M2/48‑1 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTa < 1:821850‑M2/48‑1 (MQ=255) ataataatCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAt > 1:1013325/1‑50 (MQ=255) ataataatCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAt > 1:2172442/1‑50 (MQ=255) ataataatCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAt < 1:3805785/50‑1 (MQ=255) ataataatCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAt < 1:6946810/50‑1 (MQ=255) ataataatCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAt < 1:4091475/50‑1 (MQ=255) ataataatCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAt > 1:6621936/1‑50 (MQ=255) | ACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAT > NC_000913/1300650‑1300747 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |