| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,388,889 | Δ9,734 bp | ycjG–[uspE] | ycjG, mpaA, ymjC, ymjD, ycjY, pgrR, mppA, ynaI, insH‑4, ynaJ, [uspE] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1388889 | 1398622 | 9734 | 94 [0] | [0] 96 | ycjG–[uspE] | ycjG,mpaA,ymjC,ymjD,ycjY,pgrR,mppA,ynaI,insH‑4,ynaJ,[uspE] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1388888 | 0 (0.000) | 93 (0.970) | 57/96 | 0.0 | 100% | intergenic (‑77/‑42) | tpx/ycjG | lipid hydroperoxide peroxidase/L‑Ala‑D/L‑Glu epimerase |
| ? | NC_000913 | 1398623 = | 0 (0.000) | intergenic (‑1/+151) | uspE/fnr | universal stress protein with a role cellular motility/DNA‑binding transcriptional dual regulator FNR | |||||
ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCTTAATCCGCAGACCACCGCGACAACAAGGAGTAAAGATGAGAA > NC_000913/1388840‑1388936 | aCGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTa > 1:3956763‑M1/1‑49 (MQ=255)aCGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTa > 1:754046‑M1/1‑49 (MQ=255)aCGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATT < 1:6548760‑M1/49‑1 (MQ=255) cGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTac < 1:1225547‑M1/50‑3 (MQ=255) gTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTa > 1:4088806‑M1/1‑47 (MQ=255) gTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTa > 1:6247978‑M1/1‑47 (MQ=255) tCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacag > 1:6447434‑M1/1‑46 (MQ=255) acacCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacaggg > 1:595885‑M1/1‑44 (MQ=255) acacCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacaggg > 1:146021‑M1/1‑44 (MQ=255) acacCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacaggg > 1:5984460‑M1/1‑44 (MQ=255) acacCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacaggg > 1:6711966‑M1/1‑44 (MQ=255) acacCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacaggg > 1:7215619‑M1/1‑44 (MQ=255) acacCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacaggg > 1:6943171‑M1/1‑44 (MQ=255) cacCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggt < 1:2771748‑M1/50‑8 (MQ=255) acCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtc > 1:6290501‑M1/1‑42 (MQ=255) acCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtc > 1:4116789‑M1/1‑42 (MQ=255) ccTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtct > 1:6573834‑M1/1‑41 (MQ=255) ccTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtct > 1:7308322‑M1/1‑41 (MQ=255) cTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctc > 1:4804123‑M1/1‑40 (MQ=255) cTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctc > 1:3629547‑M1/1‑40 (MQ=255) tAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctcc > 1:3070768‑M1/1‑39 (MQ=255) aGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctcct > 1:7153251‑M1/1‑38 (MQ=255) aGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTacagggtctcct > 1:4386683‑M1/1‑38 (MQ=255) 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aTAACACAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacg > 1:5134315‑M1/1‑20 (MQ=255) aTAACACAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacg > 1:2187439‑M1/1‑20 (MQ=255) aTAACACAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacg > 1:2770742‑M1/1‑20 (MQ=255) tAACACAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgca < 1:5826228‑M1/50‑32 (MQ=255) aaCACAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcag > 1:1129442‑M1/1‑18 (MQ=255) aaCACAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcag > 1:4208793‑M1/1‑18 (MQ=255) acacAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagt < 1:1369138‑M1/50‑34 (MQ=255) acacAGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagt > 1:5660190‑M1/1‑17 (MQ=255) cacaGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtt > 1:5037390‑M1/1‑16 (MQ=255) cacaGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtt < 1:3096149‑M1/50‑35 (MQ=255) acaGCAAGCGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagttt < 1:3151121‑M1/50‑36 (MQ=255) acaGCAAACGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagttt > 1:5226820‑M1/1‑15 (MQ=255) 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aaCGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaat > 1:174085‑M1/1‑9 (MQ=255) aCGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaatta < 1:5104159‑M1/50‑43 (MQ=255) aCGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaatt > 1:4117647‑M1/1‑8 (MQ=255) aCGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaatt > 1:1077083‑M1/1‑8 (MQ=255) aCGCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaatt > 1:3467259‑M1/1‑8 (MQ=255) gCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaaa < 1:3762671‑M1/50‑45 (MQ=255) gCTATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaaa < 1:505215‑M1/50‑45 (MQ=255) tATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaa > 1:5806476‑M1/1‑4 (MQ=255) tATTacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaa > 1:173995‑M1/1‑4 (MQ=255) ttacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaaaagat > 1:2340929‑M1/1‑2 (MQ=255) ttacagggtctccttacaacaactgtcaacgcagtttgtaattaaaagat > 1:325767‑M1/1‑2 (MQ=255) | ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCTTAATCCGCAGACCACCGCGACAACAAGGAGTAAAGATGAGAA > NC_000913/1388840‑1388936 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |