| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,388,889 | Δ9,734 bp | ycjG–[uspE] | ycjG, mpaA, ymjC, ymjD, ycjY, pgrR, mppA, ynaI, insH‑4, ynaJ, [uspE] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1388889 | 1398622 | 9734 | 94 [0] | [0] 96 | ycjG–[uspE] | ycjG,mpaA,ymjC,ymjD,ycjY,pgrR,mppA,ynaI,insH‑4,ynaJ,[uspE] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1388888 | 0 (0.000) | 93 (0.970) | 57/96 | 0.0 | 100% | intergenic (‑77/‑42) | tpx/ycjG | lipid hydroperoxide peroxidase/L‑Ala‑D/L‑Glu epimerase |
| ? | NC_000913 | 1398623 = | 0 (0.000) | intergenic (‑1/+151) | uspE/fnr | universal stress protein with a role cellular motility/DNA‑binding transcriptional dual regulator FNR | |||||
CGTCCTGGTTAGGATCGATAACAACGAGCATGTTCTGATACATAGCCATACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGATT > NC_000913/1398574‑1398671 | acgtcacacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctatta > 1:754046‑M2/50‑50 (MQ=255)acgtcacacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctatta > 1:3956763‑M2/50‑50 (MQ=255) cgtcacacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattAc < 1:1225547‑M2/2‑1 (MQ=255) gtcacacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctatta > 1:4088806‑M2/48‑48 (MQ=255) gtcacacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctatta > 1:6247978‑M2/48‑48 (MQ=255) tcacacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAg > 1:6447434‑M2/47‑50 (MQ=255) acacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAggg > 1:595885‑M2/45‑50 (MQ=255) acacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAggg > 1:5984460‑M2/45‑50 (MQ=255) acacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAggg > 1:146021‑M2/45‑50 (MQ=255) acacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAggg > 1:7215619‑M2/45‑50 (MQ=255) acacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAggg > 1:6943171‑M2/45‑50 (MQ=255) acacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAggg > 1:6711966‑M2/45‑50 (MQ=255) cacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGt < 1:2771748‑M2/7‑1 (MQ=255) acctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGtc > 1:4116789‑M2/43‑50 (MQ=255) acctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGtc > 1:6290501‑M2/43‑50 (MQ=255) cctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGtct > 1:6573834‑M2/42‑50 (MQ=255) cctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGtct > 1:7308322‑M2/42‑50 (MQ=255) ctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGtctc > 1:3629547‑M2/41‑50 (MQ=255) ctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGtctc > 1:4804123‑M2/41‑50 (MQ=255) tagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTcc > 1:3070768‑M2/40‑50 (MQ=255) agtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCt > 1:4386683‑M2/39‑50 (MQ=255) agtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCt > 1:4308624‑M2/39‑50 (MQ=255) agtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCt > 1:7153251‑M2/39‑50 (MQ=255) gtttatggtaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTcc < 1:5296320‑M2/11‑1 (MQ=255) gtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTcc < 1:3279690‑M2/11‑1 (MQ=255) gtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCtt < 1:4271440‑M2/13‑1 (MQ=255) gtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCtt < 1:839620‑M2/13‑1 (MQ=255) gtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCt > 1:2799594‑M2/38‑49 (MQ=255) gtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCt < 1:6328292‑M2/12‑1 (MQ=255) tttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTa < 1:6038384‑M2/14‑1 (MQ=255) ttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTa > 1:6806078‑M2/36‑49 (MQ=255) tatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTac < 1:3133832‑M2/15‑1 (MQ=255) tatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTac < 1:4348086‑M2/15‑1 (MQ=255) atgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTacaa > 1:2438174‑M2/34‑50 (MQ=255) atgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTaca < 1:7488824‑M2/16‑1 (MQ=255) atgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTaca < 1:4301360‑M2/16‑1 (MQ=255) tgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTacaa > 1:7134847‑M2/33‑49 (MQ=255) taactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACaacaac > 1:5777866‑M2/30‑50 (MQ=255) taactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACaacaac > 1:4106978‑M2/30‑50 (MQ=255) actgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACt < 1:3927293‑M2/22‑1 (MQ=255) actgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTg > 1:988424‑M2/28‑50 (MQ=255) actgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTg > 1:2748067‑M2/28‑50 (MQ=255) actgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTg > 1:3594972‑M2/28‑50 (MQ=255) ctgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGt > 1:678171‑M2/27‑50 (MQ=255) ctgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGt < 1:5072892‑M2/24‑1 (MQ=255) tgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGt > 1:5299350‑M2/26‑49 (MQ=255) gtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTc > 1:4702181‑M2/25‑49 (MQ=255) tcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTc < 1:1375117‑M2/25‑1 (MQ=255) tcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCaa < 1:4171544‑M2/27‑1 (MQ=255) tcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCaa < 1:1325198‑M2/27‑1 (MQ=255) tcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCaa < 1:6399736‑M2/27‑1 (MQ=255) tcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCa < 1:6638318‑M2/26‑1 (MQ=255) tcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCa < 1:7423446‑M2/26‑1 (MQ=255) caataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAc > 1:6917280‑M2/23‑50 (MQ=255) aataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAc < 1:4556780‑M2/28‑1 (MQ=255) aataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACg > 1:5552306‑M2/22‑50 (MQ=255) aataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACg > 1:1591751‑M2/22‑50 (MQ=255) ataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACg > 1:2770742‑M2/21‑49 (MQ=255) ataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACg > 1:5134315‑M2/21‑49 (MQ=255) ataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACg > 1:2187439‑M2/21‑49 (MQ=255) ataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGc < 1:3702362‑M2/30‑1 (MQ=255) taacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCa < 1:5826228‑M2/31‑1 (MQ=255) aacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAg > 1:4208793‑M2/19‑50 (MQ=255) aacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAg > 1:1129442‑M2/19‑50 (MQ=255) acacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGt > 1:5660190‑M2/18‑50 (MQ=255) acacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGt < 1:1369138‑M2/33‑1 (MQ=255) cacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGtt < 1:3096149‑M2/34‑1 (MQ=255) cacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGtt > 1:5037390‑M2/17‑50 (MQ=255) acagcaagcgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGttt < 1:3151121‑M2/35‑1 (MQ=255) acagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGttt < 1:3280991‑M2/35‑1 (MQ=255) acagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGttt < 1:7292723‑M2/35‑1 (MQ=255) acagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGttt > 1:5226820‑M2/16‑50 (MQ=255) acagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGttt > 1:2828717‑M2/16‑50 (MQ=255) acagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGttt < 1:4037588‑M2/35‑1 (MQ=255) cagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTg < 1:5111845‑M2/36‑1 (MQ=255) cagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTg > 1:1713963‑M2/15‑50 (MQ=255) agcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTg > 1:6640303‑M2/14‑49 (MQ=255) agcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTg > 1:6889529‑M2/14‑49 (MQ=255) agcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGt < 1:1706350‑M2/37‑1 (MQ=255) gcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGt > 1:5716734‑M2/13‑49 (MQ=255) gcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTa < 1:1828525‑M2/38‑1 (MQ=255) aaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAt > 1:5653977‑M2/11‑50 (MQ=255) aacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAt > 1:174085‑M2/10‑49 (MQ=255) acgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAtt > 1:1077083‑M2/9‑49 (MQ=255) acgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAtt > 1:3467259‑M2/9‑49 (MQ=255) acgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAtt > 1:4117647‑M2/9‑49 (MQ=255) acgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTa < 1:5104159‑M2/42‑1 (MQ=255) gctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTaaa < 1:505215‑M2/44‑1 (MQ=255) gctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTaaa < 1:3762671‑M2/44‑1 (MQ=255) tattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTaa > 1:173995‑M2/5‑47 (MQ=255) tattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTaa > 1:5806476‑M2/5‑47 (MQ=255) ttACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAt > 1:2340929‑M2/3‑50 (MQ=255) ttACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAt > 1:325767‑M2/3‑50 (MQ=255) aCAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAtt < 1:619865/49‑1 (MQ=255) aCAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAtt < 1:4119874/49‑1 (MQ=255) aCAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAtt < 1:426701/49‑1 (MQ=255) | CGTCCTGGTTAGGATCGATAACAACGAGCATGTTCTGATACATAGCCATACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGATT > NC_000913/1398574‑1398671 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |