| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,184,782 | Δ6,916 bp | ubiK–yqiI | ubiK, ygiL, yqiG, insC‑5, insD‑5, yqiG, yqiH, yqiI | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3184782 | 3191697 | 6916 | 93 [0] | [0] 94 | ubiK–yqiI | ubiK,ygiL,yqiG,insC‑5,insD‑5,yqiG,yqiH,yqiI |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3184781 | 0 (0.000) | 90 (0.940) | 62/96 | 0.0 | 100% | intergenic (‑315/‑59) | ribB/ubiK | 3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase/ubiquinone biosynthesis accessory factor UbiK |
| ? | NC_000913 | 3191698 = | 0 (0.000) | intergenic (+2/+41) | yqiI/glgS | putative fimbrial protein YqiI/surface composition regulator | |||||
AGGGACCGTTTAGTAAAGACGTAATCCTGAAAATCACCTATAACTAGTATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCGTTATATCAGTGCTC > NC_000913/3191650‑3191747 | ctaatgattagcggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatat > 1:4911638‑M2/49‑50 (MQ=255) aatgattagcggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATc > 1:5515757‑M2/47‑49 (MQ=255) aatgattagcggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATc > 1:3071635‑M2/47‑49 (MQ=255) aatgattagcggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATc > 1:6627557‑M2/47‑49 (MQ=255) atgattagcggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATc < 1:5768640‑M2/3‑1 (MQ=255) atgattagcggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCt > 1:7193047‑M2/46‑49 (MQ=255) atgattagcggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCt > 1:2495077‑M2/46‑49 (MQ=255) atgattagcggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCt < 1:2397762‑M2/4‑1 (MQ=255) tgattagcggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTaa < 1:3295936‑M2/6‑1 (MQ=255) tgattagcggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTaa > 1:2572477‑M2/45‑50 (MQ=255) tgattagcggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTaa > 1:6302599‑M2/45‑50 (MQ=255) tgattagcggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTaa < 1:2222464‑M2/6‑1 (MQ=255) tgattagcggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTaa < 1:1003652‑M2/6‑1 (MQ=255) attagcggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAAt < 1:3535726‑M2/7‑1 (MQ=255) attagcggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAAt < 1:3729822‑M2/7‑1 (MQ=255) attagcggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATa > 1:5911363‑M2/43‑50 (MQ=255) ttagcggcagccacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATa > 1:7052357‑M2/42‑49 (MQ=255) ttagcggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATAc < 1:3171314‑M2/9‑1 (MQ=255) tagcggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATAc > 1:6715092‑M2/41‑49 (MQ=255) agcggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACa < 1:2971051‑M2/10‑1 (MQ=255) agcggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACa > 1:6507601‑M2/40‑49 (MQ=255) gcggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACaaa > 1:4617911‑M2/39‑50 (MQ=255) gcggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACaaa < 1:5550505‑M2/12‑1 (MQ=255) gcggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACaa < 1:201229‑M2/11‑1 (MQ=255) cggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACaaa > 1:123100‑M2/38‑49 (MQ=255) cggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACaaa > 1:5781040‑M2/38‑49 (MQ=255) cggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAac < 1:3667988‑M2/13‑1 (MQ=255) cggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAac < 1:3008349‑M2/13‑1 (MQ=255) ggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAaca < 1:6923947‑M2/14‑1 (MQ=255) ggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAaca > 1:808799‑M2/37‑50 (MQ=255) ggcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAaca > 1:4409225‑M2/37‑50 (MQ=255) gcagcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAacac < 1:6107360‑M2/15‑1 (MQ=255) agcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACt > 1:6023989‑M2/34‑49 (MQ=255) agcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACt > 1:7054986‑M2/34‑49 (MQ=255) agcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACt > 1:5836676‑M2/34‑49 (MQ=255) agcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACt > 1:3932295‑M2/34‑49 (MQ=255) agcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACt > 1:1297472‑M2/34‑49 (MQ=255) agcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACt > 1:6701599‑M2/34‑49 (MQ=255) gcaacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACTa > 1:1639150‑M2/33‑49 (MQ=255) caacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACTaaa < 1:4711758‑M2/19‑1 (MQ=255) caacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACTaa > 1:6405939‑M2/32‑49 (MQ=255) aacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACTaaaa < 1:5011956‑M2/20‑1 (MQ=255) aacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACTaaaa > 1:715090‑M2/31‑50 (MQ=255) aacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACTaaaa < 1:1118659‑M2/20‑1 (MQ=255) aacgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACTaaaa < 1:3301793‑M2/20‑1 (MQ=255) acgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAAc > 1:7175067‑M2/30‑50 (MQ=255) cgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACg > 1:7240169‑M2/29‑50 (MQ=255) cgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACg > 1:1994426‑M2/29‑50 (MQ=255) cgcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACg < 1:3962862‑M2/22‑1 (MQ=255) gcatagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACgg < 1:1733651‑M2/23‑1 (MQ=255) catagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACggg < 1:5012478‑M2/24‑1 (MQ=255) catagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACggg < 1:6232905‑M2/24‑1 (MQ=255) atagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGc > 1:4789581‑M2/26‑50 (MQ=255) atagcttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGc > 1:4104242‑M2/26‑50 (MQ=255) agcttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCa > 1:1341712‑M2/24‑50 (MQ=255) gcttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCa < 1:930029‑M2/27‑1 (MQ=255) gcttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCAt > 1:3844338‑M2/23‑50 (MQ=255) cttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATc < 1:7276376‑M2/29‑1 (MQ=255) ttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCAt > 1:98508‑M2/21‑48 (MQ=255) ttcacataattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCAt > 1:7478355‑M2/21‑48 (MQ=255) cacataattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAgg > 1:2780690‑M2/19‑50 (MQ=255) cacataattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAg < 1:4095052‑M2/31‑1 (MQ=255) acataattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGc > 1:921573‑M2/18‑50 (MQ=255) acataattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGc > 1:890499‑M2/18‑50 (MQ=255) acataattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGc > 1:806157‑M2/18‑50 (MQ=255) cataattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGcc > 1:5472080‑M2/17‑50 (MQ=255) cataattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGcc < 1:4805648‑M2/34‑1 (MQ=255) ataattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGccc > 1:3935611‑M2/16‑50 (MQ=255) ataattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGccc < 1:7155359‑M2/35‑1 (MQ=255) taattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCg < 1:6296875‑M2/36‑1 (MQ=255) taattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCg < 1:6938619‑M2/36‑1 (MQ=255) aattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCGt > 1:928806‑M2/14‑50 (MQ=255) aattctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCGt > 1:3383630‑M2/14‑50 (MQ=255) attctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCGt < 1:90709‑M2/37‑1 (MQ=255) ttctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCGTta < 1:1844478‑M2/39‑1 (MQ=255) tctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCGTta > 1:147741‑M2/11‑49 (MQ=255) ctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCGTtata > 1:5978335‑M2/10‑50 (MQ=255) ctggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCGTtat < 1:6735642‑M2/40‑1 (MQ=255) tggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCGTTatat > 1:2500441‑M2/9‑50 (MQ=255) tggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCGTTatat > 1:134030‑M2/9‑50 (MQ=255) ggtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCGTTatat > 1:4644717‑M2/8‑49 (MQ=255) gtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCGTtata < 1:5373693‑M2/41‑1 (MQ=255) gtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCGTTATATc < 1:6077191‑M2/43‑1 (MQ=255) gtttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCGTTATATCa < 1:377855‑M2/44‑1 (MQ=255) tttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCGTTATATCAg > 1:7400613‑M2/6‑50 (MQ=255) tttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCGTTATATCAg < 1:1176949‑M2/45‑1 (MQ=255) tttatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCGTTATATCAg > 1:4535665‑M2/6‑50 (MQ=255) tatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCGTTATATCAGt < 1:142742‑M2/46‑1 (MQ=255) tatATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCGTTATATCAGt < 1:596156‑M2/46‑1 (MQ=255) atATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCGTTATATCAGTg < 1:5499203‑M2/47‑1 (MQ=255) tATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCGTTATATCAGTGCt < 1:1571365‑M2/49‑1 (MQ=255) aTCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCGTTATATCAGTGctc > 1:4471540/1‑50 (MQ=255) aTCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCGTTATATCAGTGctc > 1:6849734/1‑50 (MQ=255) aTCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCGTTATATCAGTGctc > 1:2810989/1‑50 (MQ=255) | AGGGACCGTTTAGTAAAGACGTAATCCTGAAAATCACCTATAACTAGTATCTAATACAAACACTAAAACGGGCCATCAGGCCCGTTATATCAGTGCTC > NC_000913/3191650‑3191747 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |