| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3248538 | 282 (1.150) | 9 (0.040) | 8/318 | 12.2 | 3.3% | coding (100/384 nt) | mzrA | modulator of EnvZ/OmpR regulon |
| ? | NC_000913 | = 3248548 | 267 (1.140) | coding (110/384 nt) | mzrA | modulator of EnvZ/OmpR regulon | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 285 total aligned reads displayed.
AAAACGCCGGTATTTTTAAAGTACGAGGACCAGCTGATGTCATGCCTGATGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTGACGCTCATGGCATTCCTTTCAAAAGTATCACCCCCAAAAACGACACTCTGTTAATTACATTTGACTCCAGCGACCAGAGCGCCGCCGCAAAAGCGGTCCTCGACAGAACATTGCCCCATGGCTACATCATTGCGCAGCAGGACAATAACAGTCA > NC_000913/3248301‑3248770 | aaaaCGCCGGTATTTTTAAAGTACGAGGACCAGCTGATGTCATGCCTGATGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCa < 1:3439840/239‑1 (MQ=255) aaaTGCCGATATTTTTAAAGTACGGGCACCAGCTGATGTCATGCCTGATGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAGGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTCCTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCaa < 2:1261252/239‑1 (MQ=255) aCGCCGGTATTTTTAAAGTACGAGGACCAGCTGATGTCATGCCTGATGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCTGCACGCAGTTGCGGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAaga > 2:702110/1‑239 (MQ=255) aTTTTTAAAGTACGAGGACCAGCTGATGTCATGCCTGATGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACg < 2:1111105/238‑1 (MQ=255) aaaGTACGAGGACCAGCTGATGTCATGCCTGATGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACAACGCATGTAGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTTTTGCTGAGCTGGGCTCCGGTTGGCCATCAAAAGTCTTCGCTGGCGa > 2:1465420/1‑239 (MQ=255) aCGAGGACCAGCTGATGTCATGCCTGATGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGAt < 1:3264308/235‑1 (MQ=255) cGAGGACCAGCTGATGTCATGCCTGATGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTCCGCTGGCGATTCGt > 2:3254236/1‑238 (MQ=255) aGCTGATGTCATGCCTGATGCTGCTCCCGGTGGTTCTGCTGGTGTTTGTCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGCGTTATGGCAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTACGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTCTTTCTTGCCGGCACGCTGTTCCCGGCCTGTTCCGCGGTTCGCTAGCAAGCGTCTACGCTTCCGATTAGTGCCGAtcg > 2:2418508/1‑237 (MQ=255) aGCTGATGTCATGCCTGATGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTtca > 2:2865173/1‑238 (MQ=255) tGATGTCATGCCTGATGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTtcatc < 2:1616180/237‑1 (MQ=255) tGATGTCATGCCTGATGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTtcat < 1:1019897/236‑1 (MQ=255) gCCTGATGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAgg > 1:2127082/1‑232 (MQ=255) gCCTGATGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACg > 2:2552983/1‑239 (MQ=255) aTGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACg > 1:1701369/1‑201 (MQ=255) aTGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACg < 2:1701369/201‑1 (MQ=255) tgttattgtcctgctgcTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACg < 1:356361/228‑1 (MQ=255) gctCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACg > 1:613086/1‑239 (MQ=255) ctCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAg > 1:3414191/1‑235 (MQ=255) tCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGt > 1:86874/1‑239 (MQ=255) tgctgcTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTc > 1:2222502/1‑235 (MQ=255) ctgctgGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCg > 1:2661105/1‑199 (MQ=255) tgGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCAt < 2:893678/239‑1 (MQ=255) ggTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATc > 1:950671/1‑239 (MQ=255) gtTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCa > 2:1805020/1‑237 (MQ=255) ttGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCtt < 1:2562053/239‑1 (MQ=255) tGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTg < 2:3162761/239‑1 (MQ=255) ccTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTGAc > 1:176200/1‑238 (MQ=255) 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aaaaGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTAGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGaac > 2:142774/1‑147 (MQ=255) aaGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTGACGCTCATGGCATTCCtt < 1:3035510/223‑1 (MQ=255) aGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTGACGCTCATGGCATTCCTTTCAAAAGTATCAccccc > 1:1994704/1‑239 (MQ=255) aTCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCg > 1:2794784/1‑141 (MQ=255) 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ccGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTGACGCTCATGGCATTCCTTTCAAAAGTATCACCCCCAAAAACGACACTCTGTTAATTACATTTGACTCCAGCGACCAGAGCGCCGCCGCAAAAGCGGTCCt < 2:2688387/238‑1 (MQ=255) gcgcTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTGACGCTCATGGCATTCCTTTCAAAAGTATCACCCCCAAAAACg < 1:3212265/177‑1 (MQ=255) cgcTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTg < 1:3067448/70‑1 (MQ=255) cgcTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTg > 2:3067448/1‑70 (MQ=255) cgcTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTGACGCTCATGGCATTCCTTTCAAAAGTATCACCCCCAAAAACGACACTCTGTTAATTACATTTGACTCCAGCGACCAGAGCGCCGCCGCAAAAGCGGTCCTCGACa > 2:2635964/1‑239 (MQ=255) ttttACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTGACGCTCATGGCATTCCTTTCAAAAGTATCACCCCCAAAAACGACACTCTGTTAATTACATTTGACTCCAGCGACCAGAGCGCCGCCGCAAAAGCGGTCCTCGACAGAACa > 2:2594713/1‑239 (MQ=255) tttACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTTTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTGACGCTCATGGCATTCCTTTCAAAAGTATCCCCCCCAAAAACGACACTCTGTTAATTACATTTGACTCCAGCGACCAGAGCGCCGCCGCAAAAGCGGTCCTCGACAGAACa < 1:1465420/238‑1 (MQ=255) cTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTGACGCTCATGGCATTCCTTTCAAAAGTATCACCCCCAAAAACGACACTCTGTTAATTACATTTGACTCCAGCGACCAGAGCGCCGCCGCAAAAGCGGTCCTCGACAGAACATTGCCCCa > 2:2816743/1‑239 (MQ=255) ggTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTtcat < 1:2004349/73‑1 (MQ=255) ggTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGa > 1:2381220/1‑93 (MQ=255) ggTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTGACGCTCATGGCATTc > 1:3139846/1‑134 (MQ=255) ggTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTGACGCTCATGGCATTCCTTTCAAAAGTATCACCCCCAAAAACg < 1:3241178/161‑1 (MQ=255) ggTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTGACGCTCATGGCATTCCTTTCAAAAGTATCACCCCCAAAAACGacac < 1:1101682/165‑1 (MQ=255) ggTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTGACGCTCATGGCATTCCTTTCAAAAGTATCACCCCCAAAAACGACACTCTGTTAATTACATTTGACTcc > 1:2595896/1‑187 (MQ=255) ggTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTGACGCTCATGGCATTCCTTTCAAAAGTATCACCCCCAAAAACGACACTCTGTTAATTACATTTGACTCCAGCGACCAGAGCGCCGCCGTAAAAGCGGTCCTCGACAGAACATTGCCCCATg > 1:1895409/1‑239 (MQ=255) ggTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTGACGCTCATGGCATTCCTTTCAAAAGTATCACCCCCAAAAACGACACTCTGTTAATTACATTTGACTCCAGCGACCAGAGCGCCGCCGCAAAAg > 1:1839242/1‑212 (MQ=255) ggTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTGACGCTCATGGCATTCCTTTCAAAAGTATCACCCCCAAAAACGACACTCTGTTAATTACATTTGACTCCAGCGACCAGAGCGCCGCCGCAAAAGCGGTCCTCGACAGAACATTGCCCCATg > 1:1347159/1‑239 (MQ=255) ggTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTGACGCTCATGGCATTCCTTTCAAAAGTATCACCCCCAAAAACGACACTCTGTTAATTACATTTGACTCCAGCGACCAGAGCGCCGCCGCAAAAGCGGTCCTCGACAGAACATTGCCCCATg > 2:1231731/1‑239 (MQ=255) ggTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTGACGCTCATGGCATTCCTTTCAAAAGTATCACCCCCAAAAACGACACTCTGTTAATTACATTTGACTCCAGCGACCAGAGCGCCGCCGCAAAAGCGGTCCTCGACAGAACATTGCCCCATg > 2:48832/1‑239 (MQ=255) ggTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTGACGCTCATGGCATTCCTTTCAAAAGTATCACCCCCAAAAACGACACTCTGTTAATTACATTTGACTCCAGCGACCAGAGCGCCGCCGCAAAAGCGGTCCTCGACAGAACATTGCCCCATg > 1:2931279/1‑239 (MQ=255) cACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTGACGCTCATGGCa < 2:3094830/125‑1 (MQ=255) 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ttCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTGACGCTCATGGCATTCCTTTCAAAAGTATCACCCCCAAAAACGACACTCTGTTAATTACATTTGACTCCAGCGACCAGAGCGCCGCCGCAAAAGCGGTCCTCGACAGAACATTGCCCCATGGCTACATCATTGCGCAGCAGGACAATAACAg < 2:950671/238‑1 (MQ=255) | AAAACGCCGGTATTTTTAAAGTACGAGGACCAGCTGATGTCATGCCTGATGCTGCTCCCGGTGGTGCTGCTGGTGTTTGGCCTGGCAGGTTCTCTGGTCGTGTTATGGAAAAAGAAATATGGAAATCGGGGGTAAGGGATGCAAATACCTCGCATGTCGCTTCGCCAGCTAGCCTGGTCCGGCGCTGTTTTACTTCTGGTCGGCACGCTGTTGCTGGCCTGGTCCGCGGTTCGCCAGCAAGAGTCTACGCTGGCGATTCGTGCCGTTCATCAAGGCACAACGATGCCAGACGGTTTTTCAATCTGGCATCACCTTGACGCTCATGGCATTCCTTTCAAAAGTATCACCCCCAAAAACGACACTCTGTTAATTACATTTGACTCCAGCGACCAGAGCGCCGCCGCAAAAGCGGTCCTCGACAGAACATTGCCCCATGGCTACATCATTGCGCAGCAGGACAATAACAGTCA > NC_000913/3248301‑3248770 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |