New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 3670238 | 122 (1.200) | 10 (0.100) | 8/384 | NT | 7.6% | coding (647/1650 nt) | treF | cytoplasmic trehalase |
? | NC_000913 | = 3670407 | 124 (1.250) | coding (816/1650 nt) | treF | cytoplasmic trehalase |
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
ATGCATGGCCGATAACTTCGCCTGGATGATCGAAAACTACGGTCACATCCCCAACGGCAACCGCACCTATTATTTGAGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTGGCTGCGTGATACTGGTCGTCTGGCGAGCATTCGTACCACCCAGTTCATCCCCATCGA > NC_000913/3670173‑3670640 | aTGCATGGCCGATAACTTCGCCTGGATGATCGAAAACTACGGTCACATCCCCAACGGCAACCGCACCTATTATTTGAGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCGGAATCGTTAATCCCTAATCAGTCCTATCGCCATGTTgtgc < 1:252648‑M2/239‑5 (MQ=255) 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catGGATGATCGAAATCTACGGTCACATCCCAAACGTCAACCGCACCTATTAGTTGAGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCgctg < 2:751704/237‑1 (MQ=255) tgatCGAAAACTACGGTCACATCCCCAACGGCAACCGCACCTATTATTTGAGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCaa < 2:1139532/238‑1 (MQ=255) tgatCGAAAACTACGGTCACATCCCCAACGGCAACCGCACCTATTATTTGAGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCaa < 2:140179/238‑1 (MQ=255) 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aGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTgtgcggttgccgttggggatgtgaccgtagttttcgatcatccaggcgaagttatcggccatgcatttcagcaaatctt < 2:893493‑M2/238‑80 (MQ=255) aGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACt < 2:1062121/196‑1 (MQ=255) aGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACt > 1:1062121/1‑196 (MQ=255) aGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTggg > 1:1182743/1‑199 (MQ=255) 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2:393993/1‑238 (MQ=255) attgccctgtgggatggcCGGTGCAGAATCGATAATCCCTAACCAGGCCTTTCGCCGTGTGGGGCGGAGGCCGGACGGTTCGCTGCCCACCCGTTACTGGGCCGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTgg < 2:958339/227‑1 (MQ=255) tGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGCCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCTTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTGGCTGc > 1:762207/1‑239 (MQ=255) gCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTa > 2:602277/1‑221 (MQ=255) 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aaTCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTGGCTGCGTGATACTGGTCGTCTGGCGAGCATTCGTACCACCCa > 1:1055126/1‑239 (MQ=255) aTCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTGGCTGCGTGATACTGGTCGTCTGGCGAGCATTCGTaccac > 1:669929/1‑235 (MQ=255) gCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTgg < 1:528918/192‑1 (MQ=255) gCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTgg > 2:528918/1‑192 (MQ=255) 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| ATGCATGGCCGATAACTTCGCCTGGATGATCGAAAACTACGGTCACATCCCCAACGGCAACCGCACCTATTATTTGAGCCGCTCGCAACCACCGGTTTTTGCGCTGATGGTGGAGTTGTTTGAAGAAGATGGTGTACGCGGTGCGCGCCGCTATCTCGACCACCTTAAAATGGAATATGCCTTCTGGATGGACGGTGCAGAATCGTTAATCCCTAATCAGGCCTATCGCCATGTTGTGCGGATGCCGGACGGATCGCTGCTCAACCGTTACTGGGACGATCGCGACACGCCGCGTGACGAATCCTGGCTTGAGGACGTTGAAACCGCGAAACATTCTGGTCGCCCGCCCAACGAGGTGTACCGCGATTTACGCGCGGGGGCGGCCTCCGGTTGGGATTACTCTTCCCGTTGGCTGCGTGATACTGGTCGTCTGGCGAGCATTCGTACCACCCAGTTCATCCCCATCGA > NC_000913/3670173‑3670640 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |