| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 419210 = | 126 (0.940) | 22 (0.180) | 16/178 | 9.4 | 16.1% | intergenic (+26/‑381) | phoR/brnQ | sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with PhoB/branched‑chain amino acid transport system 2 carrier protein; LIV‑II transport system for Ile, Leu, and Val |
| ? | NC_000913 | 419234 = | 115 (0.940) | intergenic (+50/‑357) | phoR/brnQ | sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with PhoB/branched‑chain amino acid transport system 2 carrier protein; LIV‑II transport system for Ile, Leu, and Val | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
GAGTACAGTAGGAAAAGGAACACGTTTCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCATGTC > NC_000913/419112‑419308 | gagTACAGTAGGAAAAGGAACACGTTTCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCa > 2:944047/1‑99 (MQ=255)gagTACAGTAGGAAAAGGAACACGTTTCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCa < 1:1171785/99‑1 (MQ=255) tACAGTAGGAAAAGGAACACGTTTCGGTTTTGTTATCTCGGAACGTGTAATTGCCAAAAACAGCGGTTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATaa < 1:3232233/99‑1 (MQ=255) cAGTAGGAAAAGGAACACGGTTCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAGCAGCGATTATTCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATACGc < 2:301474/99‑1 (MQ=255) tAGGAAAAGGAACACGTTTCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAATAGCGATTAATCGGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAg > 2:2513498/1‑99 (MQ=255) tAGGAAAAGGAACACGTTTCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAg < 1:844863/99‑1 (MQ=255) tAGGAAAAGGAACACGTTTCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAg > 2:1346421/1‑99 (MQ=255) aGGAAAAGGAACACGTTTCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGt < 1:1306132/99‑1 (MQ=255) aGGAAAAGGAACACGTTTCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGt > 1:2334052/1‑99 (MQ=255) gAAAAGGAACACGTTTCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCg > 2:708893/1‑99 (MQ=255) gAAAAGGAACACGTTTCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCg > 1:935097/1‑99 (MQ=255) aaaGGAACACGTTTCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGAt < 2:1755844/99‑1 (MQ=255) aaaGGAACACGTTTCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGAt > 1:2181131/1‑99 (MQ=255) aaGGAACACGTTTCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATg < 1:952342/99‑1 (MQ=255) aaGGAACACGTTTCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATg > 1:843012/1‑99 (MQ=255) ggAACACGTTTCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCt > 1:821307/1‑99 (MQ=255) ggAACACGTTTCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCt > 1:821244/1‑99 (MQ=255) gagcacGTTTCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCAATAAGCCAGTCGATGCTg > 2:1163493/4‑99 (MQ=255) aaCACGTTTCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTgg > 1:1310437/1‑99 (MQ=255) acacGTTTCAGCTTTGTTATCCCGGAGCGTTTAATTGCGGAAAACAGCGTTTAATCCGCCTTT‑GTAATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGGTGCTGGc > 2:882925/1‑99 (MQ=255) cacGTTTCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCt < 2:2034942/99‑1 (MQ=255) gTTTCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTAt < 2:2403954/99‑1 (MQ=255) gTTTCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTAt < 2:228825/99‑1 (MQ=255) ttCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAATCAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTAttt > 2:1630634/1‑99 (MQ=255) tCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTAtttt > 2:1975100/1‑99 (MQ=255) tCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTAtttt > 2:1148837/1‑99 (MQ=255) cAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTc > 1:1522942/1‑99 (MQ=255) aGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCt > 2:3286033/1‑99 (MQ=255) gTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCtt < 2:2725235/99‑1 (MQ=255) gTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCtt < 2:1807364/99‑1 (MQ=255) ttttGTTGTCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAATCAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGTCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCttt < 2:802897/99‑1 (MQ=255) tttGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTg < 2:1073345/99‑1 (MQ=255) gTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAg > 1:1329921/1‑99 (MQ=255) tCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCaa > 1:1376235/1‑99 (MQ=255) cccGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCaaa < 1:396983/99‑1 (MQ=255) ccGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCaaaa > 1:932409/1‑99 (MQ=255) ccGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCaaaa > 2:1946371/1‑99 (MQ=255) ccGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCaaaa < 1:2346608/99‑1 (MQ=255) cGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGACTTATTTTCTTTGCAGTCAAAAt > 2:1239275/1‑99 (MQ=255) cGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTGTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCGTTGCAGTCAAAAt > 1:3137771/1‑99 (MQ=255) ggAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATa < 1:244144/99‑1 (MQ=255) ggAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATa < 1:916386/99‑1 (MQ=255) aCGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACgg < 2:782473/99‑1 (MQ=255) cGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACggg < 1:1079259/99‑1 (MQ=255) tttAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCg > 2:318634/1‑99 (MQ=255) tttAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCg > 2:1640078/1‑99 (MQ=255) ttAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGt > 2:3198459/1‑99 (MQ=255) aaTTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTa < 2:1545455/99‑1 (MQ=255) aaTTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTa > 2:1985311/1‑99 (MQ=255) aTTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAg > 2:2864158/1‑99 (MQ=255) ttGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGa > 2:1305863/1‑99 (MQ=255) ttGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGa > 1:3370205/1‑99 (MQ=255) tGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGAt < 1:1042625/99‑1 (MQ=255) gCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGAtt < 1:1546731/99‑1 (MQ=255) ccAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGAttt > 1:540497/1‑99 (MQ=255) ccAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGAttt > 1:636689/1‑99 (MQ=255) cAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGAtttt > 2:2527781/1‑99 (MQ=255) cAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GCCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTAGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGAtttt > 2:977467/1‑99 (MQ=255) aaaaaCAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTa > 1:1844055/1‑99 (MQ=255) aaaaaCAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTa > 1:2178658/1‑99 (MQ=255) aaCAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACaa < 1:618336/99‑1 (MQ=255) aaCAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACaa > 1:2741696/1‑99 (MQ=255) aGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGa < 2:804452/99‑1 (MQ=255) gCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGAt < 2:1104873/99‑1 (MQ=255) gCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGAt < 2:363944/99‑1 (MQ=255) cGATTGATCCGCCTTTGGTAATC‑TTTATTTCCATAAGCCAGTGGATGCTCGCTTATTTTCATATCAGTCAAAATACGGGCGATAGCTTTTACAACgttc > 2:1895970/1‑96 (MQ=255) gATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTg < 1:2905844/99‑1 (MQ=255) aTTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTgg < 1:52256/99‑1 (MQ=255) aTTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTgg < 1:1714439/99‑1 (MQ=255) aTTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTgg > 1:2461829/1‑99 (MQ=255) aTTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTgg < 2:2091794/99‑1 (MQ=255) ttAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGt < 1:2579071/99‑1 (MQ=255) ttAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGt < 1:2633419/99‑1 (MQ=255) aaTCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGa < 1:649982/99‑1 (MQ=255) aTCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGAt > 2:1794183/1‑99 (MQ=255) aTCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGAt < 2:1447271/99‑1 (MQ=255) ccGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGAttt < 2:3127567/99‑1 (MQ=255) cGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGAtttt > 1:2544585/1‑99 (MQ=255) gCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGAttttt > 2:487508/1‑99 (MQ=255) ccTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGAtttttt < 2:3029079/99‑1 (MQ=255) tt‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGtt < 1:1105081/99‑1 (MQ=255) tCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGc < 1:1854968/99‑1 (MQ=255) tCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGc > 2:2638239/1‑99 (MQ=255) cATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCa < 2:2282104/99‑1 (MQ=255) cATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCa < 1:1997165/99‑1 (MQ=255) aTCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCAt < 1:919008/99‑1 (MQ=255) aTCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCAt > 2:34982/1‑99 (MQ=255) aTCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCAt < 1:3081725/99‑1 (MQ=255) tCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATg > 1:3376738/1‑99 (MQ=255) cTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGa > 1:2148657/1‑99 (MQ=255) cTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGa > 1:3475226/1‑99 (MQ=255) ttttATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGAt > 1:54948/1‑99 (MQ=255) tATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAg > 1:2437113/1‑99 (MQ=255) aTTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGc < 2:1026169/99‑1 (MQ=255) ttGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGcc > 1:2714128/1‑99 (MQ=255) tGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCa > 1:1234198/1‑99 (MQ=255) ccATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCATg > 1:1021279/1‑99 (MQ=255) ccATAAGCCAGTCGATGCCGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCATg > 1:2965813/1‑99 (MQ=255) cATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCATGt > 1:671765/1‑99 (MQ=255) aTAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCATGTc > 1:885106/1‑99 (MQ=255) | GAGTACAGTAGGAAAAGGAACACGTTTCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCATGTC > NC_000913/419112‑419308 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |