New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2042116 = | 112 (1.040) | 4 (0.040) | 4/276 | 16.4 | 3.7% | intergenic (+91/‑252) | zinT/yodB | zinc and cadmium binding protein, periplasmic/cytochrome b561 homolog |
? | NC_000913 | 2042149 = | 105 (1.050) | intergenic (+124/‑219) | zinT/yodB | zinc and cadmium binding protein, periplasmic/cytochrome b561 homolog | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
ATCCATATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATAT > NC_000913/2041973‑2042262 | atCCATATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGa < 2:1361425/149‑1 (MQ=255) tCCATATCAGTTGAGTAGAGAATAAGAGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACACCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCCTCCACAAACGCAACTGAACGCAAGCTAGCTACAGac > 2:119704/1‑149 (MQ=255) atatTAGTTAAGTAGCGAAGAAGTTGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCTCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACg < 2:241671/149‑1 (MQ=255) atatCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAACCGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACg > 1:252985/1‑149 (MQ=255) tatCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑CCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGc < 2:1317716/149‑1 (MQ=255) gAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACt < 2:363040/149‑1 (MQ=255) attAGCGAAGAAGGGGTCGAGGAAAGGATGTCTCATTGAGTATTCTCAGGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTa < 2:376588/147‑1 (MQ=255) ggaGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTAt < 2:1508316/147‑1 (MQ=255) atcGAAGAAGTGGGCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGa < 2:1197705/147‑1 (MQ=255) aGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTCAGCCTGCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGa > 2:1630281/1‑149 (MQ=255) gCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGAc > 1:971255/1‑149 (MQ=255) cGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTAAAGACACGATCATCACTATGACg > 1:1115990/1‑149 (MQ=255) cGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCAACAAGCGCCGCTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACTCTCATCGCTATGACg > 2:61104/1‑149 (MQ=255) agaagTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTGTCATGCTAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATGCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGAGACGCTCACCACTATGACgtgt < 1:1260885/149‑1 (MQ=255) agaagTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACgtgt < 1:1680899/149‑1 (MQ=255) aagTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCCTCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACACTCATCACTATGACTTGTCt > 2:482742/1‑149 (MQ=255) aagTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCt < 2:398945/149‑1 (MQ=255) agTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTg < 1:1449444/149‑1 (MQ=255) 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cGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATAtt < 1:1780063/149‑1 (MQ=255) aGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGGGTCTGTATATtaa > 2:1434073/1‑149 (MQ=255) ggAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGTATGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATAGtaat > 1:1466789/1‑149 (MQ=255) ggAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATtaat < 2:1609167/149‑1 (MQ=255) ggAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGGGTCTGTATATtaat > 1:111376/1‑149 (MQ=255) gAAATGATGTCTCATTGAGTATTATCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATtaata > 1:960777/1‑149 (MQ=255) aaaTGATTTCTCAGTGAGTATTCTTATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGTTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGCCGTGTCTGTATATtaataa < 2:569561/149‑1 (MQ=255) aaaTGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATtaataa < 2:1712479/149‑1 (MQ=255) aaTGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGGCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAg < 2:1394285/149‑1 (MQ=255) tgTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAAc < 2:1410016/149‑1 (MQ=255) ctcATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATACACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGAAGTGTCTGTATATCAATAAGCTAAGCCg > 2:1206364/1‑149 (MQ=255) tcATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGc > 1:412401/1‑149 (MQ=255) aTTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCAt < 1:394780/149‑1 (MQ=255) aTTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCAt > 2:1728985/1‑149 (MQ=255) ttGAGTATTCTCATGATAACGCCTCTATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCAtt > 1:1063749/1‑149 (MQ=255) ttGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCAtt > 1:502506/1‑149 (MQ=255) ttCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTaa < 2:761021/149‑1 (MQ=255) ctcATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGAAACCATCATCACTATGACGTGTCTGTAAATTAATAAGCTAACCCGCATTCAGTTAAcc > 1:684426/1‑149 (MQ=255) cATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCaa > 2:1461068/1‑149 (MQ=255) tGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATa > 1:1720833/1‑149 (MQ=255) 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ccaCAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACAGGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACAAATACCGGATTCAATACACAATACGGCCAACAAAGAAAGGTACCTGTGCTCACGCCa > 1:401486/1‑149 (MQ=255) ccaCAAACGCCACTGAACGCAAGCGAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCa < 2:896175/149‑1 (MQ=255) acaAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCAtt < 2:1451650/149‑1 (MQ=255) acaAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCAtt > 1:851614/1‑149 (MQ=255) acaAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCAtt > 1:870393/1‑149 (MQ=255) aaCGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCt > 2:91858/1‑149 (MQ=255) aCGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCtt < 1:1587110/149‑1 (MQ=255) cACTGAACGCATGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTatat < 2:1289461/149‑1 (MQ=255) cACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTatat < 1:1338550/149‑1 (MQ=255) cACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTATCGTTATTATAATCCGATAACCGGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTatat > 1:866176/1‑149 (MQ=255) cTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTg > 1:654596/1‑149 (MQ=255) atGAACTCAAGCGAGCTACAGACCCGCTCATTACTATAACGTGTCTGTATCTTAATAGGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGTCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTg < 2:1180714/148‑1 (MQ=255) aaCGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCATTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTTACGCCAGTGCTTATATTGGCt < 2:1538594/149‑1 (MQ=255) acgcacgcTAGCTACAGACACGGTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTg < 2:1228518/149‑1 (MQ=255) aCGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTg < 2:1426552/149‑1 (MQ=255) cGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACACTACGGCCAACAGAGGAAACTACCTGTGCTCAGACCATTGCTTATATTGGCTgg > 2:1657324/1‑149 (MQ=255) cGCAAGCTAGCTACAGACACGCCTATCCCTACGTCGTGCCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTgg < 1:96048/149‑1 (MQ=255) cGCAAGCTACGTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATCTTAATAAGCTAACCCGCATTGATTTAACCAATAACGTATTCCATACACAATACTGCCAACATAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTgg < 1:604822/149‑1 (MQ=255) agagagctaCATACACGCGCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAAGAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTAc < 1:14967/145‑1 (MQ=255) gctagctaCAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAAACCGCATTGAGTTAACCAATAACGGACTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACTCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACa > 2:957349/1‑149 (MQ=255) gcgagcgaCAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACa < 1:1730952/146‑1 (MQ=255) gctaCAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAatat > 1:1469683/1‑149 (MQ=255) | ATCCATATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATAT > NC_000913/2041973‑2042262 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |