| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 2042116 = | 112 (1.040) | 4 (0.040) | 4/276 | 16.4 | 3.7% | intergenic (+91/‑252) | zinT/yodB | zinc and cadmium binding protein, periplasmic/cytochrome b561 homolog |
| ? | NC_000913 | 2042149 = | 105 (1.050) | intergenic (+124/‑219) | zinT/yodB | zinc and cadmium binding protein, periplasmic/cytochrome b561 homolog | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTAAATAACAAATTATTAAAA > NC_000913/2042001‑2042297 | ggTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACGCGCTCATCACTATGACGTGTCTGtat > 1:1740801/1‑149 (MQ=255) gTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTCTGACGTGTCTGtata > 2:679772/1‑149 (MQ=255) gTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGGGTCTGtata > 1:73805/1‑149 (MQ=255) cGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATAtt < 1:1780063/149‑1 (MQ=255) aGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGGGTCTGTATATtaa > 2:1434073/1‑149 (MQ=255) ggAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGTATGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATAGtaat > 1:1466789/1‑149 (MQ=255) ggAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATtaat < 2:1609167/149‑1 (MQ=255) ggAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGGGTCTGTATATtaat > 1:111376/1‑149 (MQ=255) gAAATGATGTCTCATTGAGTATTATCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATtaata > 1:960777/1‑149 (MQ=255) aaaTGATTTCTCAGTGAGTATTCTTATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGTTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGCCGTGTCTGTATATtaataa < 2:569561/149‑1 (MQ=255) aaaTGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATtaataa < 2:1712479/149‑1 (MQ=255) aaTGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGGCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAg < 2:1394285/149‑1 (MQ=255) tgTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAAc < 2:1410016/149‑1 (MQ=255) 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cGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACACTACGGCCAACAGAGGAAACTACCTGTGCTCAGACCATTGCTTATATTGGCTgg > 2:1657324/1‑149 (MQ=255) cGCAAGCTACGTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATCTTAATAAGCTAACCCGCATTGATTTAACCAATAACGTATTCCATACACAATACTGCCAACATAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTgg < 1:604822/149‑1 (MQ=255) agagagctaCATACACGCGCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAAGAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTAc < 1:14967/145‑1 (MQ=255) gctagctaCAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAAACCGCATTGAGTTAACCAATAACGGACTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACTCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACa > 2:957349/1‑149 (MQ=255) gcgagcgaCAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACa < 1:1730952/146‑1 (MQ=255) ctagctaCAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACaa > 1:765368/1‑149 (MQ=255) gctaCAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAatat > 1:1469683/1‑149 (MQ=255) aCAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCa < 1:1073744/149‑1 (MQ=255) aGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTAACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACt > 1:1108853/1‑149 (MQ=255) acacGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTAt > 1:120167/1‑149 (MQ=255) gCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCCTTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAAt > 2:1009124/1‑149 (MQ=255) catcaCTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAAtttt < 1:208027/149‑1 (MQ=255) catcaCTATGACGTGTCTGTATATTAAAAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAAtttt < 2:412401/149‑1 (MQ=255) caCTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTa > 2:819138/1‑149 (MQ=255) aCTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCACATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTaa < 1:1558967/149‑1 (MQ=255) aTGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTAAATa > 2:1174536/1‑149 (MQ=255) aTGACGCGACTGTAGATGAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTCACCAATCACGGACTCCATACACAACACGGCCAACCGAGAAAGATACCCGGGCTCCCGCCATTGCTTATAATGGCTGGTTACAATATGCACTACCAATTTTTCAAATa < 2:1604811/149‑1 (MQ=255) gtgtCTGTCTATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGCGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATCCACTATCAATTTTTTAAATAACaaa > 1:1591919/1‑149 (MQ=255) gtgtCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTAAATAACaaa < 1:1728985/149‑1 (MQ=255) gtgtCTGTATAGTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTAAATAACaaa < 2:1063749/149‑1 (MQ=255) tCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTAAATAACAAatta < 1:413078/149‑1 (MQ=255) tatTAATAAGCTAAACCGCATTGAGTTAACCAATAAAGGATTCAATACACAATACGGCCAAAAGAGAAAGATACCTGTGCTGACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTAAAATATGCACTATCAATTTTTTAAATAAAAAATTATTaaaa > 2:1345443/1‑149 (MQ=255) | GGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTA‑TCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTAAATAACAAATTATTAAAA > NC_000913/2042001‑2042297 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |