| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 4,188,484 | Δ27 bp | 100% | coding (3136‑3162/4224 nt) | rpoC → | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4188484 | 4188510 | 27 | 84 [0] | [0] 84 | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4188483 | 0 (0.000) | 74 (1.170) | 57/268 | NT | 100% | coding (3135/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| ? | NC_000913 | 4188511 = | 0 (0.000) | coding (3163/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit | |||||
CAAAGTACCTTACGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4188333‑4188483‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGG > NC_000913/4188511‑4188655 CAAAGTACCTTACGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGA > 2:778197/1‑149 AAAGTACCTTACGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCGCACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGGTGTGGACGCTTTACTAATATGATCGAAGGACAGgc > 2:1046245/1‑147 AGTACCTTACGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCG < 2:74230/149‑1 ACCTTACGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCCAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTC < 1:1022937/149‑1 CCTTACGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCT < 1:907875/149‑1 TTACGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGGTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTGTTGTACGCGTTACTGACTTGCTCGCCGGCCAGGCCGGTgcgt > 1:482718/1‑145 ACGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTGTTGTACGCGTTACTGACATGATCGACGGCCAGGCCGGTCTGTCT > 2:910062/1‑149 ACGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAAACGTTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAGCTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGGCT > 2:819118/1‑149 GTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGT > 2:160998/1‑149 GTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGT < 2:769804/149‑1 ACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGG > 2:889167/1‑149 GCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCT > 1:30180/1‑149 GCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGGCTGTCTTCGCTGGTGGTTCT > 1:428898/1‑149 CGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTG < 1:860822/149‑1 GAAGGGCGATGGCGAACATGTTGCTGGCGCCGAAACCGTTGCAACCTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACTGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGG < 2:892501/149‑1 AGGCGATGGCGAACCGGTGGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCATCCCATGCCGGTTATCACCGGAGTACGCGGTTTTTTACGCTTTACTGACATGGTCGAGGGCCAGACCGGGCTGTCTTCTCTGGGGGTGCTGGATT < 2:516803/149‑1 AGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATT < 1:1069327/149‑1 ATGGCGAACAGGCTGCTGGCGGCGAACCCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCA < 2:1011736/149‑1 GCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAA > 1:874521/1‑149 GAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGCCGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTCGGTTCCGCAGAACG > 1:345353/1‑149 GAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACAGGGACCCGCACACGATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACG > 1:741777/1‑149 cagtgTGCTGGCGGCGAAACCGTTTCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTAC < 1:653968/144‑1 CAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTAC < 1:536011/149‑1 GTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGACCGTACCGC > 1:193017/1‑149 TTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCA > 1:412402/1‑149 GCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGG < 2:552560/149‑1 GGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTATGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGG < 2:1107663/149‑1 cCGGCGGACCCGTGCCAAACTGGGACCCGCACACGCTCCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGTCATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTTGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGT < 2:755963/148‑1 GCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGGTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGT > 1:177366/1‑149 CGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCAGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAG > 1:785472/1‑149 AAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACCCCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGCACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGTATTCCACTTATGCTACCGCAGCTGGTAAAGAT < 2:824096/149‑1 ACCGTTGCAAACTGGGCCGGCCACACCGTGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCT < 2:1096413/149‑1 CCGTTGCAAACTGGGCCCCGCACCCCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTG < 2:1020966/149‑1 GTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCG > 1:763623/1‑149 CAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCG > 1:998895/1‑149 CAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGAACTGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCG < 2:698738/149‑1 CAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTCTGTACGCTTTACTGACATGCTAGACGACCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGCTCTGGCTTCCGCAGAACGTACCGCAGGGGGGAACGATCTGCGgcgg > 2:431470/1‑145 aacCTGGGTCCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGG < 2:1120461/146‑1 AAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCCTTACCGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTGCTGGAGTCCGCAGACCATCCCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGG > 2:736366/1‑149 AAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTAGCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGAGATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCGGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGG > 1:749216/1‑149 AACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGC > 1:414766/1‑149 CTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCAC < 1:742143/149‑1 GGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTG < 1:575241/149‑1 CCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAACGATCTGCGTCCGGCACTGAAAAT > 1:922589/1‑149 GCACCCCATGCCGTTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCG < 2:367580/149‑1 GCACACCATGCCGGTTATCACCGGAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGTATACGCAGAACGTACCGCAGGTGGGAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCG > 1:606804/1‑149 GCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTCAAGAGCTGCGTCCGCCACTGAAAATCG > 2:1070728/1‑149 GCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGGTTTGTACGCTCAACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCCGCACTGCAAAGCG > 2:297029/1‑149 CCAGGCCGGTTATCACCGAAGGAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGAT < 1:83242/149‑1 CATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACAGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATG > 2:417986/1‑149 CGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAG > 2:652551/1‑149 GTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGG > 1:541152/1‑149 ACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGA > 2:1053692/1‑149 CCGAAGTAAGCGGTTTTGTCCGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGAC < 2:412402/149‑1 CGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCGTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAAgtacg > 1:617346/1‑144 AAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCATGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGACGCTCAGGGTAACGACGTT < 2:741777/149‑1 AAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTT > 1:350522/1‑149 AGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTC < 1:778197/149‑1 AAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGCTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGA < 2:847198/149‑1 GGTTTTGTACGCTTTACCGACATGACCGACGGCCCGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGCTAAACATCGGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCC < 1:612526/149‑1 GTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTACCGACGTTCTGATCCCAGGTAC > 1:155094/1‑149 TACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGGGGTTCGGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCCCTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGCCGTTCTGATCCCAGGTACC > 2:158726/1‑149 TTTACTGACCTGGTCGAGGGCCAGACCGGGCTGTCTTCGCTTGTTGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGCGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATAT < 2:307740/149‑1 TTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTCCCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCAGCAATGCAAGTCGTTGATGCGCAGGGAAACGACGTTCTGATCCCAGGTACAGATgt > 2:322460/1‑147 TTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATAT < 2:681090/149‑1 TACTGACGTGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGCTCCCAGGTACCGATATGC < 2:743948/149‑1 TACTCACTTGATCCACGGCCAGACCTGTCTGTCTTCGCTGGTCTTTCTGGATTCCGCAAAACGTACCGCAAGTTTTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGC < 1:523158/149‑1 TGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGCTCCCAGGTACCGATATGCCAG > 1:149362/1‑149 TGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAG > 1:282659/1‑149 TGACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAG > 1:761322/1‑149 GACATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGC > 1:335143/1‑149 tTGATCGGCGGCCAGACCGGTCTGTCTGCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCA < 2:97539/148‑1 ATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCA < 2:350522/149‑1 ATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCA < 1:1060966/149‑1 ATGATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAACGCA > 1:1080955/1‑149 ATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTGCGGCACTGAAAATCGTTGTTGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTA > 2:1045719/1‑149 ATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTA < 2:177366/149‑1 ATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTA < 1:1053692/149‑1 ATCGACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGGGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATAGGCCAGAGCAGTA > 1:814062/1‑149 ACGGCCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTC > 2:631360/1‑149 CCAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTCACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTtc > 1:46179/1‑147 ccGACCGGTCGGTCTTCGCTGGTGGTTCTTGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCC < 1:160998/147‑1 CAGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTACGGCACTGAAAATCGTTGATACTCAGGGTAAGGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCGGCGCAGTACTTACTGCC > 2:698558/1‑149 AGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCgg > 2:645063/1‑147 AGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCG > 2:645083/1‑149 GACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGG < 1:1070728/149‑1 CAAAGTACCTTACGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4188333‑4188483‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGG > NC_000913/4188511‑4188655 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |