| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 4,188,484 | Δ27 bp | 100% | coding (3136‑3162/4224 nt) | rpoC → | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4188484 | 4188510 | 27 | 84 [0] | [0] 84 | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4188483 | 0 (0.000) | 74 (1.170) | 57/268 | NT | 100% | coding (3135/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| ? | NC_000913 | 4188511 = | 0 (0.000) | coding (3163/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit | |||||
AGTACCTTACGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCG > NC_000913/4188336‑4188628 | aGTACCTTACGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCg < 2:74230‑M1/149‑2 (MQ=255) aCCTTACGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCCAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtc < 1:1022937‑M1/149‑5 (MQ=255) ccTTACGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtct < 1:907875‑M1/149‑6 (MQ=255) ttACGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGGTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTGTTGTACGCGTTACTGACTTGCTCGCCGGCCAGGCCggtgcgt > 1:482718‑M1/1‑142 (MQ=255) aCGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTGTTGTACGCGTTACTGACATGATCGACGGCCAGGCCggtctgtct > 2:910062‑M1/1‑140 (MQ=255) aCGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAAACGTTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAGCTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctggct > 2:819118‑M1/1‑140 (MQ=255) gTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggt < 2:769804‑M1/149‑18 (MQ=255) gTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggt > 2:160998‑M1/1‑132 (MQ=255) aCTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtgg > 2:889167‑M1/1‑130 (MQ=255) gCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttct > 1:30180‑M1/1‑126 (MQ=255) gCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCgggctgtcttcgctggtggttct > 1:428898‑M1/1‑126 (MQ=255) cGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctg < 1:860822‑M1/149‑25 (MQ=255) gAAGGGCGATGGCGAACATGTTGCTGGCGCCGAAACCGTTGCAACCTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACTGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctgg < 2:892501‑M1/149‑26 (MQ=255) aGGCGATGGCGAACCGGTGGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCATCCCATGCCGGTTATCACCGGAGTACGCGGTTTTTTACGCTTTACTGACATGGTCGAGGGCCAGACCgggctgtcttctctgggggtgctggatt < 2:516803‑M1/149‑29 (MQ=255) aGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggatt < 1:1069327‑M1/149‑29 (MQ=255) aTGGCGAACAGGCTGCTGGCGGCGAACCCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgca < 2:1011736‑M1/149‑34 (MQ=255) gCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaa > 1:874521‑M1/1‑113 (MQ=255) gAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGCCGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctcggttccgcagaacg > 1:345353‑M1/1‑111 (MQ=255) gAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACAGGGACCCGCACACGATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacg > 1:741777‑M1/1‑111 (MQ=255) cagtgtgctggCGGCGAAACCGTTTCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtac < 1:653968‑M1/144‑42 (MQ=255) cAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtac < 1:536011‑M1/149‑42 (MQ=255) gTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaccgtaccgc > 1:193017‑M1/1‑105 (MQ=255) ttGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgca > 1:412402‑M1/1‑104 (MQ=255) gCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcagg < 2:552560‑M1/149‑48 (MQ=255) ggcggcGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTATGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtgg < 2:1107663‑M1/149‑51 (MQ=255) gcggcgAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGGTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggt > 1:177366‑M1/1‑98 (MQ=255) ccggcggaCCCGTGCCAAACTGGGACCCGCACACGCTCCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGTCATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttcttgattccgcagaacgtaccgcaggtggt < 2:755963‑M1/148‑52 (MQ=255) cgAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttcaggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaag > 1:785472‑M1/1‑94 (MQ=255) aaaCCGTTGCAAACTGGGACCCGCACCCCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGCACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctgtattccacttatgctaccgcagctggtaaagat < 2:824096‑M1/149‑58 (MQ=255) aCCGTTGCAAACTGGGCCGGCCACACCGTGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatct < 2:1096413‑M1/149‑60 (MQ=255) ccGTTGCAAACTGGGCCCCGCACCCCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctg < 2:1020966‑M1/149‑61 (MQ=255) gTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcg > 1:763623‑M1/1‑87 (MQ=255) cAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccg > 1:998895‑M1/1‑83 (MQ=255) cAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGAACTGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccg < 2:698738‑M1/149‑67 (MQ=255) cAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTCTGTACGCTTTACTGACATGCTAGACGACCAGACCggtctgtcttcgctggtggctctggcttccgcagaacgtaccgcaggggggaacgatctgcggcgg > 2:431470‑M1/1‑83 (MQ=255) aacctggGTCCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccgg < 2:1120461‑M1/146‑68 (MQ=255) aaaCTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCCTTACCGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggtgctggagtccgcagaccatcccgcaggtggtaaagatctgcgtccgg > 2:736366‑M1/1‑82 (MQ=255) aaaCTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTAGCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGAGATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattcggcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccgg > 1:749216‑M1/1‑82 (MQ=255) aaCTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggc > 1:414766‑M1/1‑81 (MQ=255) cTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcac < 1:742143‑M1/149‑71 (MQ=255) gggACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactg < 1:575241‑M1/149‑73 (MQ=255) ccGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaacgatctgcgtccggcactgaaaat > 1:922589‑M1/1‑72 (MQ=255) gCACCCCATGCCGTTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcg < 2:367580‑M1/149‑80 (MQ=255) gCACACCATGCCGGTTATCACCGGAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggtatacgcagaacgtaccgcaggtgggaaagatctgcgtccggcactgaaaatcg > 1:606804‑M1/1‑70 (MQ=255) gCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtcaagagctgcgtccgccactgaaaatcg > 2:1070728‑M1/1‑70 (MQ=255) gCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGGTTTGTACGCTCAACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtcccgcactgcaaagcg > 2:297029‑M1/1‑70 (MQ=255) ccAGGCCGGTTATCACCGAAGGAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgat < 1:83242‑M1/149‑85 (MQ=255) cATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACAGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatg > 2:417986‑M1/1‑64 (MQ=255) cGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcag > 2:652551‑M1/1‑59 (MQ=255) gTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcaggg > 1:541152‑M1/1‑57 (MQ=255) aCCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacga > 2:1053692‑M1/1‑51 (MQ=255) ccGAAGTAAGCGGTTTTGTCCGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgac < 2:412402‑M1/149‑100 (MQ=255) cGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCGTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaagtacg > 1:617346‑M1/1‑49 (MQ=255) aaGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcatgtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgacgctcagggtaacgacgtt < 2:741777‑M1/149‑103 (MQ=255) aaGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgtt > 1:350522‑M1/1‑47 (MQ=255) aGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttc < 1:778197‑M1/149‑104 (MQ=255) aaGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcagctggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctga < 2:847198‑M1/149‑107 (MQ=255) ggTTTTGTACGCTTTACCGACATGACCGACGGCCCGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtgctaaacatcggcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgatccc < 1:612526‑M1/149‑111 (MQ=255) gTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaccgacgttctgatcccaggtac > 1:155094‑M1/1‑33 (MQ=255) tACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctgggggttcgggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggccctgaaaatcgttgatgctcagggtaacgccgttctgatcccaggtacc > 2:158726‑M1/1‑32 (MQ=255) tttACTGACCTGGTCGAGGGCCAGACCgggctgtcttcgcttgttgttctggattccgcagaacgtaccgcaggcggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgatcccaggtaccgatat < 2:307740‑M1/149‑123 (MQ=255) tttACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtcccgcaggtggtaaagatctgcgtccagcaatgcaagtcgttgatgcgcagggaaacgacgttctgatcccaggtacagatgt > 2:322460‑M1/1‑27 (MQ=255) tttACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgatcccaggtaccgatat < 2:681090‑M1/149‑123 (MQ=255) tACTGACGTGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgctcccaggtaccgatatgc < 2:743948‑M1/149‑125 (MQ=255) tACTCACTTGATCCACGGCCAGACCtgtctgtcttcgctggtctttctggattccgcaaaacgtaccgcaagttttaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgatcccaggtaccgatatgc < 1:523158‑M1/149‑125 (MQ=255) tGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgctcccaggtaccgatatgccag > 1:149362‑M1/1‑22 (MQ=255) tGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgatcccaggtaccgatatgccag > 1:282659‑M1/1‑22 (MQ=255) tGACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgatcccaggtaccgatatgccag > 1:761322‑M1/1‑22 (MQ=255) gACATGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgatcccaggtaccgatatgccagc > 1:335143‑M1/1‑21 (MQ=255) ttgATCGGCGGCCAGACCggtctgtctgcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgatcccaggtaccgatatgccagcgca < 2:97539‑M1/148‑132 (MQ=255) aTGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgatcccaggtaccgatatgccagcgca < 2:350522‑M1/149‑132 (MQ=255) aTGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgatcccaggtaccgatatgccagcgca < 1:1060966‑M1/149‑132 (MQ=255) aTGATCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgatcccaggtaccgatatgccaacgca > 1:1080955‑M1/1‑18 (MQ=255) aTCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtgcggcactgaaaatcgttgttgctcagggtaacgacgttctgatcccaggtaccgatatgccagcgcagta > 2:1045719‑M1/1‑15 (MQ=255) aTCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgatcccaggtaccgatatgccagcgcagta < 2:177366‑M1/149‑135 (MQ=255) aTCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgatcccaggtaccgatatgccagcgcagta < 1:1053692‑M1/149‑135 (MQ=255) aTCGACGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcagggggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgatcccaggtaccgataggccagagcagta > 1:814062‑M1/1‑15 (MQ=255) aCGGCCAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgatcccaggtaccgatatgccagcgcagtacttc > 2:631360‑M1/1‑11 (MQ=255) ccAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtcacgacgttctgatcccaggtaccgatatgccagcgcagtacttccttc > 1:46179‑M1/1‑7 (MQ=255) ccgacCggtcggtcttcgctggtggttcttgattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgatcccaggtaccgatatgccagcgcagtacttcctgcc < 1:160998‑M1/147‑144 (MQ=255) cAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtacggcactgaaaatcgttgatactcagggtaaggacgttctgatcccaggtaccgatatgccggcgcagtacttactgcc > 2:698558‑M1/1‑6 (MQ=255) aGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgatcccaggtaccgatatgccagcgcagtacttcctgcgg > 2:645063‑M1/1‑5 (MQ=255) aGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgatcccaggtaccgatatgccagcgcagtacttcctgccg > 2:645083‑M1/1‑5 (MQ=255) gACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgatcccaggtaccgatatgccagcgcagtacttcctgccgg < 1:1070728‑M1/149‑146 (MQ=255) | AGTACCTTACGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCG > NC_000913/4188336‑4188628 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |