| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 4,188,484 | Δ27 bp | coding (3136‑3162/4224 nt) | rpoC → | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | NC_000913 | 4188484 | 4188510 | 27 | 82 [0] | [0] 81 | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 4188483 | 0 (0.000) | 78 (1.080) | 64/286 | 0.1 | 100% | coding (3135/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| ? | NC_000913 | 4188511 = | 0 (0.000) | coding (3163/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit | |||||
AAGTACCTTACGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATA > NC_000913/4188335‑4188631 | aaGTACCTTACGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGATGTAAGCGGTTTTGTGCGCTTTACTGACATGATCGACCGCCAGACC > 2:128450‑M1/1‑149 (MQ=255) aCCTTACGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtc < 1:1079830‑M1/149‑5 (MQ=255) ccTTACGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCggtct > 1:425458‑M1/1‑144 (MQ=255) 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ccAGACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgagcccaggtcccgatatgccagcgcaggacttcctgc > 1:317291‑M1/1‑7 (MQ=255) cgaCCggtccgtcttcgctggtggttctggatgccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgatcccaggtaccgatatgccagcgcagtacttcctgccg < 1:81390‑M1/148‑145 (MQ=255) gACCggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgatcccaggtaccgatatgccagcgcagtacttcctgccgg < 1:112263‑M1/149‑146 (MQ=255) cggtctgtcttcgctggtggttctggattccgcagaacgtaccgcaggtggtaaagatctgcgtccggcactgaaaatcgttgatgctcagggtaacgacgttctgatcccaggtaccgatatgccggcgcagtacttcctgccgggta > 2:376270‑M1/1‑1 (MQ=255) | AAGTACCTTACGGTGCGGTACTGGCGAAAGGCGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATA > NC_000913/4188335‑4188631 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |