| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 4,188,484 | Δ27 bp | coding (3136‑3162/4224 nt) | rpoC → | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4188484 | 4188510 | 27 | 82 [0] | [0] 81 | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4188483 | 0 (0.000) | 78 (1.080) | 64/286 | 0.1 | 100% | coding (3135/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| ? | NC_000913 | 4188511 = | 0 (0.000) | coding (3163/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit | |||||
CGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTA > NC_000913/4188366‑4188658 | accttacggtgcggtactggcgaaaggcgatggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGgtc < 1:1079830‑M2/4‑1 (MQ=255) ccttacggtgcggtactggcgaaaggcgatggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGgtct > 1:425458‑M2/145‑149 (MQ=255) ccttacggtgcggtactggcgaaaggcgatggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGgtct > 1:215506‑M2/145‑149 (MQ=255) ccttacggtgcgggacgggggaaaggcgatggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGgtct < 2:197312‑M2/5‑1 (MQ=255) ttacggtgcggtactggcgaaaggcgatggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGgtctgt > 1:26002‑M2/143‑149 (MQ=255) ccggtgcggtactggcgaaaggcgatggcgaacaggttgctcgcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGgtctgtct < 1:233774‑M2/9‑1 (MQ=255) cggtgcggtactggcgaaaggcgatggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaagctgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCtt > 2:919805‑M2/140‑149 (MQ=255) cggtactggcgaaaggcgatggcgaataggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCtg < 1:129014‑M2/15‑1 (MQ=255) gtactggcgacaggcgatggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCtggt < 2:536370‑M2/17‑1 (MQ=255) tactggcgaaaggcgattgcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCtggtg > 2:301766‑M2/132‑149 (MQ=255) tactggcgaaaggcgatggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCtggtg < 1:585921‑M2/18‑1 (MQ=255) tactggcgaaaggcgatggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCtggtg > 2:583636‑M2/132‑149 (MQ=255) tggcgaaaggcgatggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCgcgggtggct > 1:242053‑M2/129‑147 (MQ=255) gcgaaaggcgatggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCt > 1:871844‑M2/127‑149 (MQ=255) gcgaaaggcgatggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCt > 1:394136‑M2/127‑149 (MQ=255) cgaaaggggatggcgaacaggtggctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttacggacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTg < 2:439497‑M2/24‑1 (MQ=255) gaaaggcgatggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacagccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTgg < 1:698019‑M2/25‑1 (MQ=255) gaaaggcgatggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggatttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTACTgg > 2:944022‑M2/125‑149 (MQ=255) aaaggcgagggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGa < 1:206391‑M2/26‑1 (MQ=255) gcgatggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTcc > 2:112263‑M2/120‑149 (MQ=255) cgatggcgaacaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtacgcggttttgtacgctttactgacatggtcgacggccggaccGGGCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGGTTCCg > 2:123091‑M2/119‑149 (MQ=255) actggttgctggcggctaaaccgttgcaaactggcacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtactctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTa < 2:835303‑M2/40‑1 (MQ=255) acaggttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTa < 1:327334‑M2/40‑1 (MQ=255) gttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgctcgacggccagaccGGTCTCGCTTCGCTGGTGGTTGTGGATTCCGCGGAACGTACCGc > 2:591502‑M2/106‑149 (MQ=255) gttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcgggtttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATCCCGCAGAACGTACCGc > 1:1188923‑M2/106‑149 (MQ=255) gttgctggcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgcaggttatcaccgaagtaagcggtgttgtacgctttactgacatgatcgacggacagaacGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCGCGATTCCGGAGAACggacacc > 2:89095‑M2/106‑146 (MQ=255) gttgctggcggagaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGc < 1:389822‑M2/44‑1 (MQ=255) gcggcgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTCCCGCAggtggt > 2:1227720‑M2/99‑149 (MQ=255) cgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtcagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGACCGTACCGCAGGTGGCAAAg > 2:482826‑M2/95‑149 (MQ=255) cgaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAg < 1:862093‑M2/55‑1 (MQ=255) gaaaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagaggttttgtacgctttactgacatgatcgccggccagaccGGTCTGTCTTCACTGGTTGTTCGGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGa > 2:422329‑M2/94‑149 (MQ=255) aaccgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATc < 1:1105347‑M2/58‑1 (MQ=255) accgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGGTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAGGATCt > 1:222123‑M2/91‑149 (MQ=255) accgttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCt < 1:412140‑M2/59‑1 (MQ=255) acccttgcaatctgggaccgtcacaccatgccggttatcaccgaagtaggcggttttgtacgcttcactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCt < 2:434507‑M2/59‑1 (MQ=255) ttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGt > 1:1089768‑M2/87‑149 (MQ=255) ttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGt > 1:1133675‑M2/87‑149 (MQ=255) ttgcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGt > 1:991275‑M2/87‑149 (MQ=255) gcaaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTcc > 1:360713‑M2/85‑149 (MQ=255) ccaagtgggacccgcacaccatggcggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCtgcgtgcg < 2:1137986‑M2/66‑1 (MQ=255) aaactgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAACGATCTGCGTCCgg > 2:387546‑M2/83‑149 (MQ=255) accgggacccgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCa < 2:362509‑M2/69‑1 (MQ=255) cgcacaccatgccggttatcaccgaagtaagtggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGCTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATc < 1:834666‑M2/78‑1 (MQ=255) taaccatgcctgttatcgccgaaggaagcggtttggtccgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATCCCGCAGAACGTACCGCATGTTGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGt‑t < 2:1197493‑M2/81‑1 (MQ=255) acaccatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGt‑t < 2:1089768‑M2/81‑1 (MQ=255) accatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCg > 2:755786‑M2/67‑145 (MQ=255) accatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCg < 1:755786‑M2/79‑1 (MQ=255) accatgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGa < 1:4836‑M2/83‑1 (MQ=255) catgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATg < 1:558270‑M2/85‑1 (MQ=255) atgccggttatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTGTGTCGTCGCGGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGGACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGAGGc > 2:1187415‑M2/64‑149 (MQ=255) tatcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTa < 2:344898‑M2/94‑1 (MQ=255) tcaccgaagtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAac > 1:1042161‑M2/54‑149 (MQ=255) gtaagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCt < 2:871844‑M2/104‑1 (MQ=255) aagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCCCTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGa > 1:216198‑M2/44‑149 (MQ=255) aagcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTACCGACGTTCTGa > 1:216218‑M2/44‑149 (MQ=255) agcggttttgtacgctttacttacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGAt < 1:263103‑M2/107‑1 (MQ=255) agcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGAt < 1:1188930‑M2/107‑1 (MQ=255) agcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGAt > 1:929913‑M2/43‑149 (MQ=255) agcggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGCGAACGACGTTCTGAt > 2:972212‑M2/43‑149 (MQ=255) gcggttttgtacgctttactgccatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATc < 1:229474‑M2/108‑1 (MQ=255) ggttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATccc < 2:682519‑M2/110‑1 (MQ=255) gttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCa < 1:1054828‑M2/111‑1 (MQ=255) ttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAg < 2:1133675‑M2/112‑1 (MQ=255) ttttgtacgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAg > 1:214838‑M2/38‑149 (MQ=255) cacgctcgactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGACAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGGAcc > 2:154022‑M2/33‑149 (MQ=255) acgctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATAGTGGGCTGC‑CAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCg < 1:301766‑M2/118‑1 (MQ=255) gctttactgagatgttcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGat < 2:599746‑M2/120‑1 (MQ=255) gctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGat > 2:54211‑M2/30‑149 (MQ=255) ctttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGata > 1:634983‑M2/29‑149 (MQ=255) tttactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGatat < 2:242053‑M2/122‑1 (MQ=255) tactgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGc < 1:15077‑M2/124‑1 (MQ=255) tgacatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGAGATGCCAg > 2:43400‑M2/23‑149 (MQ=255) acatgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCGgcg > 2:183066‑M2/21‑149 (MQ=255) catgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAgcgc > 1:991497‑M2/20‑149 (MQ=255) atgatcgacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGGCGTTCTGATCCCAGGTACCGCTATgccaggaca > 1:558569‑M2/19‑145 (MQ=255) gacggccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTTCCGACATGCCACCGCAGgacgt > 1:987940‑M2/13‑147 (MQ=255) acggacagaccGGTCTGTCTGCGCTGGTGGTTCCGGAGTCCGCCGGCCGTACCGAGGCGGGGAGAGAGCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTc < 1:548442‑M2/138‑1 (MQ=255) ccagaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGAGCCCAGGTCCCGATATGCCAGCGCAGGACTTCCTGc > 1:317291‑M2/8‑149 (MQ=255) cgaccGGTCCGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATGCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCg < 1:81390‑M2/144‑1 (MQ=255) gaccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCgg < 1:112263‑M2/145‑1 (MQ=255) cGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCGGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTa > 2:376270‑M2/2‑149 (MQ=255) | CGATGGCGAACAGGTTGCTGGCGGCGAAACCGTTGCAAACTGGGACCCGCACACCATGCCGGTTATCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGT‑TGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTA > NC_000913/4188366‑4188658 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |