| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2929267 | 124 (1.180) | 4 (0.040) | 3/516 | 10.9 | 3.2% | coding (1039/1290 nt) | sdaC | putative serine transporter |
| ? | NC_000913 | = 2929276 | 119 (1.130) | coding (1048/1290 nt) | sdaC | putative serine transporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
TCATGATGGTGCTGACCGTAATGTTCTTCGTCTTCAGCTGTGTACTGAGCCTGACTCCGGCAGACCTGGCTGCGGCTAAAGAGCAGAACATCTCGATTCTGTCTTACCTGGCTAACCACTTTAACGCACCGGTTATCGCGTGGATGGCTCCGATTATCGCGATTATCGCTATCACCAAATCCTTCCTCGGTCACTACCTGGGCGCACGTGAAGGCTTCAACGGTATGGTGATTAAATCTCTGCGTGGTAAAGGTAAGTCTATCGAAATCAACAAGCTGAACCGTATCACTGCGCTGTTCATGCTGGTAACGACCTGGATTGTTGCCACCCTGAACCCGAGCATCCTGGGTATGATTGAAACCCTGGGCGGTCCAATCATCGCGATGATCCTGTTCCTGATGCCGATGTACGCAATTCAGAAAGTACCGGCAATGCGTAAGTACAGCGGTCACATCAGCAACGTATTCGTTGTCGTGATGGGTCTGATTGCAATCTCCGCAATCTTCTACTCTCTGTTCAGCTAAGTCCTTTCGCGCCGCTTTCGGGC > NC_000913/2928995‑2929541 | tcgtgttgggggtGACCGTAACTTTTTTCGTCTTCAACTGTGTACTGAGCCTGGCTCCGGCAGCGCTGGCTGCGGCTAAAGGGAAGAACATCTCGATTTTGTCTTACCTGGTTAACCCCTTTAACGCCCCGGTTATCGCGTGGATGGCTCCGATTATCGCGATTATCGCTATCACCAAATCCTTCCTCGGTCACTACCTGGGCGCACGTGAAGGCTTCAACGGTATGGTGATTAAATCTCTGCGTGGTAAAGGTAAGTCTATCGAAATCAACAAg < 3:297631/263‑1 (MQ=255)tcagGATGGTGCTGACCGTAATGTTCTTCGTCTTCAGCTGGGTACTGGGCCTGACTCCGGCAGACCTGGCTGCGGCTAAAGAGCAGAACATCTCGATTCTGTCTTACCTGGCTAACCACTTTAACGCACCGGTTATCGCGTGGATGGCTCCGATTATCGCGATTATCGCTATCACCAAATCCTTCCTCGGTCACTACCTGGGCGCACGTGAAGGCTTCAACGGTATGGTGATTAAATCTCTGCGTGGTAAAGGTAAGTCTATCGAAATCAACAAg < 3:114743/275‑1 (MQ=255) catGATGGTGCTGACCGTAATGTTCTTCGTCTTCAGCTGTGTTCTGAGCCTGACTCCGGCAGACCTGGCTGCGGCTAAAGAGCAGAACATCTCGATTCTGTCTTACCTGGCTAACCACTTTAACGCACCGGTTATCGCGTGGATGGCTCCGATTATCGCGATTATCGCTATCACCACATCCTTCCTCGGTCACTACCTGCGCGCACGTGAAGGCTTCAACGGTATGGTGATTAAATGCCTGCGGGGTCAAGGTAGTTCTATCGAAATCAACAAGCt > 4:266708/1‑276 (MQ=255) cgtatgGTCCTGACCGTAATGTTCTTCGTCTTCAGCTGTGTACTGAGCCTGACTCCGGCAGACCTGGCTGCGGCTAAAGAGCAGAACATCTCGATTCTGTCTTACCTGGCTAACCACTTTAACGCACCGGTTATCGCGTGGATGGCTCCGATTATCGCGATTATCGCTATCACCAAATCCTTCCTCGGTCACTACCTGGGCGCACGTGAAGGCTTCAACGGTATGGTGATTAAATCTCTGCGTGGTAAAGGTAAGTCTATCGAAATCAACAAGCTg < 4:108385/273‑1 (MQ=255) ggTGCTGACCGTAATGTTCTTCGTCTTCAGCTGTGTACTGAGCCTGACTCCGGCAGACCTGGCTGCGGCTAAAGAGCAGAACATCTCGATTCTGTCTTACCTGGCTAACCACTTTAACGCACCGGTTATCGCGTGGATGGCTCCGATTATCGCGATTATCGCTATCACCAAATCCTTCCTCGGTCACTACCTGGGCGCACGTGAAGGCTTCAACGGTATGGTGATTAAATCTCTGCGTGGTAAAGGTAAGTCTATCGAAATCAACAAGCTg > 3:351669/1‑271 (MQ=255) tGCTGACCGTAATGTTCTTCGTCTTCAGCTGTGTACTGAGCCTGACTCCGGCAGACCTGGCTGCGGCTACAGAGCAGAACATCTCGATTCTGTCTTACCTGGCTAACCACTTTAACGCACCGGTTATCGCGTGGATGGCTCCGATTATCGCGATTATCGCTATCACCAAATCCTTCCTCGGTCACTACCTGGGCGCACGTGAAGGCTTCAACGGTACGGTGATTAAATCTCTCCGTGGTAAAGGTAAGTCTATCGAAACCAACAAGCTGATcct > 3:352157/1‑273 (MQ=255) tGCTGACCGTAATGTTCTTCGTCTTCAGCTGTGTACTGAGCCTGACTCCGGCAGACCTGGCTGCGGCTAAAGAGCAGAACATCTCGATTCTGTCTTACCTGGCTAACCACTTTAACGCACCGGTTATCGCGTGGATGGCTCCGATTATCGCGATTATCGCTATCACCAAATCCTTCCTCGGTCACTACCTGGGCGCACGTGAAGGCTTCAACGGTATGGTGATTAAATCTCTGCGGGGTAAAGGTAAGTCTATCGAAATCAACAAGCTGAAcgg > 1:50735/1‑272 (MQ=255) 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tgtACTGAGCCTGACTCCGGCAGACCTGGCTGCGGCTAAAGAGCAGAACATCTCGATTCTGTCTTACCTGGCTAACCACTTTAACGCACCGGTTATCGCGTGGATGGCTCCGATTATCGCGATTATCGCTCTCACCAAATCCTTCCTCGGTCACTACCTGGGCGCACGTTAAGGCTTCAACGGTTGGGTGATTAAATCTCTGCGTGGTAAAGGTAAGGCTAACGAAATCAACACGCTGTACCGTAACCCTGCCCTGTTCCTTCTTGTATCGTCCt > 2:9508/1‑275 (MQ=255) aCTGAGACTGACTCCGGCAGACCTGGCTGCGGCTAAAGAGCAGAACATCTCGATTCTGTCTTACCTGGCTAACCACTTTAACGCACCGGTTATCGCGTGGATGGCTCCGATTATCGCGATTATCGCTATCACCAAATCCTTCCTCGGTCACTACCTGGGCGCACGTGAAGGCTTCAACGGTATGGTGATTAAATCTCTGCGTGGTAAAGGTAAGTCTATCGAAATCAACAAGCTGAACCGTATCACTGCGCTGTTCATGCTGGTAACGACCTGGAt < 2:464725/276‑1 (MQ=255) tGAGCCTGACTCCGGCAGACCTGGCTGCGGCAAAAGAGCAGAACATCTCGATTCTGTCTTACCTGGCTAACCACTTTAACGCACCGGTTATCGCGGGGATGGCTCCGATTATCGCGATTATCGCTATCACCAAATCCTTCCTCGGTCACTACCTGGGCGCACGTGCAGGCTTCAACGGTATGGTGATTAAATCTTTGCGTGGTAAAGGTAAGTCTATCCAAATCAACAAGCTTAACCGTATCACTGCGCTGTTCATGCCTGTACCGACCTGGAt > 1:219034/1‑274 (MQ=255) 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TCATGATGGTGCTGACCGTAATGTTCTTCGTCTTCAGCTGTGTACTGAGCCTGACTCCGGCAGACCTGGCTGCGGCTAAAGAGCAGAACATCTCGATTCTGTCTTACCTGGCTAACCACTTTAACGCACCGGTTATCGCGTGGATGGCTCCGATTATCGCGATTATCGCTATCACCAAATCCTTCCTCGGTCACTACCTGGGCGCACGTGAAGGCTTCAACGGTATGGTGATTAAATCTCTGCGTGGTAAAGGTAAGTCTATCGAAATCAACAAGCTGAACCGTATCACTGCGCTGTTCATGCTGGTAACGACCTGGATTGTTGCCACCCTGAACCCGAGCATCCTGGGTATGATTGAAACCCTGGGCGGTCCAATCATCGCGATGATCCTGTTCCTGATGCCGATGTACGCAATTCAGAAAGTACCGGCAATGCGTAAGTACAGCGGTCACATCAGCAACGTATTCGTTGTCGTGATGGGTCTGATTGCAATCTCCGCAATCTTCTACTCTCTGTTCAGCTAAGTCCTTTCGCGCCGCTTTCGGGC > NC_000913/2928995‑2929541 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |