| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3768227 = | 373 (3.040) | 4 (0.030) | 4/512 | 11.3 | 1.1% | coding (51/462 nt) | yibG | TPR‑like repeat protein |
| ? | NC_000913 | 3768236 = | 343 (2.820) | coding (60/462 nt) | yibG | TPR‑like repeat protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 374 total aligned reads displayed.
AGGACCTGACACGCTATGGACGTGGTGGGGGCGAGGAACTAATGGTAAGTTAAAAATGGATACAGTGCTAACAGCACCAACGAACCTTAATTCAAATAAGGATCTAATGGCTATAACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGATGTGAAAATAAAACAAAACGAAAGTATGATGGGGTCTACAGCAATGACCTATGATTTAAGTGAAGAAAAGTTGATGAAACTGAAGTATAAATCACAACATGGTGATTCAGAGGCATCATTTCGACTATATCAATATTACTGCTTTACTAAAAATAACATTTACAAACAATTGCGATTCTTGGAAAGATCAGCATCTCAGGGGAATGTTACAGCGCAGTTTAATTATGGGGTCTTTTTATCAGATACAAATCCAACATTATCAGA > NC_000913/3767952‑3768502 | gactggaaacGCTATGGACGTGGTGGGGGCGAGGAACTAATGGTAAGTGAAAAAGGGATACAGTGCTAACAGCACCAACGAAACTTAATTCAAATAAGGAGCTAATGGCTATAACAACAAAAGACCTTGGTAAGTGGATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCa < 2:10215/268‑1 (MQ=255) gACCAGACACGCTATGGAGTGGGGGGGGGCGATGAACGAATGGTAAGTTAAAAATGGATACAGTGCTAACAGCAACAACGAAACTTAATTCAAATAATGATCTAATGGCTAGAACAACAAAAGCACTTGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGAACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGNCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCa < 4:321154/276‑1 (MQ=255) aCCTGAAACGCTATGGACGTGGTGGGTGCGAGGAACTAATGGTAAGTTAAAAATGGATACAGTGCTAACAGCTCCAACGAACCTTAATTCAAATAAGGATCTAATGGCTATAACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCa < 3:146910/275‑1 (MQ=255) tGACACGCTATGGACGTGGTGGGGGCGAGGAACTAATGGTAAGTTAAAAATGGATACAGTGCTAACAGCACCAACGAACCTTAATTCAAATAAGGATCTAATGGCTATAACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGCACACCATTTCTAATATGCAAGGTCCGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGAGAGGTTGTAGATGTAAGAAAGCATGCTTGTAACTATTGTTTTATTTTTCTTTTATTTTTAAATTGCATgtt > 4:509816/1‑274 (MQ=255) ggtATGGAAGTGGTGGGGGACAGGAACTAATGGTAAGTTAAAAATGGATACAGTGCTAACAACACCAACGAACCTTAATTCAAATAGGGATCTAATGGCTATAACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGAACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCt < 1:587110/271‑1 (MQ=255) ggggCGAGGAACTAATGGTAAGTTAAAAATGGATACAGTGCTAACAGCACCAACGAACCTTAATTCAAATAAGGATCTAATGGCTATAACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGAtgt < 2:334180/263‑1 (MQ=255) gggCGAGGAACTAATGGTAAGTTAAAAATGGATACAGTGCTAACAGCACCAACGAACCTTAATTCAAATAAGGATCTAATGGCTATAACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCa < 3:117840/250‑1 (MQ=255) 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aaGTTAAAAATGGATACAGTGCTAACAGCAACAACGAACCTTAATTCAAATAAGGATCTAATGGCTATAACAACAAAACACCTTGGTAATTGAATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCATTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGATGTGAAAATAAAACAAAACGAAAGTATGATggg < 1:193830/274‑1 (MQ=255) ttAAAAATGGATACAGTGCTAACAGCACCAACGAACCTTAATTCAAATAAGGATCTAATGGCTATAACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGATGTGAAAATAAAACAAAACGAAAGTATGATGGGGTCt > 1:493992/1‑275 (MQ=255) ttAAAAAATGATACAGTTCAAACAACACCAACGAAACTTAATTCAAATAAGGATCTAATTGCTATAACAACAAAACACCTTGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGGTGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGATGTGAAAATAAAACAAAACGAAAGTATGATGGGGTCTa < 2:377467/276‑1 (MQ=255) tAAAAATGGATAAAGTGATAACAGAACAAACGAACCTTAATTCAAATAAGGATCTAATGGCTATAACAACAAAAGACCTGGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGAACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGATGTGAAAATAAAACAAAACGAAAGTATGATGGGGTCTa < 2:279158/275‑1 (MQ=255) aagacacaaattacTAACAACACCAAAAAACCTTAATTCACATAATAATCTAATGGCACTAACAACAAAAGACCTGGGTAATTGGATAACATATTGGCCATCTGGGCAACCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGATGTGAAAATAAAACAAAACGAAAGTATGATGGGGTCTACAGCa < 4:300426/263‑1 (MQ=255) aaaggATACAAAGCAAAAAGCACCAACAAACCTTAATTCAAATAATGATCTAAAGGCTATAACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGATGTGAAAATAAAACAAAACGAAAGTATGATGGGGTCTACAGCa < 4:228334/273‑1 (MQ=255) cAGTGCTAACAGCACCAACGAACCTTAATTCAAATAAGGATCTAATGGCTATAACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGATGTGAAAATAAAACAAAACGAAAGTatgat < 4:572417/255‑1 (MQ=255) gTGCTAACAAAACCAAAGAACCTTAATTCAAATAAGGATCTAATGGCTATAACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAAAATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGATGTGAAAATAAAACAAAACGAAAGTATGATGGGGTCTACAGCAATGACCt < 3:44/273‑1 (MQ=255) tGCTAACAGCACCAACGAACCTTAATTCAAATAAGGATCTAATGGCTATAACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGATGTGAAAATAAAACAAAAAGAAAGTATGATGGGGTCTACAGCAATGACCTATGa > 2:194363/1‑276 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |