| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3768227 = | 373 (3.040) | 4 (0.030) | 4/512 | 11.3 | 1.1% | coding (51/462 nt) | yibG | TPR‑like repeat protein |
| ? | NC_000913 | 3768236 = | 343 (2.820) | coding (60/462 nt) | yibG | TPR‑like repeat protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 352 total aligned reads displayed.
GCTATGGACGTGGTGGGGGCGAGGAACTAATGGTAAGTTAAAAATGGATACAGTGCTAACAGCACCAACGAACCTTAATTCAAATAAGGATCTAATGGCTATAACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGATGTGAAAATAAAACAAAACGAAAGTATGATGGGGTCTACAGCAATGACCTATGATTTAAGTGAAGAAAAGTTGATGAAACTGAAGTATAAATCACAACATGGTGATTCAGAGGCATCATTTCGACTATATCAATATTACTGCTTTACTAAAAATAACATTTACAAACAATTGCGATTCTTGGAAAGATCAGCATCTCAGGGGAATGTTACAGCGCAGTTTAATTATGGGGTCTTTTTATCAGATACAAATCCAACATTATCAGAATATTA > NC_000913/3767964‑3768508 | aTGGACGTGGTGGGGGCGAGGAACTAATGGTAAGTTAAAAATGGATACAGTGCTAACAGCACCAACGAACCTTAATTCAAATAAGGATCTAATGGCTATAACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGAtgtg > 4:498092/1‑276 (MQ=255) aTGGACGTGGTGGGGGCGAGGAACTAATGGTAAGTTAAAAATGGATACAGTGCTAACAGCACCAACGAACCTTAATTCAAATAAGGATCTAATGGCTATAACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGAtgt > 1:625299/1‑275 (MQ=255) gtggGGGCGAGGAACTAATGGTAAGTTAAAAATGGATACAGTGCTAACAGCACCAACGAACCTTAATTCAAATAAGGATCTAATGGCTATAACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGa > 4:334180/1‑263 (MQ=255) gggCGAGGAACTAATGGTAAGTTAAAAATGGATACAGTGCTAACAGCACCAACGAACCTTAATTCAAATAAGGATCTAATGGCTATAACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGATGTGAAAATaaaacaa > 1:173949/1‑275 (MQ=255) ggAACTAATGGTAAGTTAAAAATGGATAAAGTGCTAACAGCACCAACGAACCTTAATTCAAATAAGGATCTAATGGCTATAACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGATGTGAAAATAAAACAAAACGa < 1:605265/274‑1 (MQ=255) agaaaaGTTAAAAAAGGATACAATGATAACAAAACAAAATAACATTAATTCAAATAAGGATTTAAACGGTATAACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGATGTGAAAATAAAACAAAACGAAAGTatgat < 4:615326/271‑1 (MQ=255) ggTAAGTTAAAAATGGATACAGTGCTAACAGCACAAACGAACCTTAATTCAAATAAGGATCTAATGGCTATAACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGATGTGAAAATAAAACAAAACGAAAGTatgat < 1:51289/274‑1 (MQ=255) attaaataaaaaaTTGATAAAGTGATAAAAGCACCAACGAACCTTAATTCAAATAAAGATCTAATGGCTATAACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAAAATATGGGCCATCTGGGCACACCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGATGTGAAAATAAAACAAAACGAAAGTatgatg < 4:602862/267‑1 (MQ=255) gaaaagagacgaTGGATACAATGCTAACAGGAACAACTAACCTTAATTAAAATAAGGATCTAATGGCTATAACAACAAAAGCCCTTGATAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGATGTGAAAATAAAACAAAACGAAAGTATGATggg < 4:428495/265‑1 (MQ=255) gTAAGTGAAAGATAGATACAGTGCTAACCGCACCAACGAACCTTAATTCAAATAAGGATCTAATGGCAAGAACAACAAAAGACCTTGGTAATGGTATAACATATGGGCCATATGAGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGGTGTATGCAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTCATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCGTGGTGCTGGTGTGAAAATAAAGCAAGACGAAAGTatgatg < 3:449715/274‑1 (MQ=255) tAAGTTAAAAATGGATACAGTGCTAACAGCACCAACGAACCTTAATTCAAATAAGGATCTAATGGCTATAACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGATGTGAAAATAAAACAAAACGAAAGTATGATggg < 2:357934/275‑1 (MQ=255) aaGTTAAAAATTGATACAGTGCTAACAGCACCAACGAACCTTAATTCAAATAAGGATCTAATGGCTAGCACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAACATATGGGACATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGATGGGAAAATAAAACAAAACGAAAGTATGATggg < 1:559096/274‑1 (MQ=255) aaGTTAAAAATGGATACAGTGCTAACAGCACCAACGAACCTTAATTCAAATAAGGATCTAATGGCTATAACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTTCTGATGTGAAAATAAAAAAAAACGAAAGTATGATgggg > 3:123643/1‑275 (MQ=255) aaGTTAAAAATGGATACAGTGCTAACAGCAACAACGAACCTTAATTCAAATAAGGATCTAATGGCTATAACAACAAAACACCTTGGTAATTGAATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCATTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGATGTGAAAATAAAACAAAACGAAAGTATGATggg < 1:193830/274‑1 (MQ=255) tAAAAATGGATACAGTGCTAACAGCACCAACGAACCTTAATTCAAATAAGGATCTAATGGCTATAACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGATGTGAAAATAAAACAAAACGAAAGTATGATGGGGTCTa < 2:8859/275‑1 (MQ=255) aagacacaaattacTAACAACACCAAAAAACCTTAATTCACATAATAATCTAATGGCACTAACAACAAAAGACCTGGGTAATTGGATAACATATTGGCCATCTGGGCAACCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGATGTGAAAATAAAACAAAACGAAAGTATGATGGGGTCTACAGCa < 4:300426/263‑1 (MQ=255) 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tGCTAACAGCACCAACGAACCTTAATTCAAATAAGGATCTAATGGCTATAACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGATGTGAAAATAAAACAAAAAGAAAGTATGATGGGGTCTACAGCAATGACCTATGa > 2:194363/1‑276 (MQ=255) cTAACAGCACCAACGAACCTTAATTCAAATAAGGATCTAATGGCTATAACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACACAGTGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGAAAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTTTCAATTGCATGGTGCTGATGTGAAAATATGACAAAACGAATGTATGAGGGGTTTTACTGAAATGACCTagaatt > 4:589670/1‑271 (MQ=255) gCACCAACGAACCTTAATTCAAATAAGGCTCTAATGGCTATAACAACAAAAGACCTTGGTAATTGGATAACATATGGGCCATCTGGGCACCCCATTTCTAATATGCAAGGTACGCCAGAAAAACCCAGCGATATAAGATAGGTTGTAGATGTATGACAGCATGCTTGTTACTATTTTTTTATTTCTCTTTTATTTGTCAATTGCATGGTGCTGATGTGAAACTAAAACAAAACGAAAGTATGATGGGGTCTACAGCAATGACCGATGATTTAAGt > 1:267505/1‑275 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |