| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3621502 | NA (NA) | 6 (0.010) | 4/250 | NT | 100% | coding (2311/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 3621532 | 0 (0.000) | coding (2341/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
GAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGAccag‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3621355‑3621502‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCAGCCCCTGCGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTGCTTCCGTCTGCGGGTGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATGG < NC_000913/3621532‑3621381 GAAGGTGGCTGACTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGAGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGAC > 1:6266982/1‑149GAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGTCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGAC < 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CAGCCCCTGCGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAATGCTTCCGTCTGCGGGTGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGCCCTTCGCTGATAT < 2:2716444/149‑1 CAGCCCCTGCGCGCTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTGCTTCCGTCTGCGGGTGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGCCCTTCGCTGATtt > 2:3126474/1‑147 CAGCACCTGCGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTGCTTCCGTCTGCGGGTCATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGCCCTTCGCTGATAT < 4:4035410/149‑1 AGCCCCTGCGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTGCTTCCGTCTGCGGGTGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATG < 4:3836548/149‑1 AGCCCCTGCGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTGCTTCCGTCTGCGGGTGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATG > 1:3004660/1‑149 AGCCCCTGCGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTGCTTCCGTCTGCGGGTGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATG < 1:3826265/149‑1 AGCCCCTGCGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTGCTTCCGTCTGCGGGTGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATG > 4:5039525/1‑149 AGCCCCTGCGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTGCTTCCGTCTGCGGGTGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATG > 3:1350970/1‑149 AGCCCCTGCGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTGCTTCCGTCTGCGGGTGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATG < 4:1521208/149‑1 GCCCCTGCGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTGCTTCCGTCTGCGGGTGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATGG < 4:7110922/149‑1 GCCCCTGCGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTGCTTCCGTCTGCGGGTGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATGG < 3:303336/149‑1 GCCCCTGCGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTGCTTCCGTCTGCGGGTGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATGG < 4:6604972/149‑1 GCCCCTGCGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTGCTTCCGTCTGCGGGTGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATGG < 1:2608052/149‑1 GCCCCTGCGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTGCTTCCGTCTGCGGGTGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATGG > 2:4214726/1‑149 GCCCCTGCGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTGCTTCCGTCTGCGGGTGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATGG < 4:5568072/149‑1 GCCCCTGCGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTGCTTCCGTCTGCGGGTGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATGG < 1:546078/149‑1 GCCCCTGCGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTGCTTCCGTCTGCGGGTGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATGG < 2:2383582/149‑1 GCCCCTGCGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTGCTTCCGTCTGCGGGTGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATGG > 1:7232670/1‑149 GCCCCTGCGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTGCTTCCGTCTGCGGGTGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATGG < 4:1976316/149‑1 GCCCCTGCGCGCTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTGCTTCCGTCTGCGGGTGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATGG > 1:5403098/1‑149 GAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGAccag‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3621355‑3621502‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCAGCCCCTGCGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTGCTTCCGTCTGCGGGTGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATGG < NC_000913/3621532‑3621381 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |