| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 3621532 | 0 (0.000) | coding (2341/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
TATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCG > NC_000913/3621384‑3621680 | tatCAGGGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTTACCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGCGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGG > 4:6512829‑M2/1‑149 (MQ=255)tatCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGG < 1:1082470‑M2/149‑1 (MQ=255)tatCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGG < 1:1402812‑M2/149‑1 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(MQ=255) ggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgtt > 4:1645566‑M2/1‑2 (MQ=255) ggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgccct > 1:27698‑M2/1‑2 (MQ=255) gtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgcctcccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagtcagccaccttc > 1:6266982‑M2/1‑1 (MQ=255) gtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtccgccagccacgttc > 2:5267948‑M2/1‑1 (MQ=255) gtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttc > 3:6403926‑M2/1‑1 (MQ=255) 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gtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccgacctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagccagccacgttc < 1:976610‑M2/149‑149 (MQ=255) gtctcatgctgccagagcagtgcttccgtatgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtcagctagccacgttc < 2:7262494‑M2/149‑149 (MQ=255) | TATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCG > NC_000913/3621384‑3621680 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |