New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 3621980 | NA (NA) | 3 (0.000) | 3/242 | NT | 100% | coding (2789/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
? | NC_000913 | = 3622019 | 0 (0.000) | coding (2828/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
AATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGACGCGCACTATCTTTACCGGTATGACCGTCACGGCAGGCTGACAGAGAAAACCGACCTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAGCGGACTCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTAT > NC_000913/3621871‑3622167 | aaTCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGACGCGCACTATCTTTACCGGTATGACCGTCACGG < 3:3075011‑M2/149‑1 (MQ=255) aaTCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGACGCGCACTATCTTTACCGGTATGACCGTCACGG < 3:2900371‑M2/149‑1 (MQ=255) aaTCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGACGCGCACTATCTTTACCGGTATGACCGTCACGG > 4:5226590‑M2/1‑149 (MQ=255) 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3:5288990‑M2/149‑144 (MQ=255) tCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgcc < 1:1133483‑M2/149‑144 (MQ=255) tCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgcc < 4:5409973‑M2/149‑144 (MQ=255) tCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgcc < 4:4022656‑M2/149‑144 (MQ=255) tCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggata < 4:3593598‑M2/108‑103 (MQ=255) tCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggata > 3:3593598‑M2/1‑6 (MQ=255) tCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttac < 1:5014973‑M2/76‑71 (MQ=255) 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gggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctg < 1:3854138‑M2/143‑142 (MQ=255) gggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtg > 4:3732455‑M2/1‑2 (MQ=255) gggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtg < 3:62751‑M2/86‑85 (MQ=255) gggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccggccgcagctccgggtcgggcaggcggtaacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggtg > 2:5379061‑M2/1‑2 (MQ=255) ggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggtgg < 4:3274648‑M2/149‑149 (MQ=255) ggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggtgg > 3:6101571‑M2/1‑1 (MQ=255) ggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggtgg < 2:4577807‑M2/149‑149 (MQ=255) ggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggtgg < 3:3936808‑M2/149‑149 (MQ=255) ggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggtgg > 4:2418099‑M2/1‑1 (MQ=255) ggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgc < 1:3432056‑M2/114‑114 (MQ=255) ggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcg < 2:3546622‑M2/113‑113 (MQ=255) | AATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGACGCGCACTATCTTTACCGGTATGACCGTCACGGCAGGCTGACAGAGAAAACCGACCTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAGCGGACTCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTAT > NC_000913/3621871‑3622167 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |