| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 302552 = | 119 (0.860) | 8 (0.060) | 5/216 | NT | 6.8% | coding (22/690 nt) | paoA | PaoABC aldehyde oxidoreductase, 2Fe‑2S subunit |
| ? | NC_000913 | 302577 = | 107 (0.810) | intergenic (‑4/‑414) | paoA/yagU | PaoABC aldehyde oxidoreductase, 2Fe‑2S subunit/DUF1440 family inner membrane acid resistance protein | |||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
GTGTAGCTGCCGGAACGCTTGCCGCCAGCGTAGAATGAGGATAAACCACGGCGGTCGCCGCTGTTGCGGCGCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAG > NC_000913/302408‑302700 | acatgaatttattagccgggctcatagctgcattcgcgttttaagaataatcctcctgctgtcgccgactatgcttaacgtttaaaaaagcatcagcactctcgcaacgcactcttattttcccctttagaataccggaggcctGGTAt < 1:761017‑M1/5‑1 (MQ=255) atgaatttattagccgggctcatagctgcattcgcgttttaagaataatcctcctgctgtcgccgactatgcttaacgtttaaaaaagcatcagcactctcgcaacgcactcttattttcccctttagaataccggaggcctGGTATTc < 3:1226148‑M1/7‑1 (MQ=255) gaatttattagccgggctcatagctgcattcgcgttttaagaataatcctcctgctgtcgccgactatgcttaacgtttaaaaaagcatcagcactctcgcaacgcactcttattttcccctttagaataccggaggcctgg > 2:320745‑M1/141‑142 (MQ=255) catagctgcattcgcgttttaagaataatcctcctgctgtcgccgactatgcttaacgtttaaaaaagcatcagcactctcgcaacgcactcttattttcccctttagaataccggaggcctGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAg > 4:1226148‑M1/123‑149 (MQ=255) gAATGAGGATAAACCACGGCGGTCGCCGCTGTTGCGGCGCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTa > 1:171426/1‑149 (MQ=255) gAGGATAAACCACGGCGGTCGCCGCTGTTGCGGCGCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCt < 2:171426/149‑1 (MQ=255) aTAAACCACGGCGGTCGCCGCTGTTGCGGCGCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAGCCCTATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGc < 2:854759/122‑1 (MQ=255) aTAAACCACGGCGGTCGCCGCTGTTGCGGCGCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGc > 1:854759/1‑122 (MQ=255) gaataatcctcctgctgtcgccgactatgcttaacgtttaaaaaagcatcagcactctcgcaacgcactcttattttcccctttagaataccggaggcctGGTa < 2:974236‑M1/4‑1 (MQ=255) aCGGCGGTCGCCGCTGTTGCGGCGCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGaaaa > 1:693848/1‑149 (MQ=255) tcctcctgctgtcgccgactatgcttaacgtttaaaaaagcatcagcactctcgcaacgcactcttattttcccctttagaataccggaggcctg < 4:1195276‑M1/1‑1 (MQ=255) tcctcctgctgtcgccgactatgcttaacgtttaaaaaagcatcagcactctcgcaacgcactcttattttcccctttagaataccggaggcctg > 1:355572‑M1/95‑95 (MQ=255) tcctcctgctgtcgccgactatgcttaacgtttaaaaaagcatcagcactctcgcaacgcactcttattttcccctttagaataccggaggcctg > 3:1195276‑M1/95‑95 (MQ=255) gccgcTGTTGCGGCGCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATaa < 2:697740/143‑1 (MQ=255) gccgcTGTTGCGGCGCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATaa > 1:697740/1‑143 (MQ=255) aacagcggcgCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAg > 3:1143504/5‑110 (MQ=255) aacagcggcgCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAg < 4:1143504/106‑1 (MQ=255) gTTGCGGCGCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAg > 1:617817/1‑109 (MQ=255) gTTGCGGCGCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAg < 2:617817/109‑1 (MQ=255) gactatgcttaacgtttaaaaaagcatcagcactctcgcaacgcactcttattttcccctttagaataccggaggcctGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCa > 1:1412016‑M1/79‑104 (MQ=255) gcTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCt < 4:833618/149‑1 (MQ=255) ttaacgtttaaaaaagcatcagcactctcgcaacgcactcttattttcccctttagaataccggaggcctGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAgg > 3:40499‑M1/71‑98 (MQ=255) ttaacgtttaaaaaagcatcagcactctcgcaacgcactcttattttcccctttagaataccggaggcctGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAgg < 2:894309‑M1/28‑1 (MQ=255) ttaacgtttaaaaaagcatcagcactctcgcaacgcactcttattttcccctttagaataccggaggcctGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAgg < 4:40499‑M1/28‑1 (MQ=255) aCTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCtt < 1:883877/82‑1 (MQ=255) aCTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAg > 3:729327/1‑97 (MQ=255) aCTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAg < 4:729327/97‑1 (MQ=255) aCTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATg > 1:896094/1‑149 (MQ=255) cTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTaaa > 1:1135648/1‑113 (MQ=255) cTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTaaa < 2:1135648/113‑1 (MQ=255) tttAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGc > 1:922569/1‑86 (MQ=255) tttAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATa < 1:985395/91‑1 (MQ=255) tttAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATa > 2:985395/1‑91 (MQ=255) tttAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCt > 3:147017/1‑109 (MQ=255) tttAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCt < 4:147017/109‑1 (MQ=255) tttAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTaaa > 2:51466/1‑112 (MQ=255) tttAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTaaa < 1:51466/112‑1 (MQ=255) tttAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATaa > 4:461650/1‑123 (MQ=255) tttAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATaa < 3:461650/123‑1 (MQ=255) tttAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAaga < 4:454652/125‑1 (MQ=255) tttAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAaga > 3:454652/1‑125 (MQ=255) tttAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCt > 3:1169030/1‑149 (MQ=255) ttAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAaga < 2:353361/124‑1 (MQ=255) ttAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAaga > 1:353361/1‑124 (MQ=255) ttAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCtt < 4:1169030/149‑1 (MQ=255) tCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCga < 2:1259950/131‑1 (MQ=255) tCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCtttttt > 4:1112264/1‑149 (MQ=255) cAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTa > 3:1462290/1‑149 (MQ=255) aGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTaa > 3:684573/1‑149 (MQ=255) gATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAATCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAggg > 3:841967/1‑107 (MQ=255) gATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAggg < 4:841967/107‑1 (MQ=255) aaaagcatcagcactctcgcaacgcactcttattttcccctttagaataccggaggcctgg < 4:1341712‑M1/2‑1 (MQ=255) aaaagcatcagcactctcgcaacgcactcttattttcccctttagaataccggaggcctgg > 3:1341712‑M1/60‑61 (MQ=255) aTCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGCTGCGAGAGTGCTGATGCtttttt > 3:763707/1‑145 (MQ=255) gACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTgg > 3:511742/1‑68 (MQ=255) gACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTgg < 4:511742/68‑1 (MQ=255) gACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTaa < 4:1462290/149‑1 (MQ=255) aCGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAg < 3:1112264/149‑1 (MQ=255) gggTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGTGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCa > 2:527861/1‑149 (MQ=255) tCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGaaaa < 1:590400/100‑1 (MQ=255) tCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGaaaa > 2:590400/1‑100 (MQ=255) tCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTaa > 4:204034/1‑143 (MQ=255) tCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTaa < 3:204034/143‑1 (MQ=255) aCTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCtttt > 4:1230733/1‑128 (MQ=255) aCTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCtttt < 3:1230733/128‑1 (MQ=255) ttAAATCTTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATa > 2:784404/1‑142 (MQ=255) ttAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAggg < 2:453627/89‑1 (MQ=255) ttAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGc > 1:609905/1‑148 (MQ=255) tAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGCGa < 2:896094/149‑1 (MQ=255) 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ccAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTaaa > 1:1030679/1‑149 (MQ=255) cAACCCTATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTaaaa < 2:1030679/149‑1 (MQ=255) cAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTaaa < 1:584291/107‑1 (MQ=255) cAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTaaaa < 1:443345/149‑1 (MQ=255) aaCCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAAc > 1:1310601/1‑149 (MQ=255) aCCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAaga < 4:1042392/73‑1 (MQ=255) 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aTCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCttttt < 1:302478/93‑1 (MQ=255) aTCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCttttt > 2:302478/1‑93 (MQ=255) ttCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGCGACAGCAggagga < 1:711102/124‑1 (MQ=255) GGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAg > 1:501405‑M1/1‑149 (MQ=255) | GTGTAGCTGCCGGAACGCTTGCCGCCAGCGTAGAATGAGGATAAACCACGGCGGTCGCCGCTGTTGCGGCGCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAG > NC_000913/302408‑302700 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |