| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 302552 = | 119 (0.860) | 8 (0.060) | 5/216 | NT | 6.8% | coding (22/690 nt) | paoA | PaoABC aldehyde oxidoreductase, 2Fe‑2S subunit |
| ? | NC_000913 | 302577 = | 107 (0.810) | intergenic (‑4/‑414) | paoA/yagU | PaoABC aldehyde oxidoreductase, 2Fe‑2S subunit/DUF1440 family inner membrane acid resistance protein | |||||
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
CGCCAGCGTAGAATGAGGATAAACCACGGCGGTCGCCGCTGTTGCGGCGCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGT > NC_000913/302430‑302720 | catagctgcattcgcgttttaagaataatcctcctgctgtcgccgactatgcttaacgtttaaaaaagcatcagcactctcgcaacgcactcttattttcccctttagaataccggaggcctGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAg > 4:1226148‑M1/123‑149 (MQ=255)catagctgcattcgcgttttaagaataatcctcctgctgtcgccgactatgcttaacgtttaaaaaagcatcagcactctcgcaacgcactcttattttcccctttagaataccggaggcctGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAg > 3:642849‑M1/123‑149 (MQ=255) gCGTAGAATGAGGATAAACCACGGCGGTCGCCGCTGTTGCGGCGCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCa < 4:348983/143‑1 (MQ=255) gCGTAGAATGAGGATAAACCACGGCGGTCGCCGCTGTTGCGGCGCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCa > 3:348983/1‑143 (MQ=255) gAATGAGGATAAACCACGGCGGTCGCCGCTGTTGCGGCGCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTa > 1:171426/1‑149 (MQ=255) gAGGATAAACCACGGCGGTCGCCGCTGTTGCGGCGCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCt < 2:171426/149‑1 (MQ=255) aCGGCGGTCGCCGCTGTTGCGGCGCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGaaaa > 1:693848/1‑149 (MQ=255) gccgcTGTTGCGGCGCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATaa > 1:697740/1‑143 (MQ=255) gccgcTGTTGCGGCGCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATaa < 2:697740/143‑1 (MQ=255) aacagcggcgCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAg > 3:1143504/5‑110 (MQ=255) aacagcggcgCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAg < 4:1143504/106‑1 (MQ=255) gTTGCGGCGCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAg > 1:617817/1‑109 (MQ=255) gactatgcttaacgtttaaaaaagcatcagcactctcgcaacgcactcttattttcccctttagaataccggaggcctGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCa < 2:1412016‑M1/26‑1 (MQ=255) gactatgcttaacgtttaaaaaagcatcagcactctcgcaacgcactcttattttcccctttagaataccggaggcctGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCa > 1:1412016‑M1/79‑104 (MQ=255) gcTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCt < 4:833618/149‑1 (MQ=255) ttaacgtttaaaaaagcgtcagcactctcgcaacgcactcttattttcccctttagaataccggaggcctGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAgg > 1:894309‑M1/71‑98 (MQ=255) ttaacgtttaaaaaagcatcagcactctcgcaacgcactcttattttcccctttagaataccggaggcctGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAgg < 2:894309‑M1/28‑1 (MQ=255) aCTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATg > 1:896094/1‑149 (MQ=255) cTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTaaa < 2:1135648/113‑1 (MQ=255) cTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTaaa > 1:1135648/1‑113 (MQ=255) tttAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCt > 3:147017/1‑109 (MQ=255) tttAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTaaa > 2:51466/1‑112 (MQ=255) tttAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTaaa < 1:51466/112‑1 (MQ=255) tttAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAaga > 3:454652/1‑125 (MQ=255) tttAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAaga < 4:454652/125‑1 (MQ=255) ttAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAaga > 1:353361/1‑124 (MQ=255) ttAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAaga < 2:353361/124‑1 (MQ=255) ttAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCtt < 4:1169030/149‑1 (MQ=255) tCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCga < 2:1259950/131‑1 (MQ=255) tCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCga > 1:1259950/1‑131 (MQ=255) tCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCtttttt > 4:1112264/1‑149 (MQ=255) tCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCtttttt > 2:184607/1‑149 (MQ=255) tCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCttttgt < 4:1275868/149‑3 (MQ=255) cAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTa > 3:1462290/1‑149 (MQ=255) gATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAATCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAggg > 3:841967/1‑107 (MQ=255) aTCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCtttttt < 4:763707/145‑1 (MQ=255) aTCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGCTGCGAGAGTGCTGATGCtttttt > 3:763707/1‑145 (MQ=255) gcgACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTTTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGtt < 2:693848/149‑1 (MQ=255) gACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCttt < 4:478791/137‑1 (MQ=255) gACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCttt > 3:478791/1‑137 (MQ=255) gACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTaa < 4:1462290/149‑1 (MQ=255) tCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGaaaa < 1:590400/100‑1 (MQ=255) tCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTaa > 4:204034/1‑143 (MQ=255) ttAAATCTTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATa > 2:784404/1‑142 (MQ=255) ttAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAggg > 1:453627/1‑89 (MQ=255) ttAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGc < 2:609905/148‑1 (MQ=255) ttAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGc > 1:609905/1‑148 (MQ=255) 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cAACCCTATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTaaaa < 2:1030679/149‑1 (MQ=255) cAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTaaa < 1:584291/107‑1 (MQ=255) cAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTaaa > 2:584291/1‑107 (MQ=255) cAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTaaaa < 1:443345/149‑1 (MQ=255) aaCCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAAc > 1:1310601/1‑149 (MQ=255) aCCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAaga < 4:1042392/73‑1 (MQ=255) 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CGCCAGCGTAGAATGAGGATAAACCACGGCGGTCGCCGCTGTTGCGGCGCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGT > NC_000913/302430‑302720 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |