| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
TAATATTCATGTTGTCTATGGTTCAGAGCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCT > NC_000913/3630946‑3631241 | tAATATTCATGTTGTCTATGGTTCAGAGCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGTAATTatgc < 2:4275/149‑1 (MQ=255) acagattacagacctaaacttgaagcactattagcatgttcacaaatgttaggtataaatcaagttgttgcacataacggaaatggtggaagagaacgcataggcgaaacggggacagttttaggtcttaacgcccgtgacagtaaaCa < 2:591318‑M1/2‑1 (MQ=255) atTCATGTTGTCTATGGTTCAGAGCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTatgcatgc > 2:1112255/1‑149 (MQ=255) ttCATGTTGTCTATGGTTCAGAGCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCt > 3:753853/1‑149 (MQ=255) aTGTTGTCTATGGTTCAGAGCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGaa > 2:927186/1‑149 (MQ=255) agacctaaacttgaagcactattagcatgttcacaaatgttaggtataaatcaagttgttgcacataacggaaatggtggaagagaacgcataggcgaaacggggacagttttaggtcttaacgcccgtgacagtaaaCATGc > 3:415243‑M1/139‑143 (MQ=255) cTATGGTTCAGAGCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACAttctt > 2:1184600/1‑149 (MQ=255) tATGGTTCAGAGCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACAttcttc < 2:647302/149‑1 (MQ=255) aTGGTTCAGAGCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTatgca < 4:441762/133‑1 (MQ=255) ttCAGAGCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTatgcat > 3:839647/1‑130 (MQ=255) ttCAGAGCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACAAGGGTTAATTTTGCCATTatgcat < 4:839647/130‑1 (MQ=255) agcactattagcatgttcacaaatgttaggtataaatcaagttgttgcacataacggaaatggtggaagagaacgcataggcgaaacggggacagttttaggtcttaacgcccgtgacagtaaaCATGCt < 1:1108808‑M1/6‑1 (MQ=255) agcactattagcatgttcacaaatgttaggtataaatcaagttgttgcacataacggaaatggtggaagagaacgcataggcgaaacggggacagttttaggtcttaacgcccgtgacagtaaaCATGCTGAACATTCTTCCAGCATg > 3:1346360‑M1/125‑148 (MQ=255) tGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACt < 2:1267281/149‑1 (MQ=255) 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cAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGcaa > 4:1019561/1‑126 (MQ=255) cAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGcaa < 3:1019561/126‑1 (MQ=255) cAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGa > 3:1242632/1‑134 (MQ=255) cAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGAt < 3:1307745/135‑1 (MQ=255) aGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAACAttt < 1:854271/149‑1 (MQ=255) gggTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAACATTtg < 1:619347/149‑1 (MQ=255) ggTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGc < 4:1152622/121‑1 (MQ=255) ggTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAACATTtgt < 1:912178/149‑1 (MQ=255) ggTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAACATTtgt < 2:898401/149‑1 (MQ=255) gTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAACATTtgtg > 4:667966/1‑149 (MQ=255) aTTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAACATTTGTGAACa > 1:591318/1‑149 (MQ=255) tttGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAACATTTGTGAACAt < 2:228115/149‑1 (MQ=255) tGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAACATTTGTGAACATGc < 1:299941/149‑1 (MQ=255) aaTTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAACATTTGTGAACATGCTAAt < 3:667966/149‑1 (MQ=255) gcatgcTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAACATTTGTGAACATGCTaa < 4:274064/142‑1 (MQ=255) gcatgcTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAACATTTGTGAACATGCTaa > 3:274064/1‑142 (MQ=255) | TAATATTCATGTTGTCTATGGTTCAGAGCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCT > NC_000913/3630946‑3631241 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |