| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3291700 | 201 (1.460) | 14 (0.110) | 5/214 | NT | 6.5% | coding (360/1092 nt) | yraK | putative fimbrial‑like adhesin protein |
| ? | NC_000913 | = 3291705 | 210 (1.610) | coding (365/1092 nt) | yraK | putative fimbrial‑like adhesin protein | |||||
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
TCTGCGGGTAAGGCAGTTAAACTTGTCTATATGGTCAGCCCCGTACTTACCACCACTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCA > NC_000913/3291557‑3291851 | tctGCGGGTAAGGCAGTTAAACTTGTCTATATGGTCAGCCCCGTACTTACCACCACTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCa < 4:1279656/149‑1 (MQ=255) ggTAAGGCAGTTAAACTTGTCTATATGGTCAGCCCCGTACTTACCACCACTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAggttgt > 4:319986‑M2/1‑143 (MQ=255) aGGCAGTTAAACTTGTCTATATGGTCAGCCCCGTACTTACCACCACTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAggtt < 1:608485‑M2/143‑5 (MQ=255) cAGTTAAACTTGTCTATATGGTCAGCCCCGTACTTACCACCACTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGtt < 4:149593/149‑1 (MQ=255) gTTAAACTTGTCTATATGGTCAGCCCCGTACTTACCACCACTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTaa > 2:1242316/1‑149 (MQ=255) ttGTCTATATGGTCAGCCCCGTACTTACCACCACTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGt > 2:163343/1‑139 (MQ=255) tGGTCAGCCCCGTACTTACCACCACTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAg > 2:633200/1‑149 (MQ=255) tGGTCAGCCCCGTACTTACCACCACTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAg > 3:1278897/1‑149 (MQ=255) tCAGCCCCGTACTTACCACCACTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATa > 2:1210929/1‑149 (MQ=255) ccccGTACTTACCACCACTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATaaaaa > 2:531026/1‑149 (MQ=255) cccGTACTTACCACCACTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATaaaaaa < 1:1162911/149‑1 (MQ=255) ccGTACTTACCACCACTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGt > 3:1093277/1‑121 (MQ=255) ccGTACTTACCACCACTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAaac > 4:281826/1‑149 (MQ=255) gTACTTACCACCACTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAaacaa < 4:1197339/149‑1 (MQ=255) ttACCACCACTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGtt < 2:889218/116‑1 (MQ=255) ttACCACCACTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGa < 1:992470/125‑1 (MQ=255) ttACCACCACTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACg > 4:1388259/1‑149 (MQ=255) ttACCACCACTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACg > 4:289259/1‑149 (MQ=255) accaccACTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGa < 3:552626/123‑1 (MQ=255) accaccACTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGa > 4:552626/1‑123 (MQ=255) accaccACTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTcaca < 2:287287/129‑1 (MQ=255) accaccACTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTcaca > 1:125768/1‑129 (MQ=255) caccacTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGtat > 2:1422984/1‑149 (MQ=255) caccacTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGtat > 1:1052581/1‑149 (MQ=255) accacTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTctct > 1:1192008/1‑108 (MQ=255) accacTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACgg > 1:506679/1‑145 (MQ=255) cacTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATAtt < 1:1210929/149‑1 (MQ=255) ggACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATCACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTctgc > 2:809591/1‑149 (MQ=255) tCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAaacaa < 4:800145/129‑1 (MQ=255) cAGACAGGATATTACAAACACAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAAc < 1:380105/149‑1 (MQ=255) agccAGGATATGACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAAcc > 4:126110/4‑149 (MQ=255) gACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAaca < 1:703935/101‑1 (MQ=255) gACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTctgct > 2:714977/1‑142 (MQ=255) gACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAAccc > 4:923538/1‑149 (MQ=255) tatTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACggg > 2:151715/1‑149 (MQ=255) atTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGgt < 3:289259/149‑1 (MQ=255) ttACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGt < 2:1280561/87‑1 (MQ=255) ttACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATaaaaa < 4:896029/113‑1 (MQ=255) ttACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGgtg > 2:1373028/1‑149 (MQ=255) ttACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGgtg > 3:992888/1‑149 (MQ=255) ttACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGgtg > 3:695730/1‑149 (MQ=255) aCAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAacaaca > 1:1018790/1‑117 (MQ=255) aaaCTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTg > 2:316563/1‑149 (MQ=255) aaCTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTatat < 1:283493/122‑1 (MQ=255) aaCTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGc < 1:151715/149‑1 (MQ=255) aCTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGcc > 1:140914/1‑149 (MQ=255) cTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACg < 4:1038362/138‑1 (MQ=255) tCAATGACAGCCTGGATATTAAACCCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAg < 1:809591/149‑1 (MQ=255) tCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTCCAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTcac < 2:1143309/94‑1 (MQ=255) tCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTcaca < 1:1289982/95‑1 (MQ=255) tCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGttt < 2:259771/144‑1 (MQ=255) cAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAgg < 3:923538/149‑1 (MQ=255) aaTGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAggg < 4:695730/149‑1 (MQ=255) aaTGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAggg > 1:82213/1‑149 (MQ=255) aCAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGAt < 4:530071/149‑1 (MQ=255) ccTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGgt < 2:930323/130‑1 (MQ=255) cTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGtc > 3:29730/1‑149 (MQ=255) ggATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGtctc > 3:200877/1‑149 (MQ=255) atTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATaaaaaa < 1:306424/89‑1 (MQ=255) ttAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTcacac > 1:1332756/1‑78 (MQ=255) ttAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAgg < 4:1356015/132‑1 (MQ=255) ttAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGAt > 1:499211/1‑137 (MQ=255) ttAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTAt < 1:1373028/149‑1 (MQ=255) ttAAAACCACAGTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACTCGATTcacac < 4:949686/78‑1 (MQ=255) tAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATg < 2:1311192/149‑1 (MQ=255) aaaaCCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGgt < 1:925413/120‑1 (MQ=255) aaCCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACTCCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATGGAc > 4:1398194/1‑149 (MQ=255) aaCCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAggg < 2:686999/129‑1 (MQ=255) aaCCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATGGAc > 2:1172526/1‑149 (MQ=255) ggCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGt > 3:1375611/1‑118 (MQ=255) ggCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTaa > 1:72951/1‑144 (MQ=255) ggCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTg < 1:173868/149‑1 (MQ=255) gCAAACGACATTCCTGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTgg > 2:837074/1‑149 (MQ=255) cAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGt < 2:739932/149‑1 (MQ=255) aaaCGACATTCCAGGACTCACAACCCACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACAAGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGgt > 3:36048/1‑103 (MQ=255) aGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGtctc > 3:1461273/1‑113 (MQ=255) tCACAACCGACCAggttgtgagtcctggaatgtcgtttgcctgtaatgtggttttaatatccaggctgtcattgagtttgtaatatcctgtctgatgtccagtggtggtaagtacggggctgaccatatagacaagtttaactgcctta < 4:431528‑M2/149‑137 (MQ=255) tCACAACCGACCAggttgtgagtcctggaatgtcgtttgcctgtaatgtggttttaatatccaggctgtcattgagtttgtaatatcctgtctgatgtccagtggtggtaagtacgg > 3:820730‑M2/1‑13 (MQ=255) tCACAACCGACCAggttgtgagtcctggaatgtcgtttgcctgtaatgtggttttaatatccaggctgtcattgagtttgtaatatcctgtctgatgtccagtggtggtaagtacgg > 3:1296271‑M2/1‑13 (MQ=255) tCACAACCGACCAggttgtgagtcctggaatgtcgtttgcctgtaatgtggttttaatatccaggctgtcattgagtttgtaatatcctgtctgatgtccagtggtggtaagtacgg < 4:1296271‑M2/117‑105 (MQ=255) tCACAACCGACCAggttgtgagtcctggaatgtcgtttgcctgtaatgtggttttaatatccaggctgtcattgagtttgtaatatcctgtctgatgtccagtggtggtaagtacgg > 1:1125744‑M2/1‑13 (MQ=255) tCACAACCGACCAggttgtgagtcctggaatgtcgtttgcctgtaatgtggttttaat < 3:1045709‑M2/58‑46 (MQ=255) tCACAACCGACCAggttgtgagtcctggaatgtcgtttgcctgtaatgtggttttaa < 2:50168‑M2/57‑45 (MQ=255) tCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGt < 3:1218698/131‑1 (MQ=255) tCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTAcc > 1:765872/1‑149 (MQ=255) aacaaCCGACCAgcttgtgagtcctggaatgtcgtttgcctgtaatgtggttttaatatccaggctgtcattgagtttgtaatatcctgtctgatgtccagtggtggtaagtacggggctgaccatatagacaagtttaactgccttac < 4:772747‑M2/148‑138 (MQ=255) acaACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATGGACCCGtt > 3:85321/1‑120 (MQ=255) acaACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATGGACCCGtt < 4:85321/120‑1 (MQ=255) acaACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCt > 1:156657/1‑149 (MQ=255) aaCCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGc > 3:473954/1‑88 (MQ=255) aaCCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGc < 4:473954/88‑1 (MQ=255) aaCCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGt < 3:91344/127‑1 (MQ=255) aCCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACgg < 1:676847/79‑1 (MQ=255) aCCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTa < 3:496747/149‑1 (MQ=255) aCCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTa < 1:837074/149‑1 (MQ=255) cGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCtt < 3:780800/138‑1 (MQ=255) gACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAATACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCttt < 2:1122393/138‑1 (MQ=255) ccAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTGATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCa < 4:1075443/149‑1 (MQ=255) aGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATGGAc > 4:605730/1‑105 (MQ=255) aGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATGGAc < 3:605730/105‑1 (MQ=255) | TCTGCGGGTAAGGCAGTTAAACTTGTCTATATGGTCAGCCCCGTACTTACCACCACTGGACATCAGACAGGATATTACAAACTCAATGACAGCCTGGATATTAAAACCACATTACAGGCAAACGACATTCCAGGACTCACAACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCA > NC_000913/3291557‑3291851 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |