New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 144480 = | 126 (1.270) | 7 (0.080) | 6/248 | NT | 5.9% | intergenic (+8/‑97) | yadH/yadI | putative ABC transporter permease/putative PTS Enzyme IIA |
? | NC_000913 | 144508 = | 106 (1.140) | intergenic (+36/‑69) | yadH/yadI | putative ABC transporter permease/putative PTS Enzyme IIA |
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
ATCAGTGGTTTCCGCTACGGCTTCCTCGGTATCAATGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATAC > NC_000913/144332‑144625 | gtgccccatgttttttctccagcgcatccagtatctcttgcgcccggtcatcgtgacaggtaattacccaacctaacatcgccttcctccttagccgaaaatcagtctaccctgaccattgttgataaagggtgatagccgtcaaaact > 4:795570‑M1/149‑149 (MQ=255) gtgccccatgttttttctccagcgcatccagtatctcttgcgcccggtcatcgtgacaggtaattacccaacctaacatcgccttcctccttagccgaaaatcagtctaccctgaccattgttgataaagggtgatagccgtcaaaact < 1:551838‑M1/1‑1 (MQ=255) tgccccatgttttttctccagcgcatccagtatctcttgcgcccggtcatcgtgacaggtaattacccaacctaacatcgccttcctccttagccgaaaatcagtctaccctgaccattgttgataaagggtgatagccgtcaaaactc > 4:626848‑M1/148‑149 (MQ=255) tgccccatgttttttctccagcgcatccagtatctcttgcgcccggtcatcgtgacaggtaattacccaacctaacatcgccttcctccttagccgaaaatcagtctaccctgaccattgttgataaagggtgatagccgtcaaaactc > 1:237832‑M1/148‑149 (MQ=255) tgccccatgttttttctccagcgcatccagtatctcttgcgcccggtcatcgtgacaggtaattacccaacctaacatcgccttcctccttagccgaaaatcagtctaccctgaccattgttgataaagggtgatagccgtcaaaactc > 1:627129‑M1/148‑149 (MQ=255) tCAGTGGTTTCCGCTACGGCTTCCTCGGTATCAATGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTtc > 2:100930/1‑149 (MQ=255) tCAGTGGTTTCCGCTACGGCTTCCTCGGTATCAATGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTtc < 2:35659/149‑1 (MQ=255) tCAGTGGTTTCCGCTACGGCTTCCTCGGTATCAATGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTtc > 4:713878/1‑149 (MQ=255) cAGTGGTTTCCGCTACGGCTTCCTCGGTATCAATGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGCTCCACCGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTTTTtcc < 2:261196/149‑1 (MQ=255) cAGTGGTTTCCGCTACGGCTTCCTCGGTATCAATGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTtcc < 1:726183/149‑1 (MQ=255) aGTGGTTTCCGCTACGGCTTCCTCGGTATCAATGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTtcct > 1:243179/1‑149 (MQ=255) gCTACGGCTTCCTCGGTATCAATGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGa > 4:721146/1‑149 (MQ=255) gCTACGGCTTCCTCGGTATCAATGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGa > 4:224734/1‑149 (MQ=255) cTACGGCTTCCTCGGTATCAATGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGAt > 3:279687/1‑149 (MQ=255) gCTTCCTCGGTATCAATGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTggg < 4:209706/149‑1 (MQ=255) gCTTCCTCGGTATCAATGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTggg < 3:750294/149‑1 (MQ=255) gCTTCCTCGGTATCAATGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATACAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTggg < 2:350016/149‑1 (MQ=255) ttCCTCGGTATCAATGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTggggg > 3:346894/1‑149 (MQ=255) cTCGGTATCAATGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGgaga < 1:706752/149‑1 (MQ=255) ccagtatctgttgcgcccggtcatcgtgacaggtaattacccaaccttacatcgccttcctccgtagccgaaaatcagtctaccctgaccattgttgataaagggtgatagccgtcaaaacTCCTCTCGTCGGGATTTGGGGGagaggt > 2:841919‑M1/122‑148 (MQ=255) tATCAATGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGt < 2:852168/149‑1 (MQ=255) aTCAATGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGtt > 4:147176/1‑149 (MQ=255) tatctcttgcgcccggtcatcgtgacaggtaattacccaacctaacatcgccttcctccttagccgaaaatcagtctaccctgaccattgttgataaagggtgatagccgtcaaaacTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGttt > 1:381752‑M1/118‑149 (MQ=255) tCAATGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGttt < 2:834588/149‑1 (MQ=255) cAATGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGtttt < 1:127323/149‑1 (MQ=255) atctcttgcgcccggtcatcgtgacaggtaattacccaacctaacatcgccttcctccttagccgaaaatcagtctaccctgaccattgttgataaagggtgatagccgtcaaaacTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGtttt > 1:292745‑M1/117‑149 (MQ=255) aaTGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTgggg < 2:76969/136‑1 (MQ=255) aaTGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGgaga < 2:444308/140‑1 (MQ=255) atgatgTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGa < 3:721146/149‑1 (MQ=255) tgatgTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGa < 4:635427/148‑1 (MQ=255) agatgTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGa > 3:635427/2‑148 (MQ=255) gatgTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGtttt < 1:51187/145‑1 (MQ=255) gatgTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGtttt > 2:51187/1‑145 (MQ=255) gatgTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACg > 3:730175/1‑149 (MQ=255) cTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGGGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCAcc > 3:261748/1‑149 (MQ=255) gTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCAcc < 3:636149/146‑1 (MQ=255) tCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCttt < 2:143579/149‑1 (MQ=255) aCTACCTTTGGCGTACTGGAGGTCTGTATGGTGGCGTTTGATTTGATCTGTTTGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATATCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTAt > 4:556246/1‑149 (MQ=255) tACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGc > 3:42731/1‑134 (MQ=255) tACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGc < 4:42731/134‑1 (MQ=255) tACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATca > 2:854248/1‑149 (MQ=255) cTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATtaaca > 3:501483/1‑149 (MQ=255) ttGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAAt > 4:748758/1‑149 (MQ=255) gCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGt < 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tttGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGaa > 4:190504/1‑149 (MQ=255) tttGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGaa > 2:90107/1‑149 (MQ=255) tttGATCTGTTGGTCGCTGATAGAACGTGGGCGAGGTTTGGGTAGTTAAGGGGATTTCCGCTCATCTGGATTTGGGGGAGAAGAGTTTTGGGGGCTTTCACCCTTGATCATCAATGGTAAGAGTAGTCTGATTTGCGGTTAAggaggag > 2:44619/1‑148 (MQ=255) ttGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAg < 3:416826/149‑1 (MQ=255) gATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGc > 4:739160/1‑149 (MQ=255) 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acgtggTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCa > 1:692176/1‑149 (MQ=255) tggTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGa < 3:393971/149‑1 (MQ=255) tttGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAag > 4:107988/1‑107 (MQ=255) tttGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAag < 3:107988/107‑1 (MQ=255) gTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCggg > 2:771112/1‑149 (MQ=255) gCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGgcgc > 4:50741/1‑149 (MQ=255) agccgtcaaaacTCCTCTCCCCCAAATCCAGAGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCt > 4:874366‑M1/13‑131 (MQ=255) agccgtcaaaacTCCTCTCCCCCAAATCCAGAGGAGAGGAGGTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCt < 3:874366‑M1/119‑1 (MQ=255) aGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAaga < 4:413437/149‑1 (MQ=255) tATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATa > 1:309633/1‑149 (MQ=255) aTTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATAc < 3:241898/149‑1 (MQ=255) | ATCAGTGGTTTCCGCTACGGCTTCCTCGGTATCAATGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATAC > NC_000913/144332‑144625 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |