| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 144480 = | 126 (1.270) | 7 (0.080) | 6/248 | NT | 5.9% | intergenic (+8/‑97) | yadH/yadI | putative ABC transporter permease/putative PTS Enzyme IIA |
| ? | NC_000913 | 144508 = | 106 (1.140) | intergenic (+36/‑69) | yadH/yadI | putative ABC transporter permease/putative PTS Enzyme IIA | |||||
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
TATCAATGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATACTGGATGCGCTGGAGAAAAAACATGGGGCAC > NC_000913/144361‑144655 | aTCAATGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGtt > 4:147176/1‑149 (MQ=255) tatctcttgcgcccggtcatcgtgacaggtaattacccaacctaacatcgccttcctccttagccgaaaatcagtctaccctgaccattgttgataaagggtgatagccgtcaaaacTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGttt > 1:381752‑M1/118‑149 (MQ=255) cAATGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGtttt < 1:127323/149‑1 (MQ=255) atctcttgcgcccggtcatcgtgacaggtaattacccaacctaacatcgccttcctccttagccgaaaatcagtctaccctgaccattgttgataaagggtgatagccgtcaaaacTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGtttt > 1:292745‑M1/117‑149 (MQ=255) atgatgTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGa < 3:721146/149‑1 (MQ=255) tgatgTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGAc < 1:68422/149‑1 (MQ=255) gatgTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGtttt < 1:51187/145‑1 (MQ=255) gatgTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACg > 4:207395/1‑149 (MQ=255) atgTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACgg < 4:279687/149‑1 (MQ=255) gTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCt > 1:631074/1‑149 (MQ=255) tCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTAt > 3:220490/1‑149 (MQ=255) cTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGGGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCAcc > 3:261748/1‑149 (MQ=255) gTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCAcc > 4:636149/1‑146 (MQ=255) gTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCAcc < 3:636149/146‑1 (MQ=255) tCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCttt < 2:143579/149‑1 (MQ=255) cACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTa < 4:561063/149‑1 (MQ=255) tACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGc > 3:42731/1‑134 (MQ=255) tACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATca > 2:544988/1‑149 (MQ=255) tACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATca > 2:854248/1‑149 (MQ=255) cTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATtaaca > 3:501483/1‑149 (MQ=255) aggtaattacccaacctaacatcgccttcctccttagccgaaaatcagtctaccctgaccattgttgataaagggtgatagccgtcaaacctcctctcctctggatttgggggagaggaGTTTTGACGGCt < 3:874366‑M2/12‑1 (MQ=255) gCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGt < 2:631074/149‑1 (MQ=255) gCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGt < 4:469774/149‑1 (MQ=255) tACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAg < 2:819633/149‑1 (MQ=255) tggtggTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAgg < 1:47808/147‑1 (MQ=255) tggtggTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAgg > 2:47808/1‑147 (MQ=255) tggtggTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGt > 2:10680/1‑149 (MQ=255) gtggtCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGttt > 1:848193/1‑111 (MQ=255) gtggtCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGttt < 2:848193/111‑1 (MQ=255) gtggtCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAg > 3:65247/1‑149 (MQ=255) ggcTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATCTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACt > 1:204750/3‑149 (MQ=255) tttATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACt > 3:98317/1‑146 (MQ=255) ttATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGAtt < 3:1303/149‑1 (MQ=255) ttGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTc < 3:207395/149‑1 (MQ=255) ttGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTc < 3:283523/149‑1 (MQ=255) tgGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATcaa > 1:338764/1‑121 (MQ=255) tgGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGc < 1:18112/149‑1 (MQ=255) cGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTaa < 2:14141/149‑1 (MQ=255) cGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTaa < 3:172557/149‑1 (MQ=255) tttATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAag > 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tCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGa < 4:501483/149‑1 (MQ=255) tGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATg > 2:500623/1‑149 (MQ=255) tGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATg < 3:224734/149‑1 (MQ=255) gTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGt > 1:724410/1‑149 (MQ=255) ttGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGtt < 3:740002/149‑1 (MQ=255) tGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTa < 2:884383/149‑1 (MQ=255) tGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTa < 4:65247/149‑1 (MQ=255) tGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTa < 3:511626/149‑1 (MQ=255) ggTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAg < 2:503426/149‑1 (MQ=255) gCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTg > 1:876588/1‑149 (MQ=255) 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< 4:730175/149‑1 (MQ=255) ggCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAagag > 3:188923/1‑149 (MQ=255) aaaactcctctcccccaaatccagaggagaggaGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGAt > 1:292745‑M2/34‑149 (MQ=255) tATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATa > 1:309633/1‑149 (MQ=255) aTTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCGGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATAc > 2:423330/1‑149 (MQ=255) acctctcccccaaatcccgacgagaggaGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTACGGAGGAAGGCGATGTAAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAACAGATACTgg > 2:841919‑M2/29‑149 (MQ=255) ctctcccccaaatccagaggagaggaGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTaa < 4:257687‑M2/58‑1 (MQ=255) ctctcccccaaatccagaggagaggaGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTaa > 3:257687‑M2/27‑84 (MQ=255) CTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATACTGGAt > 3:739160‑M1/1‑149 (MQ=255) CTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATACTGGAt > 3:713878‑M1/1‑149 (MQ=255) TCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATACTGGATgcg < 3:43698‑M1/149‑1 (MQ=255) CCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATACTGGATgcgc > 2:317480‑M1/1‑149 (MQ=255) CTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATACTgg > 4:92656‑M1/1‑142 (MQ=255) CTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATACTGGATGCGCt < 1:7054‑M1/149‑1 (MQ=255) tctGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTa < 4:275824/61‑1 (MQ=255) tctGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATACTGGATGCGCTg < 3:550290/149‑1 (MQ=255) tGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATACTGGATGCGCTGga < 4:261748/149‑1 (MQ=255) tttGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATACTGGATGCGCTGGAGaaa > 3:555101/1‑149 (MQ=255) gagaggaGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGAt > 4:709502‑M2/8‑78 (MQ=255) gagaggaGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGAt < 3:709502‑M2/71‑1 (MQ=255) gaGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATACTGGATGCGCTGGAGAAAAAACATGGGGCa > 1:237832‑M2/3‑149 (MQ=255) gaGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATACTGGATGCGCTGGAGAAAAAACATGGGGCa > 4:626848‑M2/3‑149 (MQ=255) gaGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATACTGGATGCGCTGGAGAAAAAACATGGGGCa > 1:627129‑M2/3‑149 (MQ=255) aGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATACTGGATGCGCTGGAGAAAAAACATGGGGCAc < 1:551838‑M2/148‑1 (MQ=255) aGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATACTGGATGCGCTGGAGAAAAAACATGGGGCAc < 1:577937‑M2/148‑1 (MQ=255) aGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATACTGGATGCGCTGGAGAAAAAACATGGGGCAc > 4:795570‑M2/2‑149 (MQ=255) gTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATACTGGATGCGCTGGAGAAAAAACAt > 3:53985/1‑141 (MQ=255) gTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATACTGGATGCGCTGGAGAAAAAACAt < 4:53985/141‑1 (MQ=255) | TATCAATGATGTTCCGCTGGTCACTACCTTTGGCGTACTGGTGGTCTTTATTGTGGCGTTTTATTTGATCTGTTGGTCGCTGATCCAACGTGGACGTGGTTTGCGTAGCTAAGGCTATTTCCTCTCCTCTGGATTTGGGGGAGAGGAGTTTTGACGGCTATCACCCTTTATCAACAATGGTCAGGGTAGACTGATTTTCGGCTAAGGAGGAAGGCGATGTTAGGTTGGGTAATTACCTGTCACGATGACCGGGCGCAAGAGATACTGGATGCGCTGGAGAAAAAACATGGGGCAC > NC_000913/144361‑144655 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |