New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3477954 | 65 (0.760) | 3 (0.040) | 3/260 | NT | 4.6% | coding (544/591 nt) | slyD | FKBP‑type peptidyl prolyl cis‑trans isomerase (rotamase) |
? | NC_000913 | = 3478025 | 60 (0.720) | coding (473/591 nt) | slyD | FKBP‑type peptidyl prolyl cis‑trans isomerase (rotamase) | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ATTCCCCGCTTTTTTGTCACTTTTTCGGTATTAGTGGCAACCGCAACCGCCGTTGCCTTTACCGCCACAGCAGCCTTCGCCACCGTGTTCATGACCGTGATCGTGGCCATGACCGCCGCAGCAACCGTCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCGTGCGCGCCGTGAACGTGACCATGAGCCAGTTCTTCTTCAGTCGCTTCGCGAATCGCCACAACTTCAACGTTGAATTTCAGGTTCTGACCGGCCAGCATGTGGTTACCATCAACCACGACGTGATCGTCTTCAACCGCAGTGA > NC_000913/3477877‑3478172 | aTTCCCCGCTTTTTTGTCACTTTTTCGGTATTAGTGGCAACCGCAACCGCCGTTGCCTTTACCGCCACAGCAGCCTTCGCCACCGTGTTCATGACCGTGATCGTGGCCATGACCGCCGCAGCAACCGTCGTGGTCGTGATCgtggtggt < 2:148458/149‑1 (MQ=255) cccGCTTTTTTGTCACTTTTTCGGTATTAGTGGCAACCGCAACCGCCGTTGCCTTTACCGCCACAGCAGCCTTCGCCACCGTGTTCATGACCGTGATCGTGGCCATGACCGCCGCAGCAACCGTCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATc > 2:222781/1‑149 (MQ=255) ccGCTTTTTTGTCACTTTTTCGGTATTAGTGGCAACCGCAACCGCCGTTGCCTTTACCGCCACAGCAGCCTTCGCCACCGTGTTCATGACCGTGATCGTGGCCATGACCGCCGCAGCAACCGTCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCg > 2:243918/1‑149 (MQ=255) ccGCTTTTTTGTCACTTTTTCGGTATTAGTGGCAACCGCAACCGCCGTTGCCTTTACCGCCACAGCAGCCTTCGCCACCGTGTTCATGACCGTGATCGTGGCCATGACCGCCGCAGCAACCGTCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCg > 1:63821/1‑149 (MQ=255) ccGCTTTTTTGTCACTTTTTCGGTATTAGTGGCAACCGCAACCGCCGTTGCCTTTACCGCCACAGCAGCCTTCGCCACCGTGTTCATGACCGTGATCGTGGCCATGACCGCCGCAGCAACCGTCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCg > 3:594334/1‑149 (MQ=255) ccGCTTTTTTGTCACTTTTTCGGTATTAGTGGCAACCGCAACCGCCGTTGCCTTTACCGCCACAGCAGCCTTCGCCACCGTGTTCATGACCGTGATCGTGGCCATGACCGCCGCAGCAACCGTCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCg > 4:668911/1‑149 (MQ=255) ccGCTTTTTTGTCACTTTTTCGGTATTAGTGGCAACCGCAACCGCCGTTGCCTTTACCGCCACAGCAGCCTTCGCCACCGTGTTCATGACCGTGATCGTGGCCATGACCGCCGCAGCAACCGTCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCg > 3:203715/1‑149 (MQ=255) ccGCTTTTTTGTCACTTTTTCGGTATTAGTGGCAACCGCAACCGCCGTTGCCTTTACCGCCACAGCAGCCTTCGCCACCGTGTTCATGACCGTGATCGTGGCCATGACCGCCGCAGCAACCGTCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCg > 3:95087/1‑149 (MQ=255) ccGCTTTTTTGTCACTTTTTCGGTATTAGTGGCAACCGCAACCGCCGTTGCCTTTACCGCCACAGCAGCCTTCGCCACCGTGTTCATGACCGTGATCGTGGCCATGACCGCCGCAGCAACCGGCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCg > 1:173394/1‑149 (MQ=255) cGCTTTTTTGTCACTTTTTCGGTATTAGTGGCAACCGCAACCGCCGTTGCCTTTACCGCCACAGCAGCCTTCGCCACCGTGTTCATGACCGTGATCGTGGCCATGACCGCCGCAGCAACCGTCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCGt > 2:544448/1‑149 (MQ=255) gTCACTTTTTCGGTATTAGTGGCAACCGCAACCGCCGTTGCCTTTACCGCCACAGCAGCCTTCGCCACCGTGTTCATGACCGTGATCGTGGCCATGACCGCCGCAGCAACCGTCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCGTGCGCGCCGt < 4:749598/149‑1 (MQ=255) ttCAGTATTAGTGGCAACCGCAACCGCCGTTGCCTTTACCGCCACAGCAGCCTTCGCCACCGTGTTCATGACCGTGATCGTGGCCATGACCGCCGCAGCAACCGTCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCGTGCGCGCCGTGAACGTGa < 1:637847/149‑1 (MQ=255) gTATTAGTGGCAACCGCAACCGCCGTTGCCTTTACCGCCACAGCAGCCTTCGCCACCGTGTTCATGACCGTGATCGTGGCCATGACCGCCGCAGCAACCGTCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCGTGCGCGCCGTGAACGTGACCAt < 2:541279/149‑1 (MQ=255) tATTAGTGGCAACCGCAACCGCCGTTGCCTTTACCGCCACAGCAGCCTTCGCCACCGTGTTCATGACCGTGATCGTGGCCATGACCGCCGCAGCAACCGTCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCGTGCGCGCCGTGAACGTGACCATg < 3:159118/149‑1 (MQ=255) aTTAGTGGCAACCGCAACCGCCGTTGCCTTTACCGCCACAGCAGCCTTCGCCACCGTGTTCATGACCGTGATCGTGGCCATGACCGCCGCAGCAACCGTCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCGTGCGCGCCGTGAACGTGACCATGa > 2:323084/1‑149 (MQ=255) tAGTGGCAACCGCAACCGCCGTTGCCTTTACCGCCACAGCAGCCTTCGCCACCGTGTTCATGACCGTGATCGTGGCCATGACCGCCGCAGCAACCGTCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCGTGCGCGCCGTGAACGTGACCATGAGc < 4:203715/149‑1 (MQ=255) gTGGCAACCGCAACCGCCGTTGCCTTTACCGCCACAGCAGCCTTCGCCACCGTGTTCATGACCGTGATCGTGGCCATGACCGCCGCAGCAACCGTCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCGTGCGCGCCGTGAACGTGACCATGAGCCa > 3:616475/1‑149 (MQ=255) caaccgcaaccgCCGTTGCCTTTACCGCCACAGCAGCCTTCGCCACCGTGTTCATGACCGTGATCGTGGCCATGACCGCCGCAGCAACCGTCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCGTGCGCGCCGTGAACGTGACCATGAGCCAGttc < 3:686845/149‑1 (MQ=255) ccgcaaccgcCGTTGCCTTTACCGCCACAGCAGCCTTCGCCACCGTGTTCATGACCGTGATCGTGGCCATGACCGCCGCAGCAACCGTCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCGTGCGCGCCGTGAACGTGACCATGAGCCAGttcttc < 3:668911/149‑1 (MQ=255) aaccgcCGTTGCCTTTACCGCCACAGCAGCCTTCGCCACCGTGTTCATGACCGTGATCGTGGCCATGACCGCCGCAGCAACCGTCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCGTGCGCGCCGTGAACGTGACCATGAGCCAGTTCTTCTTCa < 3:277016/149‑1 (MQ=255) aaccgcCGTTGCCTTTACCGCCACAGCAGCCTTCGCCACCGTGTTCATGACCATGATCGTGGCCATGACCGCCGCAGCAACCGTCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCGTGCGCGCCGTGAACGTGACCATGAGCCAGTTCTTCTTCa < 2:775488/149‑1 (MQ=255) ccgccgTTGCCTTTACCGCCACAGCAGCCTTCGCCACCGTGTTCATGACCGTGATCGTGGCCATGACCGCCGCAGCAACCGTCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCGTGCGCGCCGTGAACGTGACCATGAGCCAGTTCTTCTTCAGt < 1:646978/149‑1 (MQ=255) gccgTTGCCTTTACCGCCACAGCAGCCTTCGCCACCGTGTTCATGACCGTGATCGTGGCCATGACCGCCGCAGCAACCGTCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCGTGCGCGCCGTGAACGTGACCATGAGCCAGTTCTTCTTCAGTCg > 3:253374/1‑149 (MQ=255) 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gcagcaACCGTCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCGTGCGCGCCGTGAACGTGACCATGAGCCAGTTCTTCTTCAGTCGCTTCGCGAATCGCCACAACTTCAACGTTGAATTTCAGGTTCTGACCGGCCAGCATGTGGTTACCATCaa < 3:423222/149‑1 (MQ=255) cagcaACCGTCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCGTGCGCGCCGTGAACGTGACCATGAGCCAGTTCTTCTTCAGTCGCTTCGCGAATCGCCACAACTTCAACGTTGAATTTCAGGTTCTGACCGGCCAGCATGTGGTTACCATCAAc < 4:82776/149‑1 (MQ=255) aCCGTCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCGTGCGCGCCGTGAACGTGACCATGAGCCAGTTCTTCTTCAGTCGCTTCGCGAATCGCCACAACTTCAACGTTGAATTTCAGGTTCTGACCGGCCAGCATGTGGTTACCATCAACCacga > 1:690091/1‑149 (MQ=255) cgtcgtGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCGTGCGCGCCGTGAACGTGACCATGAGCCAGTTCTTCTTCAGTCGCTTCGCGAATCGCCACAACTTCAACGTTGAATTTCAGGTTCTGACCGGCCAGCATGTGGTTACCATCAACCacgacg > 3:463878/1‑149 (MQ=255) cgtggtcgtgATCGTGGTGGTGATCGTGCGCGCCGTGAACGTGACCATGAGCCAGTTCTTCTTCAGTCGCTTCGCGAATCGCCACAACTTCAACGTTGAATTTCAGGTTCTGACCGGCCAGCATGTGGTTACCATCAACCACGACGTGa < 1:323084/149‑1 (MQ=255) 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gtgATCGTGCGCGCCGTGAACGTGACCATGAGCCAGTTCTTCTTCAGTCGCTTCGCGAATCGCCACAACTTCAACGTTGAATTTCAGGTTCTGACCGGCCAGCATGTGGTTACCATCAACCACGACGTGATCGTCTTCAACCGCAGTGa > 4:629292/1‑149 (MQ=255) | ATTCCCCGCTTTTTTGTCACTTTTTCGGTATTAGTGGCAACCGCAACCGCCGTTGCCTTTACCGCCACAGCAGCCTTCGCCACCGTGTTCATGACCGTGATCGTGGCCATGACCGCCGCAGCAACCGTCGTGGTCGTGATCGTGGTGGTGATCGTGCGCGCCGTGAACGTGACCATGAGCCAGTTCTTCTTCAGTCGCTTCGCGAATCGCCACAACTTCAACGTTGAATTTCAGGTTCTGACCGGCCAGCATGTGGTTACCATCAACCACGACGTGATCGTCTTCAACCGCAGTGA > NC_000913/3477877‑3478172 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |