New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4522063 | 65 (0.760) | 3 (0.040) | 3/242 | NT | 4.7% | intergenic (‑43/+64) | yjhF/yjhG | putative transporter/putative dehydratase |
? | NC_000913 | = 4522085 | 62 (0.800) | intergenic (‑65/+42) | yjhF/yjhG | putative transporter/putative dehydratase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTCACGGCCTGAAGCATTGCCCATAGCC > NC_000913/4521939‑4522233 | aCGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGag < 2:695482‑M2/149‑3 (MQ=255) aCGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGag < 3:60558‑M2/149‑3 (MQ=255) gAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGagtc < 1:37501‑M2/149‑5 (MQ=255) acaaacGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGagtcgga < 4:688788‑M2/149‑8 (MQ=255) aaacGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGagtcggata < 2:468891‑M2/149‑10 (MQ=255) aacGTATTAAGCTTAATTTGTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGagtcggataa < 4:554818‑M2/149‑11 (MQ=255) cGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAAtt < 4:659717/149‑1 (MQ=255) tATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCa > 2:477275/1‑149 (MQ=255) tATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCa < 3:657912/149‑1 (MQ=255) aTTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAg < 1:676854/149‑1 (MQ=255) ttAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTg > 1:429682/1‑149 (MQ=255) aaTTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGa < 2:673370/149‑1 (MQ=255) ggTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTtttat > 2:455204/1‑149 (MQ=255) gTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTtttatt > 1:760366/1‑149 (MQ=255) tAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTtttattta > 4:542291/1‑149 (MQ=255) aaaaGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGagtcgga < 2:520415‑M2/119‑8 (MQ=255) aaaaGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGagtcgga > 1:520415‑M2/1‑112 (MQ=255) aaaaGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTttatttat < 4:650791/149‑1 (MQ=255) aaaaGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTttatttat < 3:142654/149‑1 (MQ=255) aaGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGc > 2:414825/1‑149 (MQ=255) ggAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCa < 2:446176/149‑1 (MQ=255) aaGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGttttt > 1:653983/1‑149 (MQ=255) aaGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGttttt > 1:405374/1‑149 (MQ=255) aGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTa < 3:9180/149‑1 (MQ=255) cAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTAtt < 2:760366/149‑1 (MQ=255) tCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCAt < 3:357209/149‑1 (MQ=255) gCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAAt < 2:582057/149‑1 (MQ=255) caACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGGATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATcgcg > 4:209352/1‑149 (MQ=255) aCGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCa > 3:378400/1‑149 (MQ=255) gATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCaaa > 3:710317/1‑149 (MQ=255) ttAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCcgc < 1:468891/149‑1 (MQ=255) gTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGcc > 4:90915/1‑149 (MQ=255) tAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGttt < 1:108824/95‑1 (MQ=255) tAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGttt > 2:108824/1‑95 (MQ=255) tAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAAtttt < 3:663975/149‑1 (MQ=255) tAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAAtttt > 3:379079/1‑149 (MQ=255) aCGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGt < 4:378400/149‑1 (MQ=255) cGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGtt < 2:109924/149‑1 (MQ=255) gTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGgt > 1:731434/1‑79 (MQ=255) gTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGgt < 2:731434/79‑1 (MQ=255) tctcATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGAt < 1:538771/83‑1 (MQ=255) tctcATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGAt > 2:538771/1‑83 (MQ=255) tctcATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTAcat > 4:443464/1‑149 (MQ=255) tcATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTAcatca > 2:571360/1‑149 (MQ=255) tcATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTAcatca > 2:497482/1‑149 (MQ=255) tcATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTAcatca > 3:269810/1‑149 (MQ=255) aTAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATa > 2:97516/1‑149 (MQ=255) tAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATa < 2:470313/148‑1 (MQ=255) tAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATa > 1:470313/1‑148 (MQ=255) aGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATAc > 3:227430/1‑149 (MQ=255) ccATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCAt > 3:607691/1‑149 (MQ=255) catcatTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATg > 1:447331/1‑149 (MQ=255) atcatTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGAt < 4:732771/61‑1 (MQ=255) atcatTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGAt > 3:732771/1‑61 (MQ=255) tcatTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGagtcggataatgatgggtcgctaccctgttatgagaggacgttatgccactaattatcgttgtggcagggattgctttactcctgcttttaaccataaaaattaagcttaatac < 1:426160‑M2/149‑115 (MQ=255) atTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTccc < 2:23775/149‑1 (MQ=255) ttATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCcca < 3:688788/149‑1 (MQ=255) ccGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCcaccac > 1:487166/1‑149 (MQ=255) gACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGagtcggataatgatgggtcgctaccctgttatgagaggacgttatgccactaattatcgttgtggcagggattgctttactcctgctttt > 2:111860‑M2/1‑26 (MQ=255) gACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGagtcggataatgatgggtcgctaccctgttatgagaggacgttatgccactaattatcgttgtggcagggattgctttactcctgctttt < 1:111860‑M2/116‑91 (MQ=255) gACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATg < 3:553294/138‑1 (MQ=255) gACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATg > 4:553294/1‑138 (MQ=255) gACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTc < 1:108953/149‑1 (MQ=255) gACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTc > 2:397761/1‑149 (MQ=255) gACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTc > 1:401022/1‑149 (MQ=255) aCTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTCa > 2:56196/1‑149 (MQ=255) cTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTCAc < 3:148278/149‑1 (MQ=255) gAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTCTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTCACgg > 1:550564/1‑149 (MQ=255) aaTAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTCACGGCCTGa > 2:667074/1‑149 (MQ=255) aaTAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTCACGGCCTGa < 2:653983/149‑1 (MQ=255) aTAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTCACGGCCTGaa < 2:447331/149‑1 (MQ=255) aTAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTCACGGCCTGaa < 4:682844/149‑1 (MQ=255) aTAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTCACGGCCTGaa < 1:380979/149‑1 (MQ=255) tAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTCACGGCCTGAAg > 2:247579/1‑149 (MQ=255) cggatgatgCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTCACGGCCTGAAGCAt < 3:209352/146‑1 (MQ=255) cGAATGTTGCAGAGTCGGATAATTAAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTCACGGCCTGAAGCAt < 3:554818/149‑1 (MQ=255) atgatgCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTCACGGCCTGAAGCATTGc < 4:599550/149‑1 (MQ=255) agagTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGGGCAGAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTCACGGCCTGAAGCATTGCCCATAGc > 4:297659/1‑149 (MQ=255) gagtcggataatgatgggtcgctaccctgttatgagaggacgttatgccactaattatcgttgtggcagggattgctttactcctgcttttaaccataaaaattaagcttaatacgtttgtttcgttaattattgtctcgattgctgtc > 2:426160‑M2/1‑1 (MQ=255) | ACGAAACAAACGTATTAAGCTTAATTTTTATGGTTAAAAGCAGGAGTAAAGCAATCCCTGCCACAACGATAATTAGTGGCATAACGTCCTCTCATAACAGGGTAGCGACCCATCATTATCCGACTGAGCAAATAACGAATGATGCAGAGTCGGATAATTCAGGTGTCTGGATGTTTTTATTTATGCTTTCAGTTTTTATTCATAAAATCGCGCAAAGCCGCGCCAATTTTGTTTACATCATAAATACAACCGGTCCATGTCCCACCACTCACGGCCTGAAGCATTGCCCATAGCC > NC_000913/4521939‑4522233 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |