New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3209213 | 121 (0.920) | 3 (0.020) | 3/480 | 12.3 | 2.5% | coding (1190/1464 nt) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte |
? | NC_000913 | = 3209256 | 117 (0.930) | coding (1233/1464 nt) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
TATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTACACCATACGCCACCGGCCCCAGTCCGATTTACTACGGCAGTGGTTATCTGCCAACGGCGGATTACTGGCGACTGGGGGCGATTTTTGGGCTGATATTCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGT > NC_000913/3208941‑3209477 | tatCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGGTGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCa < 1:473394/275‑1 (MQ=255) tCGGTGCCGCGAGTGTCGGTGACCGCGTGGTGGCACTGATGCTGCGTCTGAGCATTATCGGTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACg < 3:267178/275‑1 (MQ=255) tGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATGTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCg > 3:564135/1‑274 (MQ=255) tGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCTCCAGCGCCACGGCg > 1:106355/1‑274 (MQ=255) tGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCCCGGCGta > 2:91383/1‑276 (MQ=255) tGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGAGATGGTGGCGTTGTTTGTGGTGTTTTATCTTCTGTGCTACTTTTTCTCCAGCGCCACgcc > 2:334929/1‑271 (MQ=255) tGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCCCTTATCACCCCCGCTCCCGGCCCCAACAACACCGGTTTTATTCGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTCATCCGCCAACGATGCGGATGGTGGCGTTGTGTGGGGTGTTTTATCTACTCCGCTAGTTTTTCCACAGCGCCACgctg > 3:12885/1‑271 (MQ=255) gcggcgATGGTCGGTTACCGCGTGGTGGGACTGGTGCTGCTTCTGAGCATTATCAGTGGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGta < 4:587945/272‑1 (MQ=255) gTCGTTTACAGGGTGTTGGCGCTGTTGCTGCTTCTGCGCCTTAGCAGTTTGTACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACCTTTTCTTCTAGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGTTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 2:457449/276‑1 (MQ=255) gTCGGTTACAGCGTGGTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGTTACTTTTTCGCCAGCGCCACGTCGTATACCTCCCct > 2:478456/1‑276 (MQ=255) 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gATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCCTCTGGCTGGCCCAGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCACCACCCCCGGTTTTATTAGGTGGTTTGGCAAACTGTTAGTAGGCAGCTTACCAGGTTATTCGCCAACGCTGGTGATGGTGGCGTGGATTGGGGTGTTTTATTTACTGCGCTCGTTTTTCGCTCGCGCCACGGGGTCTACATCCACTATCCCACCGACGCTGACtgcc > 3:192893/1‑273 (MQ=255) gATGCTGCTTCGTCGCATTGTCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctg < 1:600849/275‑1 (MQ=255) aTGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTCCTTCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTTTACCTCCTCTCCCGCACCGATGATGATtgctg > 1:260533/1‑274 (MQ=255) cattagtatgctggACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGACTAGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGTTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGcc < 4:237909/264‑1 (MQ=255) cATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCTAGCGCCACGGCGTATACCGCCGCTCTCGCACCGATGAGGATTGCTGCTGCGCTGGCGCTGc > 2:20221/1‑275 (MQ=255) gTTGGGAGAAGACTGTCAGTAATGAGACGGCAGGGAACGTTTGGTTCGGGTTGGCCGAGCTTATCACCCTGCCCCCCGGACTTAACAACACCGGGTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTAGTGGTGGCGTTGATTGTGTTGTTTTATCTACTGCGCTGCTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGaaaaagtagcg < 3:355324/274‑11 (MQ=255) gTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCAAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTTCGCTAATTGTTCGCCAGCGCCAGGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGGTGATTGCTGCTTCGCTGGCGCTGCCGGAAAt > 1:302844/1‑274 (MQ=255) gTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGAACTCAACAACACCGGGTTTATTAGCGGGTTTGTCAACATGTTAGCCGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCATCGATGGTGATGGTGGCGTTGTGTGATGTGTTTTATCTAACGGACTACTTGTTCGACAGCGCCAAGGCGTATACCTACGCTCTCGCAGTGATTCAGATTGCTGCTGAGCTGGCGATGGCGGAAATc > 4:400247/1‑275 (MQ=255) gggACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATTTACTGCGCTACTTTTTCGCAAGCGCCACGGCGTATCCTTCCGCTCTATTCGCGATGTTGATGCCTGCTGCGCTTGCGATGCCGAACATCCCg > 4:605407/1‑275 (MQ=255) 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gTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGAGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGATACTTTTTCGCCATCGCCACGGCGTATACCTCCCCCTCCGCCCCGATGATGATTGCTGCTGCGCCGGCGATTCCGGAAATCCCGCTTCCGGtttt > 3:422434/1‑275 (MQ=255) gTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGATGGCCTCGCTTATCACCATCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTGTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGAGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGtt < 2:558543/275‑1 (MQ=255) aGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTGTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCTATGCCGGAAACCCCGCTGCCGGTGTTCTGc > 4:598696/1‑276 (MQ=255) taataaAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGc < 1:564135/274‑1 (MQ=255) taaAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTACACCTCCGCTCTCGCACCGATGATTATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCCCCCGGTGTTCCGCCTGa > 3:57293/1‑275 (MQ=255) aGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtgg > 3:12611/1‑275 (MQ=255) 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cgTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTGTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCTGCTCTCGCACCCATCATTATTGCTCCCCCGCTGGCGTGGCCCGACATCCCGCTGCCGGTGTGCTCCCTGAtggtctgcg > 4:27790/1‑271 (MQ=255) cgTGGAACGTTTTCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTAGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCCCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTTGTGATGCCGGACATCCCGCCGCCGGCGTTCTGCCGTAtggtgggtt > 4:310771/1‑275 (MQ=255) ttttCTTCTGGCTGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAAtt < 1:471312/275‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |